Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  198  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65502780--65502818
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2
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0
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2
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1.13
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2.0
18
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0
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2.0
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0
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0
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0
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1.56
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2.4
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18
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152
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2.0
40
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103
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48
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2.1
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5.4
7
100
0
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15
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
2
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17
2.1
17
100
0
70
45
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17
20
1.85
65589781--65589813
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2.3
15
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0
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50
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17
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14
2.3
14
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0
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3.7
37
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29
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28
20
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1.99
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3.8
37
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25
30
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10.6
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654
28
28
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17
2.4
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35
25
0
38
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65619758--65619892
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245
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3.2
31
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20
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29
7
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1.86
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113
2.1
110
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4
333
28
29
8
33
1.86
65619824--65620222
141
2.8
141
96
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28
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1.88
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28
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197
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18
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0
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0
0
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90
9
72
45
2
20
31
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
43
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1
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15
24
36
1.94
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43
2.8
43
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1
154
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14
25
34
1.94
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2.5
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29
20
27
1.99
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48
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46
73
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22
26
21
28
1.99
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2.3
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22
26
21
28
1.99
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23
25
20
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1.98
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24
27
19
28
1.99
65660233--65660456
94
2.4
94
80
1
234
24
25
19
30
1.98
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46
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24
25
19
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1.98
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2
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54
1.54
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0
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1.94
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33
1.95
65716561--65716718
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2.0
81
88
0
235
26
14
25
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65718415--65718455
17
2.2
20
87
12
61
68
0
31
0
0.90
65721968--65722035
20
3.4
20
76
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10
26
17
45
1.80
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13
196
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28
19
29
1.98
65724232--65724497
140
1.9
141
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5
333
22
28
19
29
1.98
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44
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141
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20
18
28
1.96
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4
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51
23
3
0
73
0.98
65737168--65737276
55
2.0
54
82
8
132
33
4
0
61
1.23
65737371--65737407
3
12.3
3
100
0
74
32
0
0
67
0.91
65739716--65739777
30
2.1
30
82
8
74
61
0
20
17
1.35
65740911--65740955
23
2.0
23
90
0
72
11
17
26
44
1.82
65744974--65745033
29
2.1
29
84
6
77
35
20
1
43
1.62
65748178--65748304
50
2.5
51
84
1
148
24
21
26
27
1.99
65748226--65748341
51
2.3
51
86
0
151
25
18
26
28
1.98
65748263--65748406
51
2.8
51
80
6
141
27
15
28
29
1.96
65753193--65753234
22
1.9
22
85
0
57
47
4
14
33
1.65
65771249--65771292
21
2.1
21
95
0
79
36
9
6
47
1.62
65771850--65771971
64
1.9
64
86
0
172
21
17
22
38
1.93
65772055--65772107
24
2.2
24
83
6
63
18
22
22
35
1.95
65773471--65773709
49
4.8
49
86
2
307
28
26
17
26
1.98
65773471--65773716
99
2.5
100
85
2
325
28
27
18
26
1.98
65783394--65783439
13
3.7
13
74
8
51
30
2
0
67
1.03
65787891--65787922
15
2.1
15
100
0
64
12
6
0
81
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65790428--65790469
19
2.1
21
86
8
61
28
7
0
64
1.20
65790973--65791158
88
2.1
88
82
8
220
38
22
6
32
1.79
65792240--65792288
26
2.0
26
88
8
75
65
6
0
28
1.16
65792993--65793040
16
3.1
16
79
11
55
58
8
2
31
1.39
65794306--65794338
16
2.1
16
88
11
50
0
6
12
81
0.85
65794742--65794809
28
2.5
26
79
9
82
30
1
2
64
1.17
65794731--65794833
20
5.3
19
77
9
100
32
0
1
65
1.11
65794731--65794833
9
10.6
9
71
18
73
32
0
1
65
1.11
65794926--65795145
92
2.5
87
83
7
266
32
10
19
38
1.85
65802640--65802829
41
4.6
42
82
6
196
32
29
15
23
1.95
65806840--65806886
24
2.0
24
100
0
94
31
4
25
38
1.75
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32
2.0
32
96
0
121
32
6
23
38
1.79
65809979--65810031
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
65811479--65811524
10
4.5
10
81
5
56
43
21
21
13
1.86
65811480--65811527
21
2.3
21
89
3
71
45
22
18
12
1.83
65811841--65811882
19
2.2
20
86
4
59
73
0
0
26
0.83
65811841--65811882
20
2.1
20
86
0
57
73
0
0
26
0.83
65812505--65812542
20
1.9
20
88
0
58
39
0
5
55
1.23
65816626--65816670
23
2.0
23
90
0
72
53
15
4
26
1.61
65816627--65816676
23
2.2
23
85
0
64
56
18
4
22
1.58
65818404--65818454
26
2.0
26
84
7
68
41
25
13
19
1.88
65824348--65824392
21
2.1
21
95
0
81
37
4
6
51
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65826573--65826653
37
2.2
38
77
16
91
37
6
1
55
1.33
65828858--65829631
393
2.0
385
82
7
945
36
10
11
41
1.75
65838174--65838309
71
1.9
71
81
0
164
23
20
20
35
1.96
65838225--65838401
95
1.9
95
82
4
223
24
20
22
32
1.98
65845183--65845226
18
2.4
18
81
11
54
47
11
15
25
1.79
65848417--65848627
64
3.2
64
62
20
142
29
25
18
26
1.98
65848383--65848669
137
2.1
137
98
0
547
31
24
19
24
1.98
65848917--65848969
26
2.0
26
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63
26
15
20
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1.92
65850458--65850541
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3.2
26
93
0
141
36
23
4
34
1.76
65860105--65860139
18
1.9
18
88
0
52
60
2
2
34
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343