Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  8  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2831550--2831580
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4
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0
0
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0
0
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131
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374
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18
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20
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2.2
28
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2
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10
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2.0
76
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2.0
131
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0
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2.0
74
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2
0
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2.1
31
88
8
96
26
4
10
57
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2901108--2901154
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3
0
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1.15
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20
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10
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13
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2.9
22
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71
2.5
70
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3
221
28
14
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33
1.94
3010026--3010364
76
4.5
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472
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15
20
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1.94
3010012--3010490
148
3.3
149
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9
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30
15
20
34
1.93
3010250--3010616
127
2.8
128
78
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26
15
22
35
1.94
3010589--3010834
87
2.8
89
85
4
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28
17
19
34
1.95
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10.1
72
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10
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28
17
20
33
1.96
3010752--3011515
233
3.4
225
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929
28
17
20
33
1.96
3011208--3011593
160
2.4
158
84
6
474
26
18
21
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3012464--3012525
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22
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50
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12
1.74
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11
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100
0
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0
0
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18
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0
5
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2.1
30
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5
85
40
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4
45
1.57
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2.1
32
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31
13
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20
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2
0
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1.04
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0
0
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20
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21
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86
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2
255
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28
19
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1.98
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4
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21
21
18
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2.0
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0
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0
0
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27
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20
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15.0
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100
0
90
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0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3040265--3040357
18
5.2
18
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0
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32
15
23
29
1.95
3040265--3040357
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1
7
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1.40
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20
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40
0
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21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
3092096--3092128
14
2.3
15
89
5
50
72
3
3
21
1.11
3093969--3094038
28
2.5
28
88
4
97
28
28
15
27
1.96
3100261--3100293
13
2.5
13
90
0
57
75
0
3
21
0.93
3110845--3110886
21
2.0
21
86
9
59
52
11
28
7
1.64
3125034--3125087
25
2.2
25
87
6
85
37
0
11
51
1.37
3125932--3125987
25
2.3
24
77
14
62
28
1
7
62
1.32
3133098--3133122
13
1.9
13
100
0
50
48
8
4
40
1.51
3134619--3134718
39
2.6
39
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3
168
35
23
8
34
1.84
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24
2.0
24
100
0
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24
0
28
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1.53
3155234--3155267
16
2.1
16
88
0
50
44
0
0
55
0.99
3156599--3156639
17
2.4
18
80
19
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65
4
7
21
1.37
3156900--3156958
31
1.9
31
85
0
82
35
8
10
45
1.68
3158118--3158234
51
2.3
51
91
5
184
29
22
14
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3160627--3160682
19
2.8
20
81
7
53
64
0
3
32
1.11
3165884--3165920
16
2.4
16
86
8
51
48
2
0
48
1.15
3166195--3166228
17
2.1
16
88
5
50
38
8
2
50
1.49
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36
2.2
34
79
18
82
46
8
13
31
1.73
3170225--3170296
35
2.0
36
86
7
103
47
8
12
31
1.71
3171853--3171882
15
1.9
16
93
6
53
63
0
16
20
1.31
3178794--3178818
11
2.3
11
100
0
50
8
28
0
64
1.22
3179105--3179143
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2.1
19
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4
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0
23
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1.53
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11
2.4
11
100
0
52
65
0
26
7
1.20
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21
4.5
21
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2
120
13
23
27
35
1.93
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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100
0
52
30
0
0
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28
2.0
28
100
0
112
10
17
17
53
1.72
3193857--3193912
28
2.2
26
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12
62
12
17
17
51
1.75
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2.0
24
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0
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0
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31
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1.65
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9
4.6
9
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0
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24
7
24
1.79
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66
2.0
67
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9
168
44
6
12
35
1.69
3241872--3241945
31
2.4
31
100
0
148
31
4
8
56
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3242263--3242295
17
2.0
17
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5
50
63
0
0
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6
11.7
6
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0
104
11
0
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1.24
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13
2.5
13
94
0
55
50
3
21
25
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3270547--3270617
22
3.2
22
65
31
60
46
11
8
33
1.70
3270554--3270626
24
3.2
24
65
31
68
45
10
9
34
1.72
3270540--3270631
45
2.0
45
100
0
184
46
11
8
32
1.71
3270545--3270616
23
3.2
23
64
25
62
47
11
8
33
1.69
3270770--3270804
11
3.3
11
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4
54
28
0
11
60
1.32
3271161--3271201
15
2.5
17
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2
0
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0
2
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0
2
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1.10
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2.3
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4
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33
0
2
63
1.08
3271569--3271625
24
2.5
22
80
8
69
45
0
1
52
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343