Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  29  of  343  ( 41150 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9893743--9898995
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7.0
720
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773
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0
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0
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0
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1.10
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1
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22
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0
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1.12
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47
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29
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0
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0
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20
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62
0
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31
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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1.20
9937049--9937215
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17
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2.0
51
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0
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5
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5
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4.8
48
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15
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7
0
74
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
6
0
74
1.04
10014961--10015046
10
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22
65
18
6
0
74
1.04
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2.8
23
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2
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2.1
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22
1.98
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17
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0
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16
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1.92
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0
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0
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10
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10084352--10084417
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21
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4
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1.10
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30
15
12
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1.83
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0
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1.21
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19
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0
0
66
0.92
10099394--10099418
3
8.3
3
100
0
50
32
0
32
36
1.58
10100877--10100911
10
3.6
10
88
7
54
28
0
8
62
1.24
10107235--10107277
19
2.4
17
88
7
59
60
2
0
37
1.10
10108906--10109242
176
1.9
175
87
3
498
26
21
20
30
1.98
10109213--10109508
89
3.3
88
67
9
249
27
21
20
30
1.98
10109081--10109368
133
2.2
133
91
1
452
27
22
20
29
1.98
10109145--10109332
44
4.2
44
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16
136
27
22
21
29
1.99
10117906--10118225
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7.0
46
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0
471
38
15
23
22
1.92
10123677--10123726
26
2.0
24
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7
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64
6
0
30
1.18
10123697--10123755
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0
22
1.15
10125766--10125808
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2.4
17
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7
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2
0
37
1.10
10125960--10125989
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2.3
13
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0
51
60
3
6
30
1.39
10131321--10131350
15
2.1
15
93
6
53
53
6
0
40
1.27
10132045--10132082
13
2.7
14
84
12
51
76
2
0
21
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10132045--10132082
14
2.7
14
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11
51
76
2
0
21
0.91
10136786--10137983
594
2.0
598
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1
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33
16
17
31
1.93
10147763--10147808
14
3.1
15
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30
15
4
50
1.63
10148155--10148206
24
2.2
24
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28
23
26
21
1.99
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0
0
37
0.96
10151867--10151899
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2.3
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10
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60
0
0
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0.97
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1.8
169
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1
501
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10
15
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2.1
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35
1.82
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3.1
19
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0
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3
6
28
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2
6
27
1.34
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14
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63
2
3
30
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3.9
12
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11
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8
0
46
44
1.34
10154761--10154819
22
2.5
22
91
8
91
8
0
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42
1.33
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4.2
88
72
8
252
28
22
18
29
1.98
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134
2.2
133
81
5
302
28
24
16
30
1.97
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45
14.6
45
67
9
134
28
22
18
30
1.98
10155337--10155588
133
1.9
134
84
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341
30
24
15
30
1.95
10155337--10155630
133
2.2
134
80
5
326
29
23
16
29
1.96
10155621--10155762
44
3.2
45
83
5
148
27
23
20
28
1.99
10155690--10155776
44
2.0
44
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0
111
27
22
21
27
1.99
10155568--10155895
177
1.8
178
85
8
463
26
21
21
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10155737--10156160
133
3.2
132
89
2
616
25
20
21
32
1.98
10155665--10156160
266
1.9
266
81
2
620
25
20
21
32
1.98
10155931--10156116
44
4.2
44
67
6
115
25
19
22
32
1.97
10155745--10156251
266
1.9
266
79
2
561
26
20
21
32
1.97
10162508--10162764
125
2.0
127
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326
37
16
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34
1.85
10162920--10162977
20
3.1
18
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63
1
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27
1.29
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3
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3
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8
0
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1.34
10163778--10163823
22
2.1
22
95
0
83
10
0
45
43
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343