Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  220  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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2
2
30
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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17
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1.96
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100
0
88
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72812197--72812235
21
1.9
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5
60
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5
0
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4.2
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4
4
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129
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295
24
17
19
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1.93
72826129--72826180
17
3.1
16
75
8
50
61
0
7
30
1.24
72828726--72828761
15
2.5
15
86
4
56
69
0
30
0
0.89
72832086--72832237
77
2.0
78
93
3
263
31
18
18
31
1.95
72834041--72834106
12
5.4
12
75
10
53
34
4
0
60
1.17
72834257--72834328
10
7.2
10
72
19
53
33
5
1
59
1.29
72846210--72846614
44
9.5
44
84
8
491
30
14
27
27
1.95
72846406--72846468
32
2.0
32
100
0
126
25
19
30
25
1.98
72846362--72846512
76
2.0
76
98
0
293
27
17
29
26
1.97
72846318--72846554
120
2.0
120
94
0
420
29
16
27
27
1.97
72846276--72846580
164
1.9
164
90
1
495
29
15
26
28
1.96
72846234--72846614
208
1.8
208
87
4
563
30
14
27
28
1.95
72848231--72848267
12
3.0
12
84
7
56
35
5
0
59
1.20
72848421--72848493
10
7.2
10
73
18
62
34
5
0
60
1.20
72855231--72855276
22
2.1
22
95
0
83
28
26
2
43
1.66
72860376--72860608
77
3.1
74
85
6
299
55
7
7
29
1.55
72862906--72863142
105
2.4
102
85
9
321
51
16
0
31
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72862922--72863175
98
2.5
101
86
8
331
50
16
0
32
1.48
72863374--72863486
58
1.9
59
85
7
158
50
14
2
32
1.56
72863653--72863725
25
2.9
25
76
17
71
0
26
0
73
0.83
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18
2.1
18
95
0
67
52
7
10
28
1.64
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14
1.9
14
100
0
54
51
0
7
40
1.30
72901098--72901123
9
2.9
9
100
0
52
53
34
0
11
1.37
72912165--72912199
18
1.9
18
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0
52
65
0
8
25
1.21
72913911--72913941
5
6.2
5
100
0
62
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0
0
22
0.77
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15
3.3
15
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17
59
38
4
0
58
1.17
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21
2.0
20
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5
53
47
27
0
25
1.52
72941545--72941623
38
2.1
38
100
0
158
29
22
15
32
1.95
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15
2.0
17
88
11
50
43
28
0
28
1.55
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23
1.9
23
85
4
61
46
25
4
23
1.71
72954242--72954398
43
3.7
43
79
12
171
30
24
19
25
1.98
72954242--72954411
86
2.0
84
83
5
200
32
24
18
24
1.97
72965969--72966161
40
4.8
40
90
1
289
22
21
30
25
1.99
72979409--72979459
26
2.0
26
88
0
75
39
19
15
25
1.91
72983269--72983408
41
3.4
41
84
0
172
32
15
30
21
1.94
72983342--72983408
21
3.2
21
65
12
57
28
16
31
23
1.96
72990464--72990496
13
2.5
13
95
0
57
27
33
18
21
1.96
72992533--72992588
28
2.0
28
96
0
103
44
10
0
44
1.38
72993565--72993675
58
1.9
58
98
0
213
24
20
14
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73002069--73002150
26
3.2
26
96
0
155
30
6
26
36
1.81
73005351--73005381
12
2.6
12
94
0
53
12
25
48
12
1.77
73010211--73010318
26
4.2
26
95
0
198
31
6
25
36
1.82
73018051--73018083
17
1.9
18
88
11
52
45
0
12
42
1.41
73022792--73022874
43
1.9
43
95
0
148
34
7
14
43
1.73
73022804--73022892
43
2.1
42
85
8
117
37
7
13
41
1.74
73023926--73024137
46
4.6
46
80
8
218
27
20
30
21
1.98
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48
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27
19
28
24
1.99
73034436--73034703
94
2.9
94
81
11
302
26
19
30
23
1.98
73034565--73034789
96
2.4
92
78
12
224
27
18
28
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343