Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  262  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86498448--86498614
47
3.6
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12
160
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24
1.98
86498444--86498614
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1.8
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1.98
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2
0
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0.89
86515537--86515586
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2.9
17
82
5
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22
2
0
76
0.89
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23
2.6
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10
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1
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86515553--86515596
18
2.4
19
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63
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2
2
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0.93
86515537--86515592
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19
1
1
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0.96
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5
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1.37
86529365--86529417
22
2.3
22
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56
11
0
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1.35
86529337--86529432
42
2.3
42
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12
0
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1.36
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2.1
29
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18
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0
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2.0
21
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35
1.82
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18
18
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0
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2.1
30
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0
108
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12
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26
1.57
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17
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0
0
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2.6
19
77
3
55
58
0
0
42
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86565340--86565411
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1
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1.23
86565363--86565436
10
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11
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1
2
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1.17
86565379--86565411
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1.9
17
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0
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0
0
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0.92
86565300--86565426
68
1.9
69
82
9
163
31
3
3
61
1.30
86565401--86565462
20
3.2
19
74
19
56
24
4
4
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1.31
86573910--86573940
7
4.4
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0
53
19
51
0
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1.47
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2.0
34
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127
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11
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1.79
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46
4.7
45
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22
28
1.99
86577928--86578144
92
2.3
92
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219
21
27
22
28
1.99
86584579--86584620
22
2.0
22
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2.0
39
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24
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2.2
25
96
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1.40
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20
3.1
20
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6
72
50
4
0
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1.23
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31
1.9
31
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47
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30
1.73
86615343--86615381
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2.0
20
85
10
53
20
2
15
61
1.45
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25
2.0
23
84
11
62
41
0
4
54
1.20
86615394--86615434
17
2.4
17
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11
66
46
0
2
51
1.14
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14
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7
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2.1
16
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0
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41
2
20
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2.3
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100
0
50
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28
0
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1.22
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25
2.1
25
85
0
68
36
9
15
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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1.70
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3.6
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10
8
4
76
1.13
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26
2.1
26
100
0
108
11
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3
77
1.09
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3.1
37
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1
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53
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20
20
1.66
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2.0
25
88
8
73
46
26
10
16
1.78
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0
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0
0
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22
22
21
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1.97
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3.0
50
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140
24
22
22
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28
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50
0
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19
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1
1
35
1.16
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20
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0
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0
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100
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1.65
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1.39
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149
26
21
11
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1.86
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211
26
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10
41
1.86
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26
20
10
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1.85
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2.1
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1.91
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18
2.1
18
100
0
74
21
37
16
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86734166--86734213
23
2.1
23
96
0
87
33
16
4
45
1.67
86737555--86737588
17
2.0
18
88
11
54
41
8
0
50
1.34
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15
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1.96
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82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
86745971--86746151
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2.2
81
83
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229
27
15
27
29
1.96
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27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
86754019--86754174
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
86754015--86754195
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
86762054--86762231
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
86762055--86762210
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
86762051--86762231
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
86763727--86763814
33
2.6
34
87
5
101
20
29
28
21
1.98
86763748--86763814
33
2.0
33
97
0
125
23
25
26
23
2.00
86770922--86770981
11
5.5
11
86
4
86
33
13
20
33
1.91
86770915--86770983
22
3.2
21
84
10
86
30
13
20
36
1.90
86773452--86773562
43
2.6
42
78
4
105
28
14
22
34
1.93
86775674--86775728
21
2.7
21
97
2
103
30
21
18
29
1.97
86779289--86779355
22
3.2
22
79
10
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62
1
1
34
1.13
86784609--86784675
35
1.9
35
93
0
116
26
11
17
43
1.84
86788187--86788381
55
3.6
54
84
4
259
22
25
17
34
1.95
86788360--86788481
47
2.6
47
90
0
199
25
22
14
37
1.92
86788344--86788612
47
5.8
45
76
8
157
23
23
17
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86796447--86796537
45
2.0
45
100
0
182
19
8
28
42
1.81
86807304--86807341
19
2.0
19
85
10
51
18
10
0
71
1.14
86822898--86823005
40
2.7
40
88
5
146
21
13
28
36
1.92
86824502--86824553
26
2.0
26
100
0
104
57
19
7
15
1.62
86834293--86834518
72
3.1
72
81
2
249
24
17
26
32
1.97
86843060--86843098
20
2.0
20
89
0
60
33
0
20
46
1.51
86846128--86846338
102
2.1
102
86
1
289
28
19
27
23
1.98
86849389--86849442
15
3.5
15
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16
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53
0
9
37
1.33
86849579--86849670
33
2.7
34
79
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60
2
6
30
1.34
86849615--86849682
34
2.0
34
82
8
84
57
1
5
35
1.32
86849646--86849703
28
2.0
30
86
6
84
62
0
6
31
1.22
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44
3.8
45
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4
175
27
17
19
34
1.95
86854446--86855128
44
15.3
44
70
13
348
31
21
16
31
1.95
86854373--86854945
133
4.3
134
83
3
655
31
21
15
31
1.94
86854469--86855128
89
7.4
88
75
7
443
30
22
15
31
1.95
86858140--86858224
27
3.1
27
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24
70
36
1
24
37
1.64
86858140--86858247
54
2.0
54
98
0
207
38
1
25
34
1.67
86858163--86858247
27
3.1
27
66
24
79
41
2
25
30
1.68
86865501--86865772
40
6.8
40
93
0
463
23
21
28
26
1.99
86875628--86875660
7
4.9
7
96
3
59
0
15
9
75
1.03
86875628--86875665
14
2.9
13
88
11
60
0
15
7
76
1.01
86875696--86875748
16
3.4
16
79
7
56
54
3
1
39
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86878795--86878877
34
2.5
34
86
2
105
28
24
24
22
1.99
86889649--86889828
40
4.6
38
77
8
164
25
28
21
25
1.99
86889649--86889828
78
2.3
80
82
6
215
25
28
21
25
1.99
86897785--86897964
40
4.6
40
82
6
208
24
28
22
25
1.99
86897788--86897964
78
2.2
80
80
9
202
23
28
22
24
1.99
86901811--86901865
28
2.0
27
92
3
92
41
3
12
41
1.60
86902040--86902152
40
2.7
42
82
5
142
23
14
28
34
1.93
86905117--86905208
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27
84
0
103
26
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1.83
86905200--86905363
27
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27
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7
120
41
21
8
28
1.82
86905207--86905362
81
1.9
81
84
5
208
42
19
8
28
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343