Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  199  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65862256--65862293
15
2.5
15
100
0
76
5
26
23
44
1.74
65863084--65863109
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
65877644--65877810
46
3.6
47
75
9
171
28
19
28
23
1.98
65877645--65877851
94
2.2
94
82
5
265
28
19
27
24
1.98
65877871--65878043
49
3.6
49
76
3
172
28
19
27
24
1.98
65887852--65887909
30
1.9
30
85
0
80
39
10
22
27
1.86
65888325--65888372
21
2.3
21
96
0
87
8
29
31
31
1.87
65889710--65889841
46
2.9
46
77
4
140
33
21
18
26
1.97
65891312--65891358
14
3.1
15
79
17
53
48
0
2
48
1.13
65891782--65891820
13
3.1
12
85
10
51
76
5
15
2
1.06
65892633--65892692
24
2.5
22
74
12
57
35
0
20
45
1.51
65893042--65893177
60
2.3
59
86
6
177
17
17
19
45
1.86
65893418--65893466
18
2.8
17
79
14
55
30
12
22
34
1.91
65895680--65895762
41
2.0
41
100
0
166
36
9
28
25
1.88
65901885--65901942
30
1.9
30
96
0
107
44
12
13
29
1.80
65902898--65902988
40
2.3
38
80
7
110
34
30
18
16
1.93
65902908--65902986
40
2.0
40
89
0
122
34
30
17
17
1.94
65913468--65913743
48
5.8
48
87
0
374
23
16
31
28
1.96
65913468--65913743
144
1.9
144
90
1
437
23
16
31
28
1.96
65917112--65917151
19
2.1
19
86
9
55
57
5
2
35
1.34
65918394--65918433
19
2.1
19
90
9
64
57
5
0
37
1.21
65919527--65919664
41
3.4
41
83
4
163
27
15
26
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65921693--65921841
49
3.0
49
72
14
144
30
16
24
28
1.97
65921693--65921873
98
1.9
97
81
5
222
32
17
23
26
1.97
65930440--65930524
42
2.0
42
88
0
125
20
23
21
35
1.96
65933738--65933789
22
2.4
22
90
0
77
63
15
9
11
1.52
65937974--65938044
27
2.5
28
76
13
74
53
2
5
38
1.39
65961249--65961377
46
2.8
46
96
0
231
29
27
21
21
1.99
65961254--65961396
46
3.1
46
75
16
136
28
27
21
22
1.99
65964135--65964187
26
2.0
26
100
0
106
33
16
18
30
1.94
65969860--65969937
38
2.1
38
100
0
156
44
7
7
39
1.62
65969863--65969955
38
2.5
37
89
7
125
44
10
6
38
1.65
65970308--65970348
21
2.0
21
85
9
57
58
4
0
36
1.20
65970363--65970387
11
2.3
11
100
0
50
76
8
0
16
1.02
65970321--65970416
10
9.7
10
69
14
56
65
3
4
27
1.26
65970670--65970733
10
6.5
10
73
8
51
42
1
0
56
1.09
65970669--65970725
21
2.8
20
84
5
78
43
1
0
54
1.10
65972386--65972422
17
2.2
17
100
0
74
32
10
13
43
1.79
65974534--65974617
33
2.6
32
83
5
100
20
26
15
38
1.92
65992956--65993035
41
2.0
41
82
5
99
21
12
21
45
1.84
65996445--65996515
37
1.9
37
91
0
115
28
12
16
42
1.85
66000277--66000450
27
6.4
27
83
4
197
27
14
27
29
1.96
66000278--66000433
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
66008309--66008482
27
6.4
27
83
4
197
27
14
27
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66008310--66008465
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
66018429--66018458
15
1.9
16
93
6
53
16
20
10
53
1.71
66018729--66018789
30
2.0
30
100
0
122
34
26
16
22
1.95
66027762--66027796
18
1.9
18
100
0
70
14
17
11
57
1.66
66028600--66028703
25
4.2
25
86
0
145
13
35
30
20
1.91
66030970--66031029
30
2.0
30
100
0
120
36
23
13
26
1.92
66036784--66036884
34
3.0
34
76
5
96
35
26
9
27
1.88
66041736--66041810
26
2.9
26
84
4
80
29
13
12
45
1.79
66045925--66045972
21
2.3
21
85
3
62
68
0
8
22
1.16
66045934--66045975
11
3.8
11
81
9
50
71
0
7
21
1.09
66049325--66049369
21
2.1
21
87
0
63
48
2
46
2
1.26
66063663--66063702
16
2.7
16
85
11
50
42
0
0
57
0.98
66063669--66063702
11
3.2
11
91
4
52
41
0
0
58
0.98
66063810--66063853
23
1.9
23
81
9
54
45
0
2
52
1.13
66063957--66064016
28
2.1
29
82
14
72
46
1
3
48
1.28
66064137--66064174
3
12.7
3
100
0
76
0
0
31
68
0.90
66064255--66064289
12
2.8
13
86
8
54
77
0
22
0
0.78
66080306--66080962
105
6.4
99
75
9
414
35
15
17
31
1.92
66080563--66080990
105
4.1
105
83
2
538
34
15
17
32
1.92
66080306--66080990
210
3.3
209
80
6
761
35
15
17
31
1.91
66086771--66086813
19
2.3
19
88
4
61
41
9
6
41
1.64
66094119--66094168
21
2.4
21
80
3
57
66
4
2
28
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66096703--66096730
12
2.3
12
100
0
56
39
14
0
46
1.44
66099191--66099215
12
2.1
12
100
0
50
0
16
0
84
0.63
66099597--66099632
3
12.0
3
100
0
72
66
0
0
33
0.92
66100316--66100345
15
2.0
15
93
0
51
53
10
0
36
1.35
66103269--66103354
42
2.0
43
84
6
113
24
24
36
15
1.94
66105336--66105444
54
2.0
53
91
1
173
34
3
9
52
1.51
66109589--66109739
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
66114170--66114320
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
66118744--66118894
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
66128665--66128744
3
26.3
3
72
20
53
65
1
3
30
1.18
66128663--66128741
12
6.5
12
74
12
72
64
1
3
30
1.19
66129190--66129239
22
2.3
22
96
0
91
12
8
52
28
1.66
66129220--66129309
38
2.4
38
96
0
162
23
12
47
16
1.80
66129309--66129334
4
6.5
4
100
0
52
23
0
0
76
0.78
66129560--66130407
44
19.3
44
77
8
694
26
25
17
30
1.97
66129559--66130301
132
5.6
132
80
7
771
26
25
18
30
1.98
66129559--66130349
176
4.5
175
85
4
846
26
25
18
30
1.98
66130465--66130651
68
2.8
68
89
1
268
26
21
22
29
1.99
66130848--66130966
61
1.9
64
89
8
192
36
13
16
32
1.88
66132117--66132163
12
3.4
14
78
21
55
4
2
10
82
0.88
66134945--66134991
19
2.5
20
89
6
71
42
8
21
27
1.81
66137706--66137751
16
2.6
17
86
10
58
23
8
6
60
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66140076--66140123
24
2.0
24
100
0
96
41
12
8
37
1.73
66145102--66145514
205
2.0
205
97
0
772
40
7
18
33
1.78
66145635--66145782
51
2.9
51
86
1
199
28
12
25
33
1.93
66145642--66145858
50
4.3
51
84
4
253
27
12
26
33
1.93
66145642--66145858
99
2.2
102
81
5
264
27
12
26
33
1.93
66145800--66145921
42
2.9
41
87
2
154
29
13
25
31
1.93
66148886--66148924
10
4.0
10
86
6
62
66
0
0
33
0.92
66148887--66148923
19
1.9
19
100
0
74
64
0
0
35
0.94
66151559--66151615
19
3.0
19
73
14
55
22
3
3
70
1.18
66154639--66154669
16
2.0
15
93
6
53
54
0
0
45
0.99
66154634--66154721
44
1.9
47
86
6
128
42
3
5
48
1.43
66157311--66157350
22
1.9
21
85
10
55
55
0
0
45
0.99
66166258--66166297
17
2.4
17
83
8
55
60
0
2
37
1.11
66169221--66169253
15
2.2
15
94
0
57
63
0
6
30
1.18
66169238--66169285
25
2.0
25
88
12
73
70
2
10
16
1.24
66173789--66173904
61
1.9
58
82
5
142
41
3
5
50
1.42
66174830--66174888
24
2.5
25
76
20
72
33
0
5
61
1.18
66186652--66186709
29
2.0
29
83
16
75
50
1
3
44
1.29
66191302--66191356
25
2.2
25
83
3
65
40
1
9
49
1.45
66193552--66193585
17
2.0
17
94
0
59
61
0
0
38
0.96
66194016--66194063
20
2.4
20
85
0
60
52
8
8
31
1.61
66198342--66198480
48
2.9
48
86
2
181
25
15
30
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66198450--66198698
42
5.6
41
79
6
147
27
16
26
29
1.97
66198486--66198650
42
3.9
42
87
0
186
27
14
26
31
1.95
66198518--66198738
42
5.1
42
76
7
165
28
18
25
27
1.98
66205766--66205957
92
2.1
92
95
0
339
43
21
4
30
1.73
66206024--66206058
10
3.4
10
84
7
52
2
11
8
77
1.10
66210645--66210687
18
2.5
16
81
11
50
76
4
2
16
1.05
66215651--66215779
43
3.0
45
84
4
149
34
25
15
24
1.94
66223211--66223265
3
18.3
3
100
0
110
0
0
32
67
0.91
66231969--66232097
55
2.3
55
85
5
163
13
27
27
31
1.94
66232010--66232119
55
2.0
54
82
3
132
17
30
27
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343