Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  39  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12889351--12889434
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2.9
29
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12889360--12889438
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21
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1.8
93
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4.7
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2.0
20
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6
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2.1
12
100
0
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16
12
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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24
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2.0
42
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55
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2.0
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2.0
157
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2.0
17
88
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52
45
0
0
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0.99
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35
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20
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2.0
25
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3.8
43
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20
25
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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2.0
37
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132
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6
22
40
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13069528--13069571
15
2.9
15
80
12
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11
15
15
56
1.66
13069528--13069584
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2.0
30
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27
15
28
28
1.96
13084424--13084549
42
3.0
42
88
2
173
30
14
26
29
1.95
13084342--13084516
91
1.9
91
84
9
237
28
14
28
29
1.96
13086770--13086818
20
2.4
21
86
3
64
61
0
2
36
1.08
13087398--13087441
20
2.1
21
87
4
63
25
0
4
70
1.06
13087398--13087442
21
2.1
21
84
8
56
24
0
4
71
1.05
13087572--13087618
18
2.5
19
75
3
51
34
0
4
61
1.15
13101043--13101072
15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
13104463--13104539
6
13.5
6
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16
78
20
1
0
77
0.83
13104465--13104532
5
13.4
5
82
16
70
19
1
0
79
0.81
13104465--13104539
21
3.6
21
78
18
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20
1
0
78
0.82
13104463--13104544
27
3.0
27
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107
20
1
0
78
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13107191--13107231
22
1.9
21
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5
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46
19
14
19
1.84
13108782--13108859
26
3.0
26
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0
129
35
24
6
33
1.81
13109217--13109260
20
2.3
19
88
4
61
34
0
2
63
1.07
13110148--13110180
12
2.8
12
95
0
57
27
9
0
63
1.24
13111715--13111830
59
2.0
60
91
1
189
31
22
10
36
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13113222--13113289
30
2.3
30
82
5
75
50
2
17
29
1.61
13118856--13118928
22
3.4
21
81
11
69
28
6
1
63
1.29
13118869--13118975
10
10.5
10
69
15
60
29
5
1
62
1.28
13118869--13119037
9
17.4
9
67
20
51
30
4
1
63
1.25
13118977--13119023
19
2.4
19
85
3
58
36
0
2
61
1.08
13119142--13119354
85
2.4
85
84
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268
35
9
20
34
1.86
13122655--13122692
17
2.3
17
86
4
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42
0
0
57
0.98
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2.8
22
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50
0
0
50
1.00
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2.0
30
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9
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0
5
31
1.16
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21
2.1
22
92
4
76
69
0
0
30
0.89
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31
1.9
31
84
12
81
67
0
3
29
1.06
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44
2.3
44
91
3
166
45
9
5
41
1.57
13125636--13125707
3
24.7
3
79
10
78
34
30
0
34
1.58
13125639--13125680
11
4.0
11
78
12
52
35
23
0
40
1.55
13125636--13125680
14
2.8
17
74
19
60
35
24
0
40
1.56
13130088--13130264
55
3.2
55
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20
154
25
22
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1.96
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32
1.9
32
93
0
106
25
27
20
25
1.99
13130829--13130898
32
2.3
32
80
11
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40
0
2
57
1.14
13131270--13131306
19
1.9
19
88
0
56
10
35
13
40
1.80
13135533--13135678
53
2.7
53
89
4
204
27
15
27
29
1.96
13138391--13138456
19
3.5
19
89
0
105
39
18
34
7
1.79
13138516--13138618
34
3.2
33
72
20
108
49
4
14
31
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13138516--13138643
64
2.0
64
87
6
188
46
6
14
33
1.69
13141450--13141495
18
2.5
19
89
10
78
45
4
0
50
1.21
13141785--13141817
2
16.5
2
100
0
66
0
48
0
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1.00
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17
2.7
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35
0
2
62
1.07
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12
2.5
13
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10
55
22
0
0
77
0.77
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2.0
15
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0
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30
0
0
70
0.88
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27
2.1
26
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5
7
44
1.54
13149116--13149171
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2.1
28
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1.54
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1.9
29
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0
103
37
25
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28
1.86
13156298--13156341
16
2.8
16
83
10
54
40
2
2
54
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343