Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  57  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18377144--18377168
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2.0
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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9
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27
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144
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2
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23
71
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4
6
32
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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1.48
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24
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23
83
10
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59
0
3
36
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18515464--18515494
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0
0
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219
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23
15
35
1.95
18527767--18528461
206
3.4
207
90
2
1085
28
21
18
31
1.97
18540524--18540585
18
3.5
17
70
16
54
61
4
0
33
1.17
18540519--18540581
15
4.3
14
74
9
54
63
4
0
31
1.15
18540645--18540698
20
2.8
18
75
22
56
66
1
3
27
1.19
18540648--18540698
18
2.6
19
81
12
59
66
1
3
27
1.20
18540707--18540768
16
3.8
16
71
12
54
61
3
3
32
1.28
18542146--18542221
5
16.0
5
81
10
79
0
3
18
77
0.92
18542148--18542223
28
2.7
28
93
0
134
0
5
18
76
0.97
18544043--18544073
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
18544040--18544079
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
18544304--18544519
55
4.0
54
79
6
222
23
24
16
36
1.94
18544312--18544512
108
1.8
110
87
4
300
23
23
16
35
1.95
18550093--18550122
14
2.1
14
93
0
51
56
13
10
20
1.65
18556015--18556053
19
2.1
19
100
0
78
41
15
5
38
1.69
18557888--18557955
5
13.6
5
84
6
93
38
2
17
41
1.65
18557880--18557955
15
5.1
15
86
0
80
39
3
17
39
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18564501--18564535
16
2.2
16
100
0
70
45
11
5
37
1.64
18570549--18570574
5
5.2
5
100
0
52
80
0
19
0
0.71
18571934--18572207
46
6.0
46
89
0
379
22
24
13
40
1.89
18572110--18572185
25
3.2
25
63
21
63
23
22
11
42
1.87
18572135--18572206
21
3.2
21
65
14
54
26
23
9
40
1.85
18573589--18573635
11
4.2
11
76
15
51
12
31
0
55
1.38
18574049--18574088
20
2.1
18
86
9
53
45
7
0
47
1.31
18579494--18579716
39
5.7
40
82
8
242
25
27
21
25
1.99
18579648--18579725
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
18587373--18587596
40
5.7
40
82
7
233
25
28
20
25
1.99
18587373--18587596
79
2.8
78
80
6
245
25
28
20
25
1.99
18587528--18587605
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
18592777--18592834
28
2.1
28
96
0
107
36
27
6
29
1.83
18619797--18619848
25
2.1
25
100
0
104
23
28
3
44
1.71
18635413--18635442
6
4.8
6
95
4
51
13
0
0
86
0.57
18651623--18651768
40
3.7
40
89
1
204
26
28
22
22
1.99
18654920--18654950
16
2.0
16
93
6
55
19
6
19
54
1.65
18665612--18665732
45
2.8
44
81
8
124
21
28
24
25
1.99
18666068--18666286
43
5.1
43
91
1
334
30
32
23
13
1.93
18670464--18670525
31
2.0
31
96
0
115
20
22
22
33
1.97
18687514--18687560
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
18687821--18688121
46
6.7
46
87
6
413
21
25
15
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18688000--18688159
38
4.0
38
86
12
239
23
25
17
33
1.96
18687954--18688170
84
2.6
84
98
0
416
23
24
16
34
1.95
18690298--18690380
31
2.7
32
78
12
93
55
4
1
38
1.29
18693575--18693664
42
2.1
42
84
9
121
30
26
14
28
1.95
18702169--18702225
9
6.3
9
81
0
51
19
3
43
33
1.68
18703306--18703336
4
7.5
4
92
7
53
74
0
0
25
0.82
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12
12.1
12
66
27
58
34
4
0
60
1.23
18704697--18704806
20
5.5
21
73
21
76
35
5
0
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1.21
18704686--18704806
13
9.1
13
69
24
58
34
4
0
60
1.18
18704714--18704834
18
6.3
18
70
24
72
32
4
0
61
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343