Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  304  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99035449--99035538
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1
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175
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0
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0
2
30
1.05
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28
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2.0
30
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30
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208
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14
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147
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28
15
21
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1
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2.3
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5
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24
2.5
24
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15
68
34
8
6
50
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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4
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1.58
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15
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2
2
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1.16
99086298--99086349
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1.14
99087238--99087282
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19
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26
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20
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100
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0
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2.6
23
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15
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1.10
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16
100
0
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4
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1.34
99129090--99129181
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99129132--99129205
35
2.1
36
89
2
114
35
4
5
55
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99129168--99129246
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3.4
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5
55
1.35
99129187--99129270
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3.7
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4
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10
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1.50
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12
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3
4
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1.35
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2
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3
47
1.38
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2.5
28
84
11
83
43
4
12
40
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99182025--99182262
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118
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1.90
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2.0
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2.0
52
98
0
201
37
9
16
37
1.81
99206250--99206316
33
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33
100
0
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20
23
17
37
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12
2.8
13
91
8
56
5
0
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37
1.23
99209929--99209962
6
5.7
6
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0
50
2
0
58
38
1.13
99212676--99212720
20
2.1
22
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8
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53
0
2
44
1.13
99213778--99213831
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22
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11
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5
3
27
1.34
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54
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99216529--99216846
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85
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12
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37
19
16
26
1.92
99216529--99216843
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10
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37
19
16
26
1.93
99229306--99229358
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24
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1
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1.38
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30
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30
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45
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9
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25
23
15
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1.94
99235812--99235870
23
2.6
22
84
5
73
30
23
13
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
23
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24
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27
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27
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92
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0
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0
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116
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18
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0
0
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1.9
14
100
0
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7
37
18
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99316906--99316945
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19
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0
0
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22
1.97
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1.9
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6
200
29
5
44
21
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343