Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  71  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23193464--23193506
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0
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0
0
20
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0
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0
0
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0
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177
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20
20
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2.1
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1.9
16
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0
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6
35
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
21
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0
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0
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26
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19
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21
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1.97
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160
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1.98
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1.98
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1.51
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23
82
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59
42
21
21
15
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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23
16
1.93
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69
38
24
23
13
1.91
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44
3
17
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1.64
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13
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1.64
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0
54
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23394978--23395003
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2.0
13
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0
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28
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0
99
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18
27
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22
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72
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56
45
30
1
22
1.61
23411802--23411927
14
8.7
15
71
10
75
44
31
1
22
1.62
23412038--23412103
7
9.3
7
82
9
71
46
27
1
24
1.61
23412030--23412075
21
2.2
21
88
0
65
47
23
4
23
1.69
23411827--23412040
109
2.0
108
83
6
261
46
28
3
21
1.67
23412056--23412121
29
2.3
29
81
5
89
46
30
0
22
1.52
23412087--23412158
21
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21
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7
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1
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1.59
23412501--23412544
3
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3
100
0
88
68
0
0
31
0.90
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116
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5
367
33
17
18
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1.95
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116
1.8
116
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32
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1.95
23412721--23412987
116
2.3
115
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1.93
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9
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9
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30
1.61
23415400--23415651
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4.7
54
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264
44
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1.61
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27
2.0
27
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0
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7
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14
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14
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34
0
10
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1.34
23424808--23425094
145
2.0
145
100
0
574
38
18
12
31
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23426795--23426890
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12
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6
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3
1
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5
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5
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0
2
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1.09
23426950--23427010
25
2.4
26
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34
0
3
62
1.12
23426932--23427024
35
2.6
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36
0
2
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1.08
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10
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3
3
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1.30
23426963--23427077
14
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14
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2
2
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1.25
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210
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0
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29
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27
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75
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1
2
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1.20
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2.0
50
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0
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2
2
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0
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0
0
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1.9
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22
22
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22
1.9
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7
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2.0
18
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0
0
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126
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2.1
28
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6
77
42
13
0
44
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23480297--23480387
41
2.2
42
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0
28
1.54
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27
2.2
26
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27
3
5
63
1.31
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46
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24
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0
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17
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0
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1.98
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25
2.0
25
100
0
100
48
8
16
28
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343