Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  60  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19312197--19312778
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6.0
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4
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28
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2.1
43
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0
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1.93
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1.96
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6.6
40
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1
262
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28
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1.99
19318811--19319393
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12.1
49
90
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32
9
29
29
1.88
19318813--19319391
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4.0
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4
970
31
9
29
29
1.88
19319192--19319393
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4.3
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1
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9
31
27
1.88
19319192--19319393
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0
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27
1.88
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110
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0
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12
100
0
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50
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295
29
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142
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2.3
99
99
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16
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19384688--19384779
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2.6
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20
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2.1
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97
0
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2.8
29
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19399983--19400012
14
2.1
14
93
0
51
16
0
36
46
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
37
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0
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23
1.98
19402525--19402932
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47
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0
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29
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1.86
19434636--19434872
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3
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16
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2
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1.36
19434636--19434751
30
3.8
30
76
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25
8
2
62
1.37
19436776--19436821
19
2.4
19
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19
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1.80
19447457--19447554
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3.5
28
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25
12
29
32
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19447457--19447567
28
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27
90
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11
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171
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12
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19455556--19455666
28
4.0
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90
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107
27
11
27
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25
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2.3
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20
23
27
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88
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20
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25
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2.0
178
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497
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44
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22
22
24
1.99
19457784--19458170
177
2.2
176
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2
382
32
19
21
25
1.97
19457939--19458640
132
5.3
131
83
4
765
30
20
23
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1.99
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263
2.4
263
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20
24
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1.99
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55
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44
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1.45
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60
1.43
19459501--19459574
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1.21
19459801--19459854
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2.1
25
89
3
81
25
5
0
68
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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1
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2.5
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19
17
30
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20
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1.39
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2.0
18
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37
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19503384--19503414
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1.9
16
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0
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20
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37
1
11
49
1.50
19525109--19525152
23
1.9
23
90
0
70
38
2
9
50
1.47
19525221--19525289
5
13.8
5
98
0
129
40
0
1
57
1.07
19526071--19526120
26
1.9
26
84
8
66
38
4
6
52
1.45
19538670--19538724
13
4.2
13
76
0
56
36
7
21
34
1.81
19540428--19540511
23
3.5
24
77
6
71
22
21
22
33
1.97
19540452--19540521
25
2.8
24
75
14
70
24
22
22
30
1.99
19540404--19540529
50
2.6
48
77
12
130
26
20
20
31
1.98
19546651--19546764
51
2.3
49
92
4
192
36
8
11
42
1.72
19550717--19550845
63
2.0
64
84
1
170
37
24
17
20
1.94
19557534--19557644
47
2.4
47
80
6
127
36
21
15
27
1.93
19572707--19572782
27
2.8
26
82
9
91
51
15
19
13
1.76
19572716--19572782
13
5.0
13
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5
62
50
14
19
14
1.77
19577572--19577645
18
4.1
18
80
15
89
74
1
6
17
1.11
19577575--19577644
6
11.5
6
77
8
70
77
1
5
15
1.03
19579286--19579342
21
2.8
21
76
15
57
70
0
7
22
1.11
19582763--19582803
20
2.0
20
100
0
82
43
9
4
41
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19586374--19586517
33
4.4
33
89
2
170
34
21
11
33
1.89
19586462--19586566
32
3.2
32
90
4
149
34
21
12
31
1.91
19586372--19586566
33
6.0
33
86
3
155
33
21
11
33
1.89
19586559--19586686
29
4.4
29
88
3
186
25
29
10
34
1.89
19586559--19586683
59
2.1
58
86
4
180
25
29
10
34
1.89
19588485--19588554
35
2.0
35
97
0
131
38
14
15
31
1.88
19596436--19596564
42
3.1
41
80
6
152
44
18
21
15
1.87
19597015--19597064
22
2.5
20
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15
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42
10
0
48
1.37
19600017--19600063
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2.0
24
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25
21
4
48
1.68
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3
9.0
3
100
0
54
0
0
66
33
0.92
19608637--19608708
35
2.1
35
100
0
144
48
11
13
26
1.76
19619772--19619813
20
2.2
20
86
4
59
54
7
4
33
1.49
19622959--19622990
12
2.4
14
85
15
50
46
0
15
37
1.46
19626459--19626484
12
2.2
12
100
0
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7
0
7
0.77
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2.0
27
100
0
108
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11
1.68
19631307--19631363
28
2.0
28
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0
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33
12
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35
1.89
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2.2
38
91
0
132
34
11
7
46
1.68
19633078--19633127
24
2.1
24
96
3
93
46
0
0
54
1.00
19633760--19633836
30
2.5
32
79
14
90
42
5
0
51
1.24
19633749--19633840
38
2.4
36
79
13
96
43
6
0
50
1.28
19637467--19637509
21
1.9
24
86
13
65
32
2
60
4
1.30
19642629--19642695
30
2.2
30
83
5
80
40
2
7
49
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19643580--19643620
19
2.2
19
86
8
57
70
0
0
29
0.87
19645944--19645981
5
7.4
5
94
5
67
39
0
0
60
0.97
19649386--19649428
18
2.5
17
85
14
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46
6
0
46
1.30
19656500--19656525
5
5.2
5
100
0
52
19
0
0
80
0.71
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11
2.7
11
94
5
51
48
34
6
10
1.64
19660324--19660387
25
2.6
25
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9
69
54
3
0
42
1.16
19661215--19661243
3
9.7
3
100
0
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31
0
0
68
0.89
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4
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1.69
19667733--19667829
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2.0
48
86
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133
38
5
2
54
1.34
19672031--19672073
19
2.2
20
87
4
61
30
18
4
46
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343