Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  32  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10862073--10862100
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0
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0
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0
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1.56
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2.0
28
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10
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2
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1.11
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0
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28
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18
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33
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2.1
18
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5
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2.0
46
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1.54
10882083--10882137
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1.8
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1
277
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4.9
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10
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28
21
26
1.99
10899812--10899941
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4.8
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172
23
29
21
26
1.99
10899792--10899966
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3.1
54
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4
152
22
28
20
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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21
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1.99
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1.9
82
94
0
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16
17
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1.91
10912195--10912236
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0
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1.9
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2.0
39
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0
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0
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6
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338
2.0
338
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20
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2
10
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16
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11
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2
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1.02
10948242--10948285
22
2.0
23
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4
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4
1.14
10948236--10948328
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115
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2
18
3
1.02
10948250--10948318
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1.06
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2.5
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19
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2.0
23
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110
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2.3
29
90
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102
27
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18
39
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2.0
296
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1
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2.1
103
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16
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2.3
27
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16
17
29
1.92
10981541--10981579
14
3.0
13
82
10
53
61
7
12
17
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
22
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1.44
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24
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0
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63
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100
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14
14
1.82
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36
2.0
36
97
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30
17
15
36
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26
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2
168
34
4
23
37
1.75
11018982--11019031
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2.4
21
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1.94
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0
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19
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4
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1.75
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2.2
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1.50
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12
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19
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1.17
11061262--11062384
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2.0
566
96
0
2095
27
12
17
43
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11067408--11067454
24
2.0
24
91
0
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29
12
23
1.92
11067418--11067480
24
2.6
24
89
0
90
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34
14
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1.91
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3
47
1.62
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25
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0
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1.99
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1
147
30
15
24
29
1.96
11073968--11074017
24
2.1
24
81
7
57
36
2
0
62
1.07
11074034--11074128
40
2.4
41
83
3
113
24
1
9
65
1.29
11075841--11075876
18
2.0
18
94
0
63
16
30
11
41
1.83
11078097--11078131
18
1.9
18
94
0
61
20
42
25
11
1.85
11081271--11081295
9
2.8
9
100
0
50
88
0
0
12
0.53
11085578--11085602
5
5.0
5
100
0
50
60
40
0
0
0.97
11085639--11085666
12
2.3
12
100
0
56
50
0
14
35
1.43
11085903--11085964
30
2.0
31
84
9
83
56
1
1
40
1.19
11087356--11087386
12
2.6
12
89
0
53
38
19
25
16
1.92
11088699--11088761
33
1.9
32
84
15
85
55
6
0
38
1.25
11095136--11095173
6
6.3
6
87
0
58
34
50
2
13
1.55
11096728--11096797
24
3.0
24
87
6
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38
14
4
42
1.65
11096741--11096797
24
2.4
24
96
0
105
42
14
3
40
1.62
11107181--11107220
20
2.0
20
95
0
71
42
10
22
25
1.84
11108450--11108573
64
1.9
64
88
0
185
31
16
13
38
1.87
11108678--11109016
178
1.9
178
89
1
527
31
18
21
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11108960--11109101
44
3.2
44
85
5
182
32
18
23
26
1.97
11117709--11118018
127
2.4
127
98
0
593
26
14
20
39
1.91
11127848--11127901
12
5.1
10
82
15
56
66
0
5
27
1.13
11127859--11127901
19
2.1
21
87
8
63
67
0
2
30
1.03
11127859--11127902
10
4.7
9
88
5
52
65
0
2
31
1.05
11127919--11128021
40
2.6
40
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6
113
57
1
5
34
1.34
11128137--11128174
14
2.7
14
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8
51
55
0
0
44
0.99
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16
2.3
17
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64
2
5
28
1.28
11130684--11130744
25
2.4
25
83
8
61
6
26
0
67
1.15
11130713--11130752
21
1.9
21
85
10
55
7
32
2
57
1.40
11131327--11131392
31
2.1
32
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5
107
63
0
10
25
1.26
11133453--11133628
65
2.7
65
86
1
253
28
9
5
56
1.53
11140888--11141034
42
3.3
43
87
8
190
29
28
13
28
1.94
11140941--11141077
49
2.9
48
89
4
188
31
28
12
27
1.93
11140956--11141120
47
3.5
47
83
3
161
30
27
14
27
1.95
11145754--11145826
30
2.4
30
88
0
110
30
13
23
32
1.93
11147180--11147222
15
2.7
16
78
10
52
65
0
9
25
1.22
11150316--11150367
20
2.7
19
79
5
52
34
3
5
55
1.42
11150316--11150397
9
8.8
9
71
17
51
34
4
4
56
1.42
11150893--11151039
71
2.1
70
83
7
181
31
10
8
48
1.67
11151309--11151338
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
11152196--11152382
51
3.7
51
89
0
257
38
6
13
41
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11152233--11152311
22
3.3
22
70
21
68
43
3
13
39
1.63
11152255--11152313
29
2.0
29
83
6
75
44
3
11
40
1.58
11154366--11154402
19
1.9
19
88
0
56
56
0
37
5
1.22
11163855--11163964
26
4.2
25
93
4
175
37
23
4
34
1.75
11170988--11171036
24
2.0
24
96
0
89
38
22
18
20
1.93
11172374--11172489
51
2.3
51
87
4
171
47
6
19
25
1.74
11172471--11172496
13
2.0
13
100
0
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0
15
15
1.20
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27
1.71
11173093--11173266
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2.0
86
92
0
285
28
20
25
25
1.99
11175038--11175111
21
3.4
21
70
15
60
63
2
4
29
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343