Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  183  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60924699--60924920
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60924699--60924977
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23
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1
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0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
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227
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0.85
60952643--60952967
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114
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291
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1
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1
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2.5
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2.5
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7
70
1.25
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2.6
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2
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1.01
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0
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3.3
13
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2
2
88
0.67
60953606--60953649
20
2.2
20
91
0
70
6
2
2
88
0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
22
24
2.00
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26
22
24
2.00
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26
27
21
24
1.99
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39
5.7
39
83
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238
25
27
21
24
1.99
60964611--60964830
79
2.8
80
84
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269
25
27
21
24
1.99
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2.1
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226
23
23
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24
22
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2.00
60968621--60968804
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22
26
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2.1
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21
26
26
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4.0
42
75
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141
28
14
23
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61016623--61016661
19
2.0
20
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5
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2.0
15
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4
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4
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1.38
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183
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2
6
49
1.40
61026276--61026327
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
61026662--61026729
16
4.2
16
96
0
127
39
35
0
25
1.56
61027172--61027197
6
4.3
6
100
0
52
50
0
0
50
1.00
61032761--61032801
18
2.3
18
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0
55
39
14
4
41
1.67
61033002--61033082
23
3.6
23
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3
110
34
20
27
17
1.95
61035851--61035910
29
2.1
29
100
0
120
26
13
21
38
1.90
61039780--61039814
18
2.0
17
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45
0
2
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1.16
61042305--61042503
43
4.7
43
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4
215
26
28
17
28
1.97
61042305--61042523
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85
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5
255
27
29
16
26
1.97
61047571--61047624
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2.4
22
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3
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51
20
1
25
1.57
61047575--61047645
22
3.3
22
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2
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47
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1
25
1.60
61047854--61047891
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0
21
1.53
61047842--61047942
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36
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0
130
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0
22
1.61
61047854--61047900
15
3.2
15
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40
40
0
19
1.51
61047880--61047921
21
2.0
22
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4
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42
33
0
23
1.55
61047903--61047937
15
2.4
14
90
4
52
48
31
0
20
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61047954--61048000
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14
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0
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2
21
1.65
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41
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41
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0
128
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19
21
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1.94
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12
3.3
12
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0
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12
10
1.74
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24
2.7
21
76
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24
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50
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1.95
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5
100
25
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1.95
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7
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0
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1.31
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16
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21
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1.94
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2.0
32
100
0
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25
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1.95
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22
2.2
23
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20
20
20
1.92
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2.0
137
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0
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3.7
46
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20
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30
1.98
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1.8
93
93
0
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21
21
28
29
1.98
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19
2.0
20
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36
0
23
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1.55
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46
3.7
46
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10
208
21
20
27
29
1.98
61067400--61067570
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
61067800--61067837
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
61071185--61071231
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4.2
11
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12
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72
2
0
25
0.96
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44
2.0
44
100
0
178
46
2
4
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1.35
61072886--61073007
57
2.1
57
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138
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15
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32
1.92
61072903--61073032
57
2.3
57
80
0
143
31
16
20
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61074514--61074564
22
2.3
22
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0
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17
31
31
19
1.95
61075714--61075817
52
2.0
52
96
0
190
30
19
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38
1.87
61082614--61082791
27
6.6
27
84
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205
29
28
15
26
1.96
61082635--61082790
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
61089075--61089298
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5.6
40
90
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24
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1.99
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3.5
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181
29
18
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3.0
26
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9
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19
22
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1.80
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20
4.2
20
83
6
98
38
15
33
13
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343