Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  311  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100965015--100965041
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2.1
13
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0
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15
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1.47
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3
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1.36
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4
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100968244--100968524
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5
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2.1
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2.1
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24
18
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1
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5.3
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1
58
1.33
101001392--101001530
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2.0
71
89
0
215
29
17
22
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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14
2.0
15
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48
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3
1.18
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5.2
22
71
19
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5
1
57
1.33
101004054--101004169
21
5.3
21
73
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33
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1
58
1.33
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20.7
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0
33
0
0.92
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2.1
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96
62
1
36
0
1.04
101015498--101015743
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128
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19
17
31
1.95
101015455--101015918
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18
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1.96
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7
10.6
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21
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30
1.49
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0
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2.5
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17
1.98
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21
2.6
20
83
16
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66
0
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0
0.92
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2.1
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2
236
21
21
24
31
1.98
101031758--101031918
38
4.2
38
83
4
189
21
21
24
31
1.98
101033229--101033460
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7.0
33
82
6
202
29
11
42
16
1.84
101036872--101036934
21
3.2
21
72
21
73
14
0
38
47
1.44
101036890--101036963
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87
14
0
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45
1.45
101036887--101036966
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2.5
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2
97
16
0
38
45
1.47
101036878--101036985
22
4.8
22
71
15
87
14
0
37
47
1.45
101036887--101036988
16
7.1
15
69
21
76
14
0
37
48
1.45
101037001--101037064
26
2.5
26
97
0
119
43
1
15
39
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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124
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16
30
1.91
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27
3.6
27
70
20
87
57
5
4
33
1.39
101040659--101040792
57
2.4
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1
232
52
6
2
37
1.43
101041212--101041246
18
1.9
18
94
0
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40
2
28
28
1.71
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7
7.7
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0
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12
1
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1.50
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2.0
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2
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7
34
1.43
101043117--101043172
20
2.7
21
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1
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1.66
101043110--101043174
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3.0
22
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1
26
33
1.66
101056984--101057244
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5.5
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25
1.97
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2.8
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81
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151
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17
28
26
1.97
101057079--101057244
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3.5
48
81
11
150
28
16
28
26
1.97
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4
48
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101096720--101096757
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1.98
101118534--101118706
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3.7
46
80
13
219
28
28
21
21
1.98
101121090--101121144
15
3.7
15
81
13
78
60
10
16
12
1.60
101124113--101124283
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
101124108--101124280
46
3.7
46
80
13
219
28
28
21
21
1.98
101132771--101132985
94
2.3
93
88
3
315
22
13
16
46
1.82
101137818--101137861
20
2.0
22
87
12
65
68
13
9
9
1.40
101138492--101138560
25
2.8
25
80
8
70
28
2
1
66
1.14
101138481--101138637
3
53.0
3
65
18
62
31
3
2
62
1.26
101138514--101138560
20
2.4
19
82
10
51
27
0
2
70
0.99
101138570--101138647
29
2.7
28
76
9
77
34
2
3
58
1.30
101138730--101138763
13
2.5
13
90
4
50
35
2
0
61
1.11
101138754--101138806
11
4.9
11
82
11
65
35
1
3
58
1.27
101138748--101138794
21
2.2
21
100
0
94
31
0
4
63
1.13
101138723--101138809
34
2.6
34
81
7
97
35
2
3
58
1.27
101139076--101139172
8
11.2
8
74
22
56
24
2
2
71
1.08
101139097--101139139
20
2.1
21
86
4
61
25
4
2
67
1.22
101151025--101151211
73
2.5
75
87
4
263
32
16
20
30
1.94
101151327--101151563
91
2.6
91
89
5
349
32
17
17
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101151170--101151833
253
2.6
253
94
2
1138
31
17
18
32
1.94
101151589--101151933
179
1.9
177
88
4
525
28
17
18
34
1.95
101151575--101151932
90
4.0
89
85
4
449
28
17
18
35
1.94
101152461--101152508
25
1.9
25
82
0
60
31
29
10
29
1.90
101153011--101153054
20
2.0
22
83
12
56
68
11
9
11
1.40
101153717--101153776
25
2.7
22
76
18
61
30
3
3
63
1.27
101153945--101153980
15
2.5
15
90
4
56
33
0
0
66
0.92
101153973--101154069
25
3.9
25
76
9
101
37
6
4
52
1.46
101153973--101154067
50
1.9
48
83
8
120
36
6
4
52
1.46
101154262--101154304
13
3.6
12
82
17
54
30
0
2
67
1.03
101154650--101154751
25
4.2
26
91
8
162
31
6
27
34
1.83
101157451--101157491
21
1.9
22
90
5
66
21
4
2
70
1.18
101157485--101157518
8
4.1
8
88
3
50
32
0
2
64
1.08
101160164--101160465
83
3.7
83
94
0
525
32
18
20
28
1.96
101161221--101161338
18
6.5
18
93
3
193
37
11
14
37
1.81
101161221--101161338
35
3.3
35
93
4
191
37
11
14
37
1.81
101161221--101161338
53
2.2
55
93
4
204
37
11
14
37
1.81
101161827--101161886
17
3.5
17
74
21
63
33
1
0
65
1.03
101161828--101161886
16
3.5
16
76
23
59
33
1
0
64
1.04
101167022--101167069
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
101167018--101167069
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
101167017--101167073
24
2.4
24
79
5
71
64
1
3
29
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101167220--101167284
25
2.7
25
88
6
91
52
4
7
35
1.51
101167304--101167437
25
5.6
25
70
15
86
58
2
4
35
1.31
101167301--101167351
14
3.9
13
73
17
52
64
0
3
31
1.11
101167234--101167372
27
5.3
27
71
10
92
56
2
7
32
1.43
101167961--101168059
30
3.3
30
92
0
162
23
4
46
26
1.70
101167915--101168059
60
2.4
60
84
2
175
23
4
46
26
1.70
101168820--101169047
76
3.0
74
84
5
298
33
21
16
28
1.95
101169052--101169079
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
101168771--101169293
241
2.1
242
88
5
763
34
20
17
27
1.95
101168970--101169137
92
1.8
91
87
6
250
34
20
17
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343