Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  172  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57069937--57070121
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193
26
27
21
24
1.99
57074274--57074452
40
4.5
39
81
10
186
27
27
21
23
1.99
57074274--57074452
78
2.3
80
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210
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27
21
23
1.99
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2.0
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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57134773--57134892
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2.4
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20
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2.1
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57144976--57145397
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13
22
41
1.89
57144976--57145397
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2.5
170
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474
22
13
22
41
1.89
57147561--57147742
46
4.0
46
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285
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2.8
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3.5
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3.5
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57158661--57158777
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2
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2.1
22
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0
0
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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3
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2
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1.22
57159110--57159227
59
2.0
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3
27
1.25
57159143--57159227
10
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16
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67
4
3
24
1.26
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36
70
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104
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5
1
66
1.22
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3.1
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3.2
93
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10
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57222289--57222512
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26
27
22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57230519--57230740
40
5.7
39
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9
231
25
27
22
24
2.00
57230519--57230740
78
2.8
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27
22
24
2.00
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0
113
26
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17
24
1.97
57239763--57240024
47
5.5
47
94
1
434
29
30
8
32
1.87
57240249--57240470
40
5.6
40
85
5
247
25
26
21
27
1.99
57240249--57240466
79
2.7
78
80
8
233
25
25
21
27
1.99
57242485--57242528
22
2.0
22
100
0
88
27
4
4
63
1.33
57249542--57249645
38
2.7
38
81
8
131
25
23
20
31
1.98
57249555--57249674
38
3.1
38
81
2
114
24
22
20
33
1.97
57250834--57250968
60
2.2
60
81
6
148
26
25
20
28
1.99
57250973--57251015
19
2.3
19
84
8
52
34
25
18
20
1.96
57253244--57253272
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
57255074--57255117
18
2.4
18
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7
63
25
50
9
15
1.74
57258728--57258761
15
2.3
15
89
0
50
64
8
0
26
1.22
57258891--57258926
15
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50
0
0
50
1.00
57258998--57259042
11
3.9
11
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11
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60
4
0
35
1.17
57259083--57259123
13
3.5
12
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15
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63
2
0
34
1.08
57260672--57261239
72
7.6
74
76
13
504
31
20
16
30
1.95
57260672--57261095
145
2.9
146
85
6
561
32
20
16
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57271188--57271228
16
2.5
17
84
11
50
56
4
4
34
1.42
57271320--57271450
25
5.7
23
68
23
64
54
5
6
33
1.48
57271417--57271451
18
1.9
18
88
11
54
60
5
0
34
1.21
57271760--57271797
18
2.1
18
90
0
58
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0
34
0
0.93
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3.6
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8
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0
13
0
86
0.57
57273049--57273533
76
6.4
75
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8
570
30
21
17
31
1.96
57273049--57273533
159
3.2
155
82
8
613
30
21
17
31
1.96
57273932--57274412
74
6.4
73
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10
497
31
20
17
30
1.95
57272640--57276165
883
4.0
883
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1
6700
30
21
17
31
1.96
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6.4
72
80
10
434
30
20
17
31
1.96
57274804--57275285
144
3.2
146
82
9
524
30
20
17
31
1.96
57274991--57275285
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3.8
80
80
11
258
28
22
18
30
1.97
57275675--57276174
76
6.6
76
82
7
579
30
20
17
32
1.95
57275675--57276301
74
8.5
74
79
11
591
30
21
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30
1.96
57275675--57276176
158
3.3
152
83
8
635
30
20
16
31
1.95
57276615--57276648
17
1.9
18
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52
5
20
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44
1.75
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19
4.3
19
68
24
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56
5
5
32
1.47
57286417--57286547
23
5.9
22
69
24
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54
5
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33
1.48
57286505--57286547
11
3.9
11
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0
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60
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0
34
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57287024--57287065
12
3.4
12
80
6
57
80
7
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0
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57293593--57293632
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1.9
21
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0
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50
1.23
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132
1.8
132
87
0
360
39
18
16
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57297987--57298020
16
2.1
16
100
0
68
11
17
50
20
1.77
57302353--57302410
26
2.2
26
96
0
107
48
22
22
6
1.74
57303360--57303402
11
4.0
11
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16
2
4
76
1.05
57305127--57305248
6
19.8
6
71
14
88
48
13
18
18
1.81
57305139--57305225
37
2.4
37
88
0
129
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20
19
1.86
57305139--57305248
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3.5
31
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107
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14
20
19
1.84
57305365--57305459
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3.6
26
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35
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23
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1.96
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32
22
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27
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2
472
27
19
18
35
1.94
57308549--57308664
6
18.8
6
70
11
74
48
12
18
21
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343