Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  24  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7989407--7989481
38
2.0
37
84
5
98
32
1
21
45
1.60
7992283--7992331
21
2.3
22
78
7
55
20
10
10
59
1.59
7993914--7993955
6
7.2
6
82
15
52
16
2
2
78
0.96
7993916--7993955
17
2.3
18
87
12
57
15
2
2
80
0.93
7993914--7993960
23
2.0
23
84
8
60
19
2
2
76
0.99
7997054--7997090
15
2.7
13
84
15
56
21
0
2
75
0.92
7997129--7997182
16
3.3
15
76
16
54
22
3
0
74
0.98
7997108--7997176
26
2.7
25
78
10
77
24
4
0
71
1.05
7997108--7997182
25
3.0
25
76
7
71
24
5
0
70
1.07
7997161--7997216
23
2.5
22
78
18
62
12
8
1
76
1.08
7997161--7997214
22
2.4
22
84
9
65
11
9
1
77
1.06
8008880--8008934
27
2.0
27
89
0
83
12
18
27
41
1.86
8009100--8009134
3
11.3
3
93
6
61
65
0
0
34
0.93
8019030--8019179
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
8019054--8019237
67
2.8
64
76
8
185
30
17
29
22
1.97
8030525--8030573
21
2.3
22
82
7
64
20
10
12
57
1.64
8031324--8031369
23
2.0
23
100
0
92
26
21
17
34
1.95
8050080--8050112
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
8055028--8055072
21
2.2
20
84
4
54
17
24
26
31
1.97
8057656--8057688
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
8058105--8058140
14
2.6
14
90
0
63
55
13
11
19
1.68
8063855--8063959
52
2.0
52
98
0
201
32
17
27
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8066928--8067092
46
3.6
46
72
15
151
23
19
26
30
1.98
8066921--8067146
93
2.4
93
89
1
337
24
19
25
30
1.98
8066974--8067129
47
3.4
45
70
12
136
26
18
25
30
1.98
8072920--8073141
47
4.7
47
80
10
185
23
20
27
27
1.99
8072969--8073087
47
2.5
47
91
0
193
26
18
26
28
1.98
8074156--8074226
25
2.8
25
89
4
99
26
23
23
25
2.00
8081759--8081810
25
2.1
25
92
3
88
26
19
21
32
1.97
8081766--8081825
25
2.4
25
91
0
93
28
21
26
23
1.99
8081881--8081915
10
3.4
10
88
7
52
31
20
17
31
1.95
8081871--8081928
21
2.8
20
79
7
62
36
15
13
34
1.87
8093088--8093139
20
2.7
19
80
11
61
73
3
1
21
1.10
8094244--8094286
18
2.4
18
88
0
59
69
4
13
11
1.33
8101065--8101122
6
9.7
6
100
0
116
15
0
0
84
0.62
8117543--8117576
15
2.3
15
90
10
52
67
0
11
20
1.21
8118201--8118238
18
2.1
19
85
5
51
47
2
2
47
1.30
8119377--8119672
154
1.9
154
85
2
407
32
18
10
37
1.86
8122658--8122812
42
3.7
42
90
3
233
27
25
14
31
1.95
8122658--8122856
42
4.7
42
84
8
208
28
25
14
31
1.95
8122865--8122893
7
4.1
7
100
0
58
13
27
13
44
1.82
8122892--8122978
31
2.8
31
89
0
138
25
27
19
27
1.99
8122954--8123130
50
3.5
50
89
3
266
26
21
15
36
1.93
8127947--8128000
26
2.0
27
92
3
92
29
3
22
44
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8134419--8134450
14
2.3
14
94
0
55
9
3
0
87
0.64
8135302--8135342
17
2.4
17
87
4
55
17
9
2
70
1.25
8135362--8135407
21
2.2
21
84
0
56
21
4
6
67
1.32
8135720--8135769
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
64
1.18
8136143--8136191
26
2.0
24
84
8
62
63
8
0
28
1.23
8138693--8138717
2
12.5
2
100
0
50
0
48
0
52
1.00
8147416--8147449
14
2.6
13
90
9
52
52
0
2
44
1.16
8150925--8151062
69
2.0
68
97
1
258
23
4
18
54
1.61
8158793--8158951
3
54.0
3
68
16
75
27
5
3
64
1.31
8158795--8158828
17
1.9
18
94
5
61
29
5
0
64
1.17
8162506--8162793
129
2.2
132
82
7
363
32
17
20
30
1.95
8164898--8164944
23
2.2
22
85
11
62
8
19
53
19
1.70
8172000--8172106
43
2.5
44
81
14
118
33
26
17
22
1.96
8181038--8181122
41
2.0
42
97
2
163
41
7
2
49
1.43
8182363--8182473
54
2.1
54
91
3
179
23
41
4
30
1.74
8191471--8191505
18
1.9
18
94
0
61
54
0
5
40
1.24
8195041--8195085
18
2.5
18
100
0
90
42
0
4
53
1.21
8195228--8195270
21
2.0
21
86
8
61
53
2
2
41
1.26
8197330--8197372
22
1.9
23
85
4
61
41
2
6
48
1.43
8204007--8204042
9
4.0
9
85
0
54
55
0
0
44
0.99
8205437--8205519
41
2.0
41
97
0
157
48
10
14
26
1.77
8208062--8208101
12
3.5
11
83
10
53
70
0
30
0
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8208067--8208107
19
2.2
20
91
8
68
70
0
29
0
0.87
8209230--8209269
21
2.0
19
85
9
53
40
0
17
42
1.49
8209457--8209481
12
2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
8209507--8209546
6
6.7
6
88
0
53
17
20
15
47
1.83
8209715--8209905
18
10.6
18
75
10
104
35
12
15
37
1.84
8209704--8209887
36
5.1
36
74
12
148
37
11
14
35
1.83
8209704--8209905
72
2.8
72
79
8
182
36
11
14
36
1.84
8209715--8209905
54
3.5
53
75
11
165
35
12
15
37
1.84
8209944--8209978
18
1.9
18
88
0
52
34
14
17
34
1.90
8225373--8225785
44
9.5
43
72
11
231
31
20
21
27
1.98
8225636--8225797
87
1.9
87
84
2
218
29
20
24
25
1.99
8225372--8225901
214
2.5
213
83
6
550
31
19
22
26
1.98
8228999--8229071
25
2.9
25
83
0
92
28
26
23
21
1.99
8229003--8229082
25
3.2
25
80
7
65
30
26
20
23
1.98
8231369--8231486
47
2.5
46
80
8
132
31
20
12
35
1.90
8248249--8248305
27
2.1
27
86
0
78
64
1
5
28
1.25
8253945--8254006
18
3.5
17
74
10
52
25
3
1
69
1.13
8254855--8255332
245
1.9
247
90
3
768
31
18
18
31
1.95
8260767--8260942
46
3.8
46
75
12
180
21
21
28
28
1.98
8260763--8260935
93
1.9
93
91
0
283
21
21
28
27
1.99
8263915--8263971
30
1.9
29
89
3
87
12
14
15
57
1.65
8266756--8266872
47
2.5
47
98
0
225
22
17
29
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8272998--8273108
54
2.1
54
94
3
199
45
12
8
34
1.72
8274296--8274334
20
2.0
20
90
5
62
61
0
7
30
1.24
8275455--8275676
99
2.2
98
83
2
266
33
18
10
36
1.86
8276164--8276208
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
8277992--8278444
46
9.8
46
90
1
631
41
14
24
19
1.89
8278002--8278444
138
3.2
138
92
0
717
41
14
23
19
1.89
8283594--8283681
39
2.3
38
84
5
113
29
21
27
21
1.99
8283903--8283928
2
13.0
2
100
0
52
0
0
50
50
1.00
8291785--8291889
39
2.7
39
95
0
183
29
21
24
23
1.99
8298909--8299013
39
2.7
39
95
0
183
29
21
25
22
1.99
8298907--8299033
39
3.3
38
86
5
173
29
21
26
22
1.99
8307117--8307221
39
2.7
39
96
0
192
30
21
24
22
1.99
8308998--8309215
46
4.7
46
93
1
339
22
24
14
39
1.91
8312669--8312915
134
1.8
134
83
1
325
29
16
14
38
1.89
8313379--8313562
99
1.9
99
81
2
226
33
20
8
38
1.82
8312998--8313964
536
1.8
537
83
2
1291
33
17
15
33
1.92
8315590--8316955
571
2.4
569
81
4
1539
31
17
15
35
1.92
8316530--8317516
536
1.8
537
83
1
1327
33
17
15
33
1.91
8319424--8319460
11
3.1
12
88
11
58
48
0
51
0
1.00
8319953--8319977
8
3.1
8
100
0
50
24
12
52
12
1.72
8320489--8320590
46
2.2
46
82
0
123
28
24
20
26
1.99
8320321--8320758
229
1.9
229
89
0
687
28
23
19
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8320834--8321570
46
16.4
45
64
11
175
27
24
21
26
1.99
8320809--8321637
270
3.1
268
96
1
1541
28
23
21
26
1.99
8320809--8321637
404
2.1
404
98
0
1604
28
23
21
26
1.99
8320809--8321637
134
6.2
134
97
0
1532
28
23
21
26
1.99
8324601--8325450
134
6.3
134
96
0
1549
26
21
24
28
1.99
8324601--8325450
270
3.2
268
96
1
1549
26
21
24
28
1.99
8324668--8325404
46
16.4
45
63
11
175
26
21
24
27
1.99
8324591--8325429
404
2.1
404
98
0
1617
26
21
23
28
1.99
8325645--8325749
46
2.3
46
81
0
129
25
21
23
28
1.99
8325480--8325917
229
1.9
229
89
0
687
29
19
23
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343