Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  343  ( 41150 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3271588--3271636
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2.1
24
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3
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0
0
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1
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26
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1
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2
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0
0
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6
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19
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0.98
3298379--3298420
9
4.6
9
85
5
57
71
0
2
26
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2.1
20
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0
0
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17
17
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2.9
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19
17
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22
2.3
22
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10
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2
2
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13
2.5
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4
52
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5
2
5
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84
2.0
84
90
0
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14
10
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2.2
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100
0
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2.3
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2
5
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2.0
48
100
0
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26
2.0
25
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30
10
14
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22
1.9
21
85
10
55
30
2
20
47
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3344133--3344184
22
2.3
23
87
12
74
26
3
9
59
1.46
3344139--3344186
21
2.3
21
86
13
64
29
2
8
60
1.37
3344285--3344326
22
2.0
20
86
9
57
47
2
0
50
1.14
3344958--3344998
22
1.9
21
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5
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36
17
9
36
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2.0
17
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0
0
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5
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1
0
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1.10
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12
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55
1
0
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1.10
3349222--3349277
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1
0
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19
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2.8
14
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16
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27
25
0
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1.52
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30
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19
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1.98
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5
12.0
5
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13
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1
0
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1.09
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12
4.4
12
80
17
67
56
1
0
41
1.10
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22
3.0
21
83
9
83
55
1
0
42
1.09
3361677--3361710
3
11.3
3
87
0
50
0
32
35
32
1.58
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15
1.9
15
100
0
58
0
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1.56
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15
2.7
15
88
0
53
37
2
55
5
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21
2.0
21
90
0
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1.11
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24
2.0
24
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0
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18
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34
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2.0
61
98
1
237
10
21
18
49
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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0
0
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0.94
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6.0
6
93
0
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27
36
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1.93
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14
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84
15
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0
0
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0.90
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9
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21.9
41
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0
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20
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15
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0
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51
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15
222
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8
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12.9
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20
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82
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860
20
17
26
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1.95
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0
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1.48
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43
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1.79
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30
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1.78
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15
7.2
15
67
12
78
44
7
22
25
1.79
3397203--3397317
30
3.8
30
95
0
194
45
6
22
25
1.77
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0
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0
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0
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51
26
18
2
52
1.58
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2.0
48
97
0
181
44
9
15
30
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3423052--3423202
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
3430556--3430706
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2.8
53
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27
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22
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0
7
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24
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0
100
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18
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15
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0
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52
7
0
40
1.28
3460507--3460549
19
2.2
20
87
8
61
39
30
9
20
1.84
3473453--3473510
22
2.6
22
86
13
75
58
1
1
37
1.18
3484463--3484487
5
5.0
5
100
0
50
60
0
40
0
0.97
3494093--3494127
17
2.0
18
88
5
54
42
0
5
51
1.25
3494937--3494979
16
2.8
15
79
6
59
46
2
0
51
1.13
3494937--3494987
16
3.2
16
73
13
52
49
1
0
49
1.12
3494983--3495059
25
2.9
25
78
21
70
54
2
1
41
1.22
3495013--3495079
25
2.9
23
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20
59
56
0
0
43
0.99
3499229--3499278
26
2.0
26
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7
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28
2
2
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1.12
3499260--3499315
29
2.0
28
85
3
76
25
8
3
62
1.41
3503280--3503313
2
18.0
2
88
11
54
47
0
0
52
1.00
3504871--3504926
19
3.1
17
75
14
58
60
0
7
32
1.24
3508667--3508704
17
2.3
17
86
4
51
47
0
2
50
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3513621--3513665
14
3.1
14
90
3
63
20
48
11
20
1.79
3513619--3513673
15
3.6
15
80
16
60
18
45
14
21
1.85
3514644--3514692
21
2.3
22
75
10
57
38
4
8
48
1.52
3517225--3517249
13
1.9
13
100
0
50
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0
0
40
0.97
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15
3.6
15
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9
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31
7
1
59
1.36
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22
2.2
23
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7
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36
6
18
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1.76
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15
1.9
15
100
0
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20
13
17
48
1.81
3558733--3558781
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1.9
26
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40
2
4
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1.32
3558767--3558831
34
1.9
34
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105
29
6
4
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1.41
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1
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29
23
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32
1.95
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44
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43
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212
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22
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3.0
10
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0
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3
0
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420
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0
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38
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16
29
1.90
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2.0
55
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3
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3
1
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1.23
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60
2.0
60
100
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1.86
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3
15.7
3
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31
0
2
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1.04
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6
6.7
6
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0
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1.84
3599342--3599384
12
3.6
12
90
0
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16
11
39
32
1.84
3599342--3599384
18
2.4
18
84
0
59
16
11
39
32
1.84
3606929--3606963
11
3.1
11
84
8
52
28
0
2
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1.04
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16
1.9
16
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0
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0
0
35
0.94
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23
2.6
21
83
11
67
60
5
0
34
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3618896--3619066
25
6.7
25
67
12
89
61
2
7
28
1.34
3619043--3619067
4
6.2
4
100
0
50
76
0
0
24
0.80
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15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
3619135--3619221
44
2.0
44
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13
108
65
0
8
26
1.20
3619133--3619219
15
6.0
14
75
13
61
65
0
8
26
1.20
3625033--3625065
10
3.3
10
100
0
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0
0
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4.1
39
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0
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24
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33
90
0
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1
1
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48
100
0
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1.82
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23
2.0
23
100
0
90
55
0
17
26
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343