Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  20  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6920402--6920489
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6934806--6934870
9
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44
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2
336
34
19
18
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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328
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19
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2.2
134
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1.95
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32
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2.7
40
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15
27
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3
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0
0
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15
76
17
50
15
11
17
54
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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0
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1
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0
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1.48
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15
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22
1.95
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19
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6
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14
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10
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24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7143655--7143763
48
2.3
47
83
10
132
35
9
4
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2.4
18
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0
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126
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1
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19
19
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1.96
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20
3.6
19
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21
63
44
18
0
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50
29
0
20
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13
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1
1
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0
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0
2
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0.98
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13
2.2
14
94
5
53
40
13
0
46
1.43
7157041--7157081
14
2.9
14
85
14
57
43
2
0
53
1.13
7161823--7161873
26
2.0
26
84
3
68
64
3
0
31
1.11
7161835--7161883
26
2.0
24
88
8
71
63
6
0
30
1.19
7181289--7181333
22
2.0
22
95
0
81
46
22
11
20
1.81
7184703--7184875
46
3.8
44
78
14
147
28
20
28
21
1.98
7184753--7184915
46
3.6
46
80
12
178
28
19
28
23
1.98
7185942--7186006
28
2.3
28
89
0
94
20
23
38
18
1.93
7190019--7190081
27
2.3
27
88
0
99
33
17
1
47
1.57
7189987--7190080
13
7.0
13
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14
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30
18
2
48
1.59
7189990--7190080
40
2.2
40
84
5
112
31
17
2
48
1.59
7193186--7193245
17
3.5
17
72
21
54
63
0
1
35
1.05
7193730--7193871
17
8.5
17
76
17
131
37
13
11
38
1.80
7193730--7193871
35
4.3
35
77
19
169
37
13
11
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7193769--7193817
25
2.0
25
100
0
98
36
8
14
40
1.75
7193732--7193853
60
2.0
61
95
3
219
37
11
12
38
1.79
7193751--7193838
43
2.0
43
89
4
133
38
11
12
37
1.79
7193730--7193880
19
7.9
19
77
16
134
37
13
10
37
1.80
7201114--7201230
57
2.1
57
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0
162
41
14
14
29
1.86
7203165--7203242
36
2.2
36
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0
147
52
8
11
26
1.67
7203505--7203561
27
2.1
27
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0
69
68
7
3
21
1.29
7209617--7209654
18
2.1
18
90
0
58
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44
2
10
1.52
7209631--7209655
13
1.9
13
100
0
50
40
48
0
12
1.40
7209680--7209720
6
6.5
6
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10
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78
4
0
17
0.93
7211414--7211472
30
1.9
31
83
10
77
44
3
1
50
1.28
7211854--7211886
16
2.1
16
94
0
57
39
12
3
45
1.57
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40
2.3
39
80
8
98
41
19
18
20
1.90
7213339--7213401
14
4.5
14
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7
56
19
0
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1.49
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7
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7
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15
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16
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1.71
7213375--7213429
21
2.6
21
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5
76
16
5
36
41
1.71
7213455--7213486
15
2.1
15
94
0
55
65
0
6
28
1.16
7213461--7213541
37
2.2
37
97
0
153
56
0
2
40
1.12
7215473--7215551
39
2.0
39
95
0
140
21
11
15
51
1.74
7217015--7217043
10
2.9
10
100
0
58
48
0
20
31
1.50
7217732--7217832
9
10.6
9
74
12
85
47
20
0
30
1.57
7217749--7217808
21
3.0
21
83
7
72
46
23
0
30
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7217765--7217830
30
2.2
30
91
0
105
46
22
1
28
1.61
7217743--7217832
39
2.3
40
78
5
112
45
22
1
31
1.60
7223380--7223425
21
2.2
21
84
7
58
23
19
54
2
1.55
7223720--7223815
43
2.2
43
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7
142
25
19
26
29
1.99
7225265--7225353
29
3.0
29
72
18
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64
3
1
31
1.17
7225246--7225314
20
3.6
19
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14
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63
5
2
27
1.31
7225284--7225341
27
2.1
27
84
15
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3
1
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1.22
7225304--7225353
18
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19
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2
0
34
1.05
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2.1
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4
4
34
1.41
7225269--7225436
10
17.0
10
69
15
66
58
4
2
33
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          337   338   339   340   341   342   343