Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  50  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16602947--16603011
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3.1
20
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8
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18
1.93
16603331--16603499
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1.59
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19
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3
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31
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0
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55
0
0
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16604800--16604833
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55
0
0
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0.99
16627308--16627414
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2.0
54
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25
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1.96
16633825--16633993
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2.0
112
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1.47
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0
0
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2.9
172
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28
23
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1.97
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1.9
18
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5
52
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2
0
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21
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55
0
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19
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37
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19
2.6
19
90
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80
37
2
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47
1.53
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2.3
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81
5
115
29
6
15
48
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2.0
42
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2.1
26
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81
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11
1
51
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
18
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0
0
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0
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61
1.28
16670654--16670757
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40
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16670690--16670783
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3.3
27
73
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19
11
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16671037--16671093
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19
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59
0
1
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16671047--16671091
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20
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0
2
37
1.09
16671106--16671171
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11.5
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0
0
50
1.00
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16671865--16671903
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12
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0
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5
10
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16671923--16672012
6
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6
83
0
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16671930--16672012
18
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60
24
8
15
51
1.71
16671930--16672018
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63
24
8
14
51
1.71
16671931--16672020
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2.1
42
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51
1.71
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64
2.2
64
92
0
226
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15
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1.87
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2.1
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0
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35
1.89
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142
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3.4
38
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1
211
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5
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48
1.57
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21
3.2
21
89
0
100
35
36
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8
1.83
16676031--16676114
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2.3
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4
96
44
25
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22
1.80
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2.2
20
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0
36
0
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16677620--16677680
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32
1
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1.28
16682340--16682394
25
2.2
25
90
0
83
54
5
3
36
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16683632--16683672
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2.0
20
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55
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0
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2.0
28
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1
5
31
1.28
16688430--16688468
17
2.4
16
87
8
53
38
7
7
46
1.61
16688857--16688905
20
2.4
21
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13
57
42
2
2
53
1.24
16688913--16688961
22
2.2
22
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62
61
0
0
38
0.96
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2.3
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13
24
1.93
16692188--16692304
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11
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21
24
19
34
1.97
16692336--16692396
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2.5
24
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10
70
16
26
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36
1.94
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25
20
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2.1
26
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0
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33
1.84
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1.84
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24
2.5
24
86
5
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30
16
30
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16722133--16722265
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68
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16729411--16729458
23
2.1
23
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27
14
14
43
1.84
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0
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0
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2.1
37
97
0
149
32
13
2
50
1.56
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20
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38
4
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42
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5
2
29
1.27
16743141--16743178
17
2.3
17
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50
0
0
50
1.00
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24
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32
1
5
60
1.29
16748717--16748753
16
2.3
16
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13
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0
0
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1.14
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22
100
0
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8
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36
1.80
16750920--16750976
22
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22
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19
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0
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28
4
0
66
1.11
16775839--16775949
56
2.0
56
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3
161
30
6
0
62
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
0
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1.20
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9
9.4
9
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4
0
66
1.11
16777517--16777547
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1.9
16
100
0
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12
25
12
48
1.77
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20
2.5
20
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2
2
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3
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1.12
16785577--16785721
6
22.3
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20
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1.13
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27
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72
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1.98
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2.0
22
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0
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2
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2.0
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110
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5
22
1.78
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2.2
16
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0
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0
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254
33
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1.96
16865008--16865195
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2.3
81
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1
288
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28
16
22
1.95
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1.9
13
100
0
50
24
20
32
24
1.98
16867198--16867251
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1.9
28
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0
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32
2.0
32
85
5
87
43
7
12
36
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16873284--16873327
20
2.2
21
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8
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29
18
6
45
1.75
16873284--16873335
20
2.6
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80
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28
15
7
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1.73
16875808--16875852
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2.0
22
100
0
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0
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20
1.98
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3.8
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29
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20
1.98
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0
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27
29
21
20
1.98
16903126--16903301
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343