Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  313  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101449796--101449879
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3.0
28
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1
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101449800--101449893
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2.0
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11
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16
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
2.4
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1.97
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1.9
22
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11
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16
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1.89
101489811--101489861
21
2.4
21
90
0
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19
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1.88
101489813--101489873
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36
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18
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2.1
25
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0
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0
50
0
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52
16
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
25
0
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1.55
101530371--101530415
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1.9
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35
24
0
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2.0
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2
1
59
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101564177--101564216
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0
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5
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37
0
7
55
1.28
101564738--101564831
23
4.1
23
94
0
170
22
8
10
58
1.58
101568430--101568474
22
2.0
22
95
0
81
28
20
4
46
1.69
101576906--101576983
27
2.9
27
98
0
147
12
25
33
28
1.93
101576828--101577078
131
1.9
131
90
3
407
17
19
31
31
1.95
101576997--101577148
72
2.1
72
90
3
236
23
16
29
30
1.96
101584224--101584447
104
2.2
104
93
1
378
17
19
31
31
1.95
101584366--101584517
71
2.1
72
92
1
252
23
17
29
30
1.97
101586768--101587046
75
3.7
74
84
7
343
30
17
21
29
1.97
101586768--101587046
150
1.9
149
85
8
395
30
17
21
29
1.97
101588103--101588140
18
2.2
17
86
13
51
10
13
0
76
1.02
101588766--101588817
17
3.1
17
91
8
88
36
0
0
63
0.95
101588770--101588817
14
3.4
14
97
2
87
35
0
0
64
0.94
101588767--101588817
3
17.7
3
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8
88
35
0
0
64
0.94
101589083--101589124
9
4.8
9
91
2
59
38
0
4
57
1.20
101589058--101589124
29
2.4
27
78
11
73
37
2
2
56
1.30
101589058--101589126
18
3.7
18
77
9
68
36
2
2
57
1.28
101589201--101589245
22
2.0
22
86
0
63
42
6
4
46
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101589441--101589486
3
15.3
3
100
0
92
32
0
0
67
0.91
101589488--101589513
3
8.7
3
100
0
52
34
0
30
34
1.58
101589511--101589563
21
2.5
21
78
0
61
33
3
9
52
1.52
101589593--101589717
23
5.7
21
72
15
78
35
4
4
55
1.42
101589610--101589717
25
4.6
22
75
18
78
35
4
5
54
1.44
101589673--101589735
22
2.9
22
77
13
58
34
1
6
57
1.34
101601843--101601953
7
16.0
7
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12
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21
2
35
40
1.68
101601825--101601908
41
2.0
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9
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23
4
32
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1.76
101601883--101601951
35
2.0
35
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5
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23
1
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42
1.63
101605464--101605605
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3.4
42
85
1
158
32
29
16
21
1.95
101606081--101606182
23
4.4
23
88
0
150
40
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3
38
1.68
101609306--101609482
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2.8
64
79
10
204
61
11
7
19
1.53
101609339--101609482
63
2.3
61
76
14
141
61
11
6
20
1.53
101610465--101610516
15
3.5
15
78
5
61
46
32
0
21
1.52
101610541--101610603
19
3.3
19
93
2
99
23
4
4
66
1.30
101610980--101611019
21
1.9
21
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0
53
50
20
0
30
1.49
101611025--101611057
14
2.3
15
89
5
50
39
39
0
21
1.53
101611367--101611545
41
4.4
41
86
0
250
20
21
22
35
1.96
101611367--101611575
41
5.1
41
85
1
222
20
20
22
35
1.96
101611367--101611575
82
2.5
82
81
8
253
20
20
22
35
1.96
101615077--101615148
31
2.4
30
84
11
76
77
4
8
9
1.10
101621023--101621089
22
3.0
22
97
0
125
49
1
0
49
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101627523--101627586
22
2.9
22
77
13
60
62
4
0
32
1.16
101627560--101627591
16
2.1
16
94
5
57
56
6
0
37
1.25
101627648--101628089
114
3.9
114
91
3
687
52
15
0
31
1.49
101632299--101632342
21
2.0
22
87
12
65
31
9
4
54
1.52
101632719--101633023
129
2.4
128
80
4
332
26
15
19
39
1.91
101643111--101643239
64
2.0
65
81
6
154
30
17
15
36
1.91
101643311--101643474
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1.9
88
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0
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28
1.97
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2.1
133
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0
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32
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22
24
1.98
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1.9
310
89
0
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31
20
22
26
1.98
101643840--101644452
310
2.0
310
88
1
917
30
20
23
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343