Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11720792--11720946
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30
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0
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2.0
26
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100
0
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231
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140
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42
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42
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2.1
17
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0
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38
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
0
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2.8
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4.0
126
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17
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2.0
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4
29
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2
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16
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34
2
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1.21
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5
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0
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29
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91
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2
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0
0
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0
0
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6
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1
59
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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0
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1.13
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58
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0
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2.5
23
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2
100
25
18
10
45
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11880898--11880956
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2.1
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45
1.18
11880898--11880966
28
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0
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20
58
39
4
0
55
1.21
11910634--11910682
26
2.0
26
88
8
75
40
4
0
55
1.19
11923303--11923354
26
2.0
26
100
0
104
46
19
0
34
1.50
11923618--11923713
41
2.4
40
89
1
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18
21
21
37
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11927940--11927993
23
2.3
23
90
0
81
51
3
1
42
1.30
11927976--11928068
40
2.3
42
80
10
113
46
2
4
47
1.34
11927973--11928068
41
2.3
40
75
12
106
45
2
4
47
1.33
11931933--11932057
3
41.0
3
73
3
88
61
1
7
29
1.32
11933501--11933543
3
14.3
3
100
0
86
32
0
0
67
0.91
11936204--11936322
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2.2
55
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11
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25
27
25
21
1.99
11937077--11937277
93
2.1
95
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20
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1.97
11937077--11937390
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24
1.98
11937077--11937390
94
3.3
95
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7
302
22
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21
24
1.98
11939039--11939112
35
2.1
36
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2
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50
4
13
32
1.60
11941503--11941546
20
2.0
22
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12
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68
13
9
9
1.40
11942127--11942266
6
23.2
6
70
17
53
32
5
2
60
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11942402--11942573
25
7.2
23
76
15
145
33
6
4
55
1.46
11942410--11942578
26
6.9
25
76
13
156
34
7
4
53
1.49
11942408--11942582
51
3.6
49
80
10
166
35
7
4
52
1.50
11942455--11942598
51
2.8
51
77
15
147
35
9
5
50
1.58
11942745--11942789
20
2.3
20
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14
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24
4
2
68
1.19
11942783--11942816
8
4.6
7
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3
50
32
0
2
64
1.08
11942781--11942826
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15
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2
2
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1.16
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0
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25
0
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1.50
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2.1
27
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0
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28
19
1.97
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2.4
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18
35
1.93
11954874--11955106
90
2.6
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17
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250
2.4
251
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868
29
18
17
34
1.94
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163
2.3
162
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457
30
18
17
34
1.94
11955053--11955199
73
2.0
74
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208
29
18
18
33
1.95
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89
2.0
88
88
5
267
27
19
17
35
1.94
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25
1.9
25
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1.93
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2.0
22
87
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68
13
9
9
1.40
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22
2.9
22
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30
3
1
65
1.17
11957077--11957126
22
2.3
22
86
3
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28
4
2
66
1.21
11957056--11957126
25
3.3
22
76
17
69
29
2
1
66
1.15
11957222--11957317
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2.0
48
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33
12
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1.59
11957230--11957335
46
2.3
45
87
9
144
33
12
4
49
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11957357--11957390
17
2.0
17
94
0
59
26
0
5
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1.13
11957338--11957445
23
5.1
22
73
24
83
33
2
3
60
1.29
11957425--11957520
26
3.8
26
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34
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4
54
1.48
11957381--11957519
50
2.9
50
79
14
143
35
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3
54
1.43
11957684--11957731
23
2.0
23
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2
0
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21
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0
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0
13
13
1.12
11966708--11966841
48
2.8
47
80
14
121
35
29
12
23
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343