Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  279  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92594807--92594962
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26
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2.3
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230
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26
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1.98
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2.2
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2.5
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196
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29
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18
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16
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1
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
26
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27
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26
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42
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121
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2.1
13
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20
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137
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2.1
21
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1.9
202
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338
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0
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19
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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2.0
274
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808
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20
17
26
1.95
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3.2
13
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0
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1.60
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5
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38
1.70
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24
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1.62
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1.40
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14
93
0
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70
6
6
16
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92756471--92756805
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2
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17
14
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14
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2
2
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0
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60
34
2
4
59
1.29
92774183--92774253
14
5.1
14
91
0
115
59
14
8
18
1.60
92776628--92776662
18
2.0
18
88
5
54
11
25
45
17
1.81
92785879--92785947
25
2.8
25
88
2
95
31
18
30
18
1.96
92785887--92785959
25
2.9
25
89
0
101
31
17
28
21
1.97
92787457--92787538
41
2.0
41
100
0
164
39
7
9
43
1.65
92787463--92787547
41
2.1
40
89
4
127
40
7
11
41
1.69
92791162--92791202
16
2.5
17
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4
50
41
7
0
51
1.30
92791170--92791205
16
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17
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47
5
0
47
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24
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9
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24
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0
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32
1.43
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8
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36
2.1
36
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22
1
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24
1.56
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24
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24
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0
111
24
1
50
24
1.57
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19
1.9
18
94
5
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16
0
41
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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45
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96
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0
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1.93
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0
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69
0
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0
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0
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0
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10
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1.56
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2.1
88
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2
203
22
20
19
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2.1
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0
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2.5
20
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28
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26
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0
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5
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0
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23
23
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2.1
17
88
0
52
57
11
2
28
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92867302--92867340
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2.0
20
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23
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2.0
40
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0
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11
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38
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2.9
14
82
10
57
30
0
2
66
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343