Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  250  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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21
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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196
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1.96
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28
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38
0
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55
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82953862--82953933
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1.96
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17
88
11
52
6
15
6
72
1.24
82967758--82967828
35
2.0
35
100
0
142
23
16
25
33
1.96
82969224--82969306
41
2.0
41
92
0
139
18
21
19
40
1.91
82970981--82971087
43
2.5
43
79
10
121
32
22
16
28
1.96
82974529--82974584
28
2.0
28
100
0
112
42
10
21
25
1.85
82976401--82976450
20
2.6
19
81
6
55
56
6
2
36
1.36
82976398--82976441
18
2.5
19
73
26
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52
6
2
38
1.41
82976580--82976614
7
5.0
7
92
0
61
68
0
0
31
0.90
82976655--82976688
13
2.5
13
85
4
50
64
5
0
29
1.17
82976642--82976710
32
2.2
32
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10
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65
4
1
28
1.21
82976671--82976790
47
2.4
50
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2
1
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1.20
82976749--82976882
9
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9
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60
0
0
38
1.02
82976750--82976843
18
5.2
18
80
1
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62
0
0
37
0.95
82976766--82976871
27
3.9
27
94
2
185
63
0
0
36
0.95
82978307--82978656
45
7.8
45
68
10
169
27
25
15
31
1.96
82978307--82978616
90
3.4
90
89
1
453
27
25
15
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82989413--82989562
71
2.2
64
81
10
167
52
10
6
31
1.60
82989833--82989898
19
3.7
18
78
7
73
54
4
1
39
1.30
82990023--82990056
8
4.2
8
88
11
52
73
0
0
26
0.83
82990020--82990140
15
7.9
14
70
20
66
64
0
4
29
1.20
82990076--82990181
18
5.8
18
71
18
76
62
2
1
33
1.21
82990020--82990165
11
13.9
11
71
19
57
64
2
4
28
1.25
82990160--82990272
15
7.4
15
65
14
61
58
0
1
38
1.15
82990112--82990182
29
2.4
30
75
13
76
61
2
1
33
1.19
82990140--82990234
49
2.0
46
84
11
122
56
3
2
37
1.27
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19
2.0
19
94
0
67
65
0
0
34
0.93
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49
2.3
49
77
15
119
60
1
0
37
1.14
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32
6.4
30
69
19
80
59
2
2
36
1.21
82993602--82993644
20
2.3
18
80
8
50
44
18
2
34
1.63
82995431--82995568
70
2.0
70
86
0
195
40
4
18
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19
2.1
19
100
0
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20
48
1.70
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12
2.6
13
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18
0
37
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1.51
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3.1
92
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5
292
40
9
15
33
1.80
83002931--83002967
19
2.0
19
89
5
58
37
8
13
40
1.74
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22
2.0
24
84
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59
2
0
38
1.09
83013829--83013874
18
2.6
18
89
0
65
60
32
0
6
1.22
83014661--83014706
15
3.1
15
84
9
67
36
0
6
56
1.25
83014667--83014703
13
2.6
15
87
8
51
37
0
5
56
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83016721--83016756
12
3.0
12
87
0
54
25
27
5
41
1.77
83016729--83016760
16
1.9
17
93
6
57
25
28
6
40
1.79
83021373--83021494
57
2.2
56
86
5
167
28
12
17
41
1.85
83021465--83021524
30
2.0
30
90
6
95
20
10
28
41
1.84
83021409--83021587
87
2.1
86
81
8
202
29
13
21
35
1.92
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13
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3
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54
1.46
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3.7
25
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3
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2
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1.41
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2.3
127
89
0
446
26
18
18
36
1.95
83026469--83026789
127
2.5
127
86
0
365
25
17
19
36
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343