Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  15  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5246990--5247027
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2.2
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25
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2.0
70
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2.0
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2.1
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66
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11
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5
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6
80
39
0
1
59
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
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2.1
21
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40
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1.77
5293198--5293230
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2.9
12
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2.8
37
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0
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17
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5.2
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1.99
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2.7
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10
247
25
21
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1.99
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2.1
24
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1.97
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4.9
40
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238
24
21
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1.99
5306877--5307072
79
2.5
80
81
9
238
24
21
28
25
1.99
5309208--5309415
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2.0
106
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251
23
32
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25
1.97
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21
1.9
21
100
0
80
22
35
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18
2.1
18
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1.92
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20
1.9
20
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5
23
25
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5377015--5377043
15
1.9
15
100
0
58
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20
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1.9
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5.3
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4.0
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219
20
22
14
41
1.89
5381165--5381213
23
2.1
23
84
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62
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22
16
1.95
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5.0
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12
101
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1.96
5381148--5381284
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1.9
71
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161
35
23
24
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1.95
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15
2.0
15
100
0
60
33
13
26
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
0
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2.0
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10
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1.32
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30
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0
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7
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1.39
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1.9
31
83
13
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38
10
15
35
1.81
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2.1
28
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2.4
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31
20
15
32
1.94
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2.1
17
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11
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0
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0
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0
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19
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2
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113
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3
5
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1.35
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30
3.2
32
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12
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41
1
1
56
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5473056--5473111
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0
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0
0
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1
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0
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0
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3.7
46
87
3
239
32
17
23
26
1.97
5495212--5495263
22
2.4
22
80
0
59
32
26
11
28
1.91
5495172--5495299
68
1.9
68
86
0
184
33
22
17
25
1.96
5495240--5495336
46
2.1
46
82
3
115
34
18
23
23
1.96
5495126--5495336
114
1.9
114
87
0
314
32
19
22
25
1.97
5495722--5496149
44
9.8
44
76
11
310
31
19
21
27
1.97
5496562--5496594
15
2.1
16
88
5
50
63
21
0
15
1.30
5515309--5515355
14
3.4
14
77
11
51
25
0
4
70
1.05
5523836--5523888
24
2.3
22
83
6
61
58
0
0
41
0.98
5526566--5526610
21
2.1
21
95
0
81
44
15
15
24
1.85
5527263--5527322
6
10.0
6
82
10
61
0
0
21
78
0.75
5527268--5527322
17
3.4
17
82
5
69
0
0
21
78
0.76
5527270--5527322
8
6.4
8
82
8
61
0
0
20
79
0.74
5529129--5529161
16
2.1
16
88
11
50
69
0
3
27
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5529129--5529226
28
3.6
27
77
15
87
63
1
3
32
1.17
5530497--5530547
22
2.4
21
74
6
50
35
7
0
56
1.28
5530589--5530629
21
2.0
21
85
0
55
31
4
4
58
1.40
5530602--5530653
21
2.4
22
87
6
70
30
3
0
65
1.10
5538490--5538717
46
5.0
45
76
13
191
29
19
27
23
1.98
5538492--5538761
94
2.9
94
76
14
263
29
19
27
23
1.98
5538490--5538759
138
1.9
142
80
8
320
29
20
27
23
1.98
5539048--5539105
28
2.1
28
96
0
107
27
6
22
43
1.79
5553439--5553485
23
2.0
23
84
8
60
38
6
4
51
1.47
5554863--5554923
11
5.6
11
74
3
52
55
13
11
19
1.67
5564114--5564253
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3.3
43
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4
158
28
15
25
31
1.95
5573133--5573201
18
4.0
18
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17
56
40
34
17
7
1.77
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11
2.3
11
100
0
50
0
0
8
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0.40
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29
2.8
27
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15
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58
0
7
34
1.26
5593562--5593609
21
2.2
22
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3
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12
8
10
68
1.39
5597260--5597298
17
2.3
17
86
8
53
38
0
2
58
1.12
5607910--5608065
44
3.6
42
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16
133
27
7
1
64
1.27
5607912--5608030
15
8.1
15
72
21
67
26
6
1
65
1.27
5607898--5608020
29
4.2
30
69
10
92
26
7
2
63
1.33
5607952--5608069
15
8.1
14
70
23
75
27
8
0
63
1.23
5608175--5608269
25
3.7
25
70
10
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30
7
3
58
1.41
5609680--5609722
18
2.3
18
88
8
59
44
2
0
53
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5610232--5610261
13
2.4
12
94
5
51
46
0
0
53
1.00
5620242--5620286
22
2.0
22
87
8
65
33
4
15
46
1.66
5624840--5624884
22
2.0
22
87
8
65
33
4
15
46
1.66
5628390--5628662
46
6.0
46
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1
397
39
15
23
21
1.92
5628390--5628662
91
3.0
92
89
2
397
39
15
23
21
1.92
5628405--5628662
137
1.9
137
86
2
338
39
15
23
20
1.92
5628923--5628969
25
2.0
25
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8
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53
4
14
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5631792--5631842
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2.1
24
85
0
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19
3
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54
1.60
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100
2.1
101
90
4
338
48
1
4
45
1.30
5632154--5632263
22
5.2
19
66
23
51
52
0
0
46
1.06

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343