Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  163  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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20
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221
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Period
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Copy
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Score
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0
17
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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2.7
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85
2
144
29
19
22
28
1.98
54063629--54063735
40
2.7
40
84
5
119
25
27
20
27
1.99
54063635--54063855
80
2.8
80
79
7
193
27
27
20
25
1.99
54063675--54063855
80
2.3
80
83
9
219
27
27
20
23
1.99
54063672--54063855
40
4.6
40
81
7
196
28
27
20
23
1.99
54070646--54070750
40
2.6
40
83
3
131
29
18
23
28
1.98
54070720--54070802
40
2.1
40
93
0
139
21
19
27
31
1.97
54081990--54082130
38
3.7
38
78
11
135
21
20
24
33
1.97
54081974--54082130
78
2.0
80
84
7
207
22
20
24
32
1.98
54082010--54082130
38
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38
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2
143
20
19
24
35
1.95
54092347--54092406
15
4.0
15
77
0
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15
18
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1.70
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2.0
43
93
0
145
20
19
31
27
1.97
54100153--54100222
21
3.3
20
76
7
68
15
18
17
48
1.81
54100153--54100301
21
7.2
21
67
7
63
15
21
18
44
1.87
54100151--54100287
42
3.3
42
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2
141
16
21
18
43
1.88
54101546--54101699
24
6.4
24
90
6
208
27
22
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54101748--54101794
20
2.3
20
96
0
85
34
21
10
34
1.88
54109388--54109445
29
2.0
30
89
3
91
25
22
17
34
1.96
54109643--54109763
24
5.0
24
90
7
183
28
22
20
28
1.99
54109634--54109763
49
2.6
48
86
9
183
27
22
19
30
1.98
54109812--54109878
20
3.3
20
93
0
116
32
20
11
34
1.90
54109812--54109867
11
5.5
11
71
16
57
32
19
12
35
1.89
54113520--54113701
40
4.6
40
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2
222
24
22
26
26
2.00
54121330--54121507
27
6.6
27
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3
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29
28
15
26
1.96
54121351--54121506
82
1.9
81
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3
233
29
28
15
26
1.96
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27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
54130634--54130789
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
54134559--54134740
40
4.6
40
84
6
235
25
23
26
24
2.00
54134559--54134740
80
2.3
80
88
3
260
25
23
26
24
2.00
54137858--54137942
27
3.1
27
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8
111
37
22
23
16
1.93
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18
2.3
20
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15
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31
9
9
50
1.65
54145063--54145102
18
2.2
18
100
0
80
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10
15
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1.80
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27
4.2
26
79
7
116
35
20
25
18
1.95
54145676--54145787
54
2.1
54
86
3
154
35
20
25
18
1.95
54152912--54152947
19
1.9
18
88
5
54
72
2
2
22
1.11
54156398--54156439
21
2.0
22
86
13
61
59
2
4
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1.31
54156583--54156625
18
2.5
17
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44
2
2
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1.27
54159264--54159381
62
1.9
62
89
0
182
37
16
7
38
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54165609--54165636
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3.5
8
100
0
56
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10
10
10
1.42
54175322--54175375
27
2.0
27
100
0
90
48
7
3
40
1.49
54175325--54175382
27
2.1
27
90
0
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55
5
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1.39
54181018--54181050
16
2.1
16
100
0
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51
18
6
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1.68
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2.7
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8
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54194163--54194702
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11.4
47
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2
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32
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30
27
1.89
54200132--54200170
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1.9
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46
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0
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19
25
1.98
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50
84
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214
29
25
19
25
1.99
54223242--54223361
56
2.1
56
96
0
222
45
9
23
21
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343