Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  321  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103524427--103524469
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22
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0
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13
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0
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38
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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53
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0
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12
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2.1
23
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62
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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5
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0
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0
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18
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9
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60
0
8
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.2
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9
16
0
74
1.06
103725365--103725394
14
2.2
14
94
5
53
26
0
6
66
1.16
103726647--103726842
107
1.8
105
82
12
249
45
11
8
34
1.72
103731775--103731850
30
2.6
27
78
17
80
53
3
6
35
1.45
103731882--103731937
30
1.9
30
88
3
87
53
3
12
30
1.55
103732057--103732116
18
3.2
18
81
9
75
60
0
8
31
1.27
103746882--103746923
15
2.7
16
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52
2
0
45
1.13
103746891--103746932
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
103746917--103747104
61
3.1
61
70
14
199
48
6
1
42
1.39
103746885--103747106
120
1.9
120
99
0
435
49
6
1
42
1.38
103747001--103747052
15
3.6
15
80
12
56
53
1
0
44
1.11
103751608--103751931
156
2.1
156
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0
450
30
19
12
37
1.89
103753926--103754028
43
2.4
42
90
3
152
45
15
7
31
1.74
103755503--103755535
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0
0
33
0.92
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2.0
17
100
0
68
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11
23
1.87
103760976--103761029
15
3.3
15
74
18
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44
0
1
53
1.11
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33
2.1
33
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10
88
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1
2
47
1.25
103765049--103765094
22
2.1
22
84
15
60
41
15
10
32
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103777307--103777369
21
3.2
20
72
17
60
7
26
1
63
1.31
103786414--103786469
10
5.8
9
78
17
51
33
1
3
60
1.24
103786415--103786469
19
2.8
19
84
13
67
34
1
3
60
1.25
103786415--103786459
10
4.6
10
84
13
58
31
2
4
62
1.27
103787937--103787982
20
2.3
19
85
10
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36
4
6
52
1.47
103788493--103788536
22
2.0
22
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0
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11
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1.9
18
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0
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2.2
45
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0
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40
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19
22
1.92
103791312--103791436
45
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15
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38
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22
20
1.93
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21
2.6
22
73
15
64
28
0
5
66
1.13
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23
1.9
21
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14
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53
0
21
24
1.46
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15
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2
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41
1
7
49
1.43
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5
10.6
5
75
21
51
20
3
1
74
1.06
103796201--103796242
20
2.2
19
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12
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57
4
0
38
1.20
103796209--103796257
12
4.2
12
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50
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2
0
40
1.10
103796230--103796269
5
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5
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57
0
0
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0.98
103796216--103796269
15
3.8
14
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13
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55
1
0
42
1.10
103799808--103799984
54
3.3
53
79
4
185
41
1
34
23
1.62
103801343--103801422
11
7.5
11
73
16
71
53
7
1
37
1.37
103801343--103801562
22
10.5
21
68
21
99
56
7
2
33
1.41
103801467--103801557
23
4.0
24
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15
68
59
6
2
31
1.35
103801514--103801563
17
2.9
17
80
11
57
64
6
2
28
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103801704--103801743
12
3.3
12
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6
55
62
0
7
30
1.23
103803142--103803267
56
2.3
55
76
13
127
53
6
7
32
1.53
103803332--103803404
38
1.9
38
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94
56
4
2
36
1.33
103805280--103805309
3
9.7
3
92
7
51
66
0
3
30
1.07
103805388--103805440
23
2.4
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56
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1.45
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2.2
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83
30
1
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52
1.51
103812906--103812943
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2.5
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0
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0
0
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0.94
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0
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38
0.96
103817870--103817906
17
2.1
18
90
5
58
29
10
35
24
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343