Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  297  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97470841--97470888
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2
0
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12
3.9
13
74
20
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62
2
0
35
1.07
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5
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0
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1.39
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2.3
23
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23
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2.0
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1.20
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16
76
17
77
32
2
1
63
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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2
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25
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97506622--97507356
133
5.6
133
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2
827
31
16
25
25
1.97
97506622--97507381
177
4.3
176
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16
25
26
1.97
97508963--97509187
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5.7
40
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260
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27
22
25
2.00
97508965--97509187
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1.9
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22
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2.00
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56
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23
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90
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0
0
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0
50
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0
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3
3
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30
2.6
29
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2
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48
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2
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1.33
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2.9
45
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130
25
22
18
33
1.97
97524065--97524214
23
6.5
22
78
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101
25
22
20
32
1.97
97524167--97524238
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2.9
24
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2
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0.94
97527958--97528006
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55
24
2
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41
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0
0
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100
0
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0
10
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
1.24
97541341--97541402
11
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11
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6
12
1.21
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2.4
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16
0
0.87
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5
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17
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2
16
2
1.00
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3.7
14
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1
17
3
1.00
97542423--97542453
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2.6
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100
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0
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134
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20
3.6
21
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12
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29
2
1
66
1.13
97548991--97549071
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3.2
26
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98
29
4
2
62
1.29
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2.1
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2.0
36
97
0
135
25
34
8
31
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97577133--97577183
26
2.0
26
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0
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13
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33
1.77
97577138--97577190
26
2.2
24
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12
65
41
15
11
32
1.82
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2.2
20
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51
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1.47
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0
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48
1.43
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22
2.4
23
84
9
76
53
0
1
44
1.11
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18
2.2
19
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4
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53
0
0
46
1.00
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5
6.8
5
93
6
54
83
0
0
16
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97588229--97588275
6
8.2
6
86
9
55
80
2
2
14
0.89
97590103--97590559
138
3.3
138
85
3
614
26
18
19
34
1.95
97590168--97590738
44
12.6
44
69
10
238
28
17
19
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1.95
97590534--97590789
138
1.9
138
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0
386
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16
19
33
1.94
97592112--97592138
12
2.2
12
100
0
54
14
18
7
59
1.58
97606101--97606151
25
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24
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10
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25
19
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1.88
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21
2.0
21
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0
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2
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19
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1.59
97616192--97616267
9
8.2
9
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16
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0
15
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2
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1.59
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3.7
15
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10
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1
18
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1.59
97616661--97617122
196
2.4
196
93
3
788
51
3
6
38
1.47
97616668--97617122
97
4.6
99
95
2
787
50
3
6
38
1.48
97620097--97620122
12
2.2
12
100
0
52
50
23
7
19
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97621833--97622022
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2.3
82
82
8
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28
21
12
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1.90
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28
1.9
27
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3
28
1.70
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2.1
40
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0
125
23
20
20
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1.95
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41
2.2
41
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22
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0
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1.16
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0
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2.0
116
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1.91
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2.0
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10
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2.0
28
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1.85
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2.0
16
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0
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1.51
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2.0
17
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0
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1.15
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2.2
30
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7
1
41
1.41
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16
2.0
16
100
0
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18
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37
1.76
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21
2.0
22
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25
0
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2.0
33
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33
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10
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0
0
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31
0
1
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1.01
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2.1
18
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0
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23
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2.2
18
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38
12
0
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2.1
13
100
0
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29
14
14
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1.86
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2.0
92
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0
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4
8.2
4
87
6
50
73
0
2
23
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97673977--97674001
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0
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0
0
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126
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15
39
1.89
97675276--97675915
249
2.6
249
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869
28
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15
39
1.89
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32
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127
45
17
0
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2.1
28
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15
0
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0
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1.65
97703273--97703317
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343