Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  256  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84575919--84576030
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137
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204
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84594265--84594306
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18
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4
0
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1.14
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84617205--84617257
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25
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84627952--84628107
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1.8
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10
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25
20
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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24
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1.61
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45
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1.9
132
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21
23
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3.7
12
75
18
52
51
19
19
9
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
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179
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18
22
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
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9
62
27
6
20
45
1.75
84754025--84754064
20
2.0
20
90
0
62
42
0
27
30
1.56
84762524--84762570
21
2.2
22
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3
78
21
19
38
21
1.94
84767873--84767920
6
8.0
6
92
0
69
16
27
50
6
1.69
84767870--84767920
18
2.8
18
93
0
84
17
27
47
7
1.75
84769730--84769775
18
2.4
20
76
20
53
34
2
0
63
1.07
84776791--84776898
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26
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0
189
32
7
24
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1.83
84777387--84777432
22
2.1
22
100
0
92
43
8
10
36
1.71
84778514--84778622
27
4.1
27
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9
152
18
25
23
32
1.97
84778514--84778622
54
2.0
54
89
5
168
18
25
23
32
1.97
84781490--84781637
43
3.5
42
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8
156
27
16
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1.96
84788286--84788346
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3
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1.19
84788120--84788373
3
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3
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100
27
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1.46
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18
2.1
18
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2
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1.49
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43
2.7
43
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2
140
31
16
21
30
1.95
84791409--84791442
15
2.3
15
94
0
59
29
29
14
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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1
24
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72
1
1
23
1.05
84800173--84800236
20
3.2
20
78
15
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71
1
3
23
1.08
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1
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1.04
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1.08
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35
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27
1.98
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2.2
144
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18
27
1.98
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53
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0
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6
0
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1.25
84809169--84809229
25
2.4
25
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7
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6
0
36
1.25
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1.25
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50
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13
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3
0
31
1.09
84835652--84835708
22
2.6
22
82
0
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12
10
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1.60
84836253--84836334
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2.4
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0
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1.12
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1.9
25
95
4
87
40
0
0
59
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84838243--84838315
32
2.3
32
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4
112
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16
1.65
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2.1
30
100
0
124
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3
9
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1.52
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0
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0
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1.44
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2.0
58
100
0
236
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3
8
32
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343