Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  244  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80805703--80806026
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0
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21
1.98
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2.1
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1.99
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5.0
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0
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20
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2
0
54
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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80876260--80876344
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19
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3
0
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1.18
80876335--80876381
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2
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2.1
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5
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181
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22
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2.0
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18
2.0
18
88
0
54
33
22
16
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
18
30
1.62
80918878--80918986
28
3.8
28
79
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52
4
15
27
1.62
80918876--80918983
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1.9
57
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4
16
27
1.65
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2.4
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3
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100
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18
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5
0
21
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80977091--80977142
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0
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30
1.02
80977091--80977142
21
2.3
23
87
9
72
67
0
1
30
1.02
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1.9
16
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0
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83
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0
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1.97
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28
19
25
1.98
80984330--80984413
42
2.0
42
97
0
159
30
20
22
26
1.98
80984672--80984720
24
2.0
24
92
0
80
40
4
6
48
1.47
80990135--80990250
50
2.4
47
82
5
135
27
21
15
35
1.94
80994317--80994501
40
4.7
40
89
4
234
26
27
21
24
1.99
80999104--80999161
30
1.9
30
85
0
80
25
31
25
17
1.97
81003163--81003354
43
4.5
43
80
5
176
34
28
13
24
1.92
81003161--81003354
86
2.3
87
77
11
202
35
27
12
24
1.92
81007402--81007438
9
4.0
9
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13
8
0
78
0.96
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0
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0
0
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19
0
0
80
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81008062--81008110
24
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24
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0
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4
0
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1.20
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0
52
1.21
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41
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2
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21
21
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1.97
81012705--81012814
51
2.2
51
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0
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1.82
81012944--81013021
33
2.4
33
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0
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26
41
3
28
1.73
81013484--81013694
117
1.8
117
92
0
359
43
24
9
22
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81014339--81014413
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38
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0
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16
2.3
16
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0
0
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0.97
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5
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5
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0
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0
0
60
0.97
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30
2.0
30
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9
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59
6
34
0
1.24
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39
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39
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20
27
28
1.99
81030499--81031251
372
2.0
372
95
0
1362
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1.93
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44
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1.93
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18
29
1.93
81044012--81044330
139
2.3
138
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374
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15
19
30
1.94
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2.7
43
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1.77
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6.5
6
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0
0
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58
0
0
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2.0
30
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0
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1
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1.45
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12
3.0
12
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13
11
16
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1.63
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2.3
26
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0
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18
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1.95
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8
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81079065--81079107
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17
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9
9
2
79
1.03
81079070--81079106
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56
10
10
0
78
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38
2.0
36
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10
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21
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4
68
1.30
81079151--81079198
18
2.7
17
75
9
51
27
4
2
66
1.21
81079200--81079273
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3.4
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10
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41
0
2
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1.14
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23
4.0
23
73
12
78
41
0
2
56
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81079531--81079577
18
2.8
18
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15
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59
0
0
40
0.97
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27
2.7
26
81
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48
2
1
47
1.24
81079750--81079815
26
2.5
27
85
2
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50
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2.0
19
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0
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2.1
21
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2
0
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1.10
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55
0
0
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18
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30
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13
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38
2
0
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1.13
81086776--81086820
19
2.4
18
82
10
54
51
2
4
42
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343