Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  47  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15533013--15533092
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0
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60
0
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0
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28
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2.3
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0
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4.2
26
97
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26
36
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.1
26
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15635112--15635191
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2.0
41
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13
22
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1.92
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27
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26
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2.8
26
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4
85
36
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31
1.86
15641988--15642128
27
5.2
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22
21
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1.95
15641988--15642128
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2
210
19
22
21
36
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15641988--15642146
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3.0
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26
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2
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2.2
16
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26
23
23
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2.1
13
100
0
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37
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3.1
8
100
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12
12
40
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131
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18
22
32
1.97
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1.99
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2.0
15
93
0
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43
20
16
20
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
44
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26
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1.92
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30
1.9
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82
29
24
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1.85
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2.2
25
90
0
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21
26
19
32
1.97
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2.3
25
84
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24
24
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2.2
18
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2
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12
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0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15729597--15729644
24
2.1
23
88
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71
29
2
16
52
1.56
15741323--15741372
20
2.3
20
83
10
55
40
2
4
54
1.31
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16
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36
0
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0
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20
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53
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1.29
15741687--15741745
22
2.8
21
75
10
66
62
0
1
35
1.05
15742686--15742725
20
2.0
21
85
5
55
57
0
5
37
1.21
15742808--15742942
71
1.9
72
89
1
209
51
5
2
40
1.36
15742941--15742978
20
1.9
20
89
10
60
47
0
0
52
1.00
15743008--15743036
9
3.0
10
90
10
51
72
0
0
27
0.85
15743008--15743046
19
2.1
19
90
0
60
69
0
0
30
0.89
15742999--15743063
17
3.7
17
78
8
67
60
0
3
36
1.13
15745282--15745348
30
2.2
30
83
0
89
26
19
19
34
1.96
15747238--15747286
19
2.3
21
86
13
66
55
0
0
44
0.99
15747353--15747400
19
2.5
19
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60
66
4
2
27
1.21
15747396--15747456
29
2.1
29
82
14
74
60
3
0
36
1.13
15747480--15747548
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3.3
21
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11
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53
0
0
46
1.00
15747392--15747553
20
7.9
19
68
19
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3
1
40
1.24
15747493--15747555
22
3.0
22
86
9
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58
1
0
39
1.07
15747511--15747590
35
2.2
34
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8
115
58
1
0
40
1.06
15747544--15747599
22
2.4
24
85
8
80
55
5
0
39
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15747544--15747608
23
2.9
22
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11
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52
6
0
41
1.26
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19
2.6
18
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15
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79
2
4
14
0.97
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5
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5
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0
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0
0
59
0.97
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15
3.4
15
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2
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38
0
10
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1.35
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4.0
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15754896--15754934
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2.0
20
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10
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2
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1.52
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2.5
21
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0
97
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24
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1.91
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0
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0
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1.9
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4
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1.76
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2.1
28
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3
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30
23
10
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1.88
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11
2.7
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0
19
0
0.71
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6
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26
14
24
34
1.94
15781137--15781298
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4.0
40
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5
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25
15
25
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1.95
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2.0
20
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1.9
109
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2
358
39
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28
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1.89
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2.0
20
85
10
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48
5
5
41
1.47
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18
2.4
17
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4
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63
0
2
34
1.08
15802353--15802382
13
2.2
14
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66
10
0
23
1.21
15802802--15802902
50
2.0
51
98
1
195
37
16
11
33
1.86
15808282--15808311
14
2.1
14
93
0
51
60
3
0
36
1.14
15810292--15811009
356
2.0
356
91
1
1154
36
18
15
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15816551--15816589
21
1.9
21
89
5
62
10
35
30
23
1.88
15817780--15817840
32
1.9
32
100
0
122
14
37
1
45
1.55
15825510--15825867
46
7.7
45
83
6
362
27
20
29
22
1.98
15828430--15828470
15
2.6
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57
78
0
14
7
0.96
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10
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85
0
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2.0
21
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0
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0
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0
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0
0
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0.90
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3.9
19
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15
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53
0
0
46
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343