Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
439722--439758
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0
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20
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3.1
37
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192
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15
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2.5
24
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0
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30
25
0
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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23
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19
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2.1
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18
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0
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0
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4
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57
0
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31
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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4.8
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23
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1.99
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24
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1.99
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20
29
24
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376
17
30
8
42
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
723802--723827
12
2.2
12
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0
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0
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2
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10
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2.0
31
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11
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2.0
26
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0
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2.2
69
97
0
288
37
26
28
7
1.83
762881--762978
36
2.9
33
66
8
88
36
26
29
7
1.83
762845--762957
36
3.2
36
70
7
124
37
30
25
7
1.83
765744--765793
24
2.1
23
85
3
64
54
0
0
46
1.00
765821--765860
21
1.9
21
90
10
64
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2
0
47
1.14
765845--765893
12
3.6
14
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15
50
46
0
0
53
1.00
765844--765899
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26
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50
0
0
50
1.00
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2.0
243
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0
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24
28
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29
1.97
776526--776565
14
2.9
14
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0
53
32
7
17
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1.77
776549--776588
20
2.0
20
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0
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10
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34
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3
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31
8
13
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1.74
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20
2.0
20
94
0
69
48
2
0
48
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
3.2
15
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17
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41
1
1
54
1.22
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14
2.9
14
84
0
53
32
7
17
42
1.77
779838--779888
18
2.8
18
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0
66
39
3
43
13
1.63
795734--795760
6
4.5
6
100
0
54
14
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29
18
1.91
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2.8
33
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100
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1.73
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144
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2
403
35
15
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832884--833601
182
4.0
181
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11
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16
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0
2
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0
0
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1.00
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0
0
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1.13
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1
0
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0
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50
1.00
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2.0
20
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26
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12
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0
0
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2.0
20
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9
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2
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47
1.45
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37
2.3
37
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2
0
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2.2
26
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42
7
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46
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876867--877259
136
2.9
137
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355
29
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15
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877392--877470
36
2.2
36
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0
140
26
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2.0
21
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45
2
0
52
1.13
884520--884571
7
7.4
7
76
6
52
55
0
3
40
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
889427--889791
182
2.0
182
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0
721
42
9
11
37
1.73
892679--892732
28
2.0
27
86
13
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16
12
11
1.61
893721--893775
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3.2
17
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54
0
0
45
0.99
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3.4
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15
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57
0
4
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1.20
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2.2
23
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0
1
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2
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0
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48
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3.0
33
78
15
107
52
2
2
44
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343