Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  5  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1721401--1721513
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2.0
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25
16
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.0
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2.3
19
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2.0
28
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28
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14
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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52
84
0
0
15
0.62
1949185--1949223
16
2.5
16
83
4
53
23
2
0
74
0.94
1949715--1949756
19
2.2
19
86
0
57
14
2
7
76
1.10
1951783--1951826
23
1.9
23
85
0
61
77
4
2
15
1.04
1959341--1959398
30
2.0
29
82
3
71
51
0
1
46
1.11
1960268--1960609
131
2.6
133
84
5
410
37
11
12
38
1.79
1960971--1961328
178
2.0
178
100
0
716
38
15
11
34
1.84
1966007--1966036
16
1.9
15
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23
0
23
53
1.46
1968205--1968236
16
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0
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1.65
1980683--1980709
11
2.5
11
100
0
54
22
7
18
51
1.70
1982108--1982302
93
2.1
92
88
4
286
44
4
4
47
1.41
1982335--1982368
17
2.0
17
94
0
59
44
5
0
50
1.26
1982335--1982373
17
2.4
16
87
8
53
43
5
0
51
1.24
1982339--1982378
17
2.3
18
83
12
57
47
5
0
47
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1982458--1982592
15
8.9
15
67
24
70
42
2
3
51
1.32
1982334--1982552
120
1.8
119
89
6
345
40
3
5
50
1.44
1982560--1982601
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
1982551--1982848
154
1.9
156
95
2
537
47
5
3
44
1.40
1982701--1982735
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
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16
3.1
16
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0
71
30
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0
34
1.58
1982986--1983037
16
3.2
16
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5
70
34
32
0
32
1.58
1983614--1983652
3
13.0
3
100
0
78
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0
33
33
1.58
1983741--1983782
18
2.3
18
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0
57
2
21
30
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1.65
1992668--1992703
16
2.3
16
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4
56
41
11
19
27
1.85
1998250--1998280
14
2.2
14
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0
53
51
3
0
45
1.17
2001621--2001672
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2.0
26
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3
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67
1
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23
1.27
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24
1.9
24
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0
65
34
8
8
47
1.65
2014219--2014258
20
2.0
20
90
0
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50
12
10
27
1.72
2014207--2014273
34
1.9
35
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3
109
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13
8
31
1.74
2027646--2027681
18
2.1
16
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10
54
44
0
5
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1.25
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33
2.0
33
87
0
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41
6
6
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1.54
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27
2.0
27
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3
70
46
3
1
48
1.31
2037250--2037305
15
4.1
15
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21
50
50
10
0
39
1.37
2038968--2039018
26
1.9
27
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4
77
43
5
0
50
1.26
2040550--2040606
25
2.4
24
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5
98
38
15
7
38
1.75
2048502--2048848
184
1.9
185
84
4
477
36
19
16
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2050942--2051056
56
2.0
58
80
9
130
50
5
0
43
1.30
2054366--2054506
54
2.7
53
78
9
137
25
17
21
36
1.94
2054536--2054708
54
3.2
56
67
16
148
26
19
22
31
1.98
2054525--2054758
108
2.2
108
92
1
380
25
20
23
30
1.98
2054590--2054756
54
3.1
54
67
13
144
25
21
24
28
1.99
2054525--2054803
108
2.6
108
82
6
282
25
21
21
31
1.98
2063352--2063408
14
4.0
14
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4
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40
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18
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10
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12
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0
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2
0
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10
2.6
10
100
0
52
92
0
7
0
0.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343