Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  6  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2079689--2079714
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2.0
13
100
0
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0
23
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0
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0
0
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2.1
28
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3
1
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1.25
2089769--2089857
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3.1
28
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10
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49
0
1
49
1.08
2089862--2089894
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2.1
16
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0
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39
0
0
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10
0
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2093524--2093565
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17
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52
0
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2.0
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3
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1
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2.1
32
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2
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2.1
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50
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2.0
21
90
0
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29
21
29
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16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
2121434--2121478
23
2.0
23
90
0
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28
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11
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2126482--2126530
25
2.0
25
95
0
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28
4
28
38
1.75
2126940--2127017
4
19.8
4
93
2
122
25
2
24
47
1.65
2128419--2128991
196
2.9
196
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5
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21
16
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18
2.7
18
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10
22
60
8
1.55
2136770--2136804
9
3.9
9
88
0
52
8
20
65
5
1.40
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13
2.4
14
90
5
50
45
9
3
42
1.51
2145418--2145465
24
2.0
24
87
0
69
33
37
6
22
1.80
2145427--2145609
57
3.3
57
89
2
255
28
39
8
23
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2145550--2145602
24
2.2
24
89
0
79
24
43
9
22
1.83
2148329--2148354
2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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48
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0
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29
25
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29
1.96
2149785--2149973
94
2.0
94
97
0
360
31
20
14
33
1.92
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21
1.9
20
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5
60
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5
2
33
1.33
2151845--2151923
33
2.5
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80
17
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3
1
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1.20
2153429--2153514
31
2.8
31
75
19
90
43
13
13
29
1.83
2156553--2156587
11
2.8
13
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16
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34
8
0
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1.29
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2.1
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14
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1.73
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7
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100
0
58
44
0
0
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10
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2
26
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0
0
67
0.91
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19
2.2
19
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57
36
0
0
63
0.95
2168487--2168534
17
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15
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21
51
31
0
0
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0.90
2174416--2174592
50
3.5
50
91
0
273
35
15
22
25
1.94
2174568--2174716
31
4.8
31
94
0
253
27
18
26
26
1.98
2174734--2174894
47
3.4
46
83
4
160
27
14
27
30
1.95
2174816--2174948
48
2.9
48
83
10
163
30
14
25
29
1.95
2193671--2193709
18
2.2
18
95
0
69
48
7
30
12
1.69
2203628--2203695
31
2.2
30
82
14
86
39
1
7
51
1.39
2204723--2204784
31
2.0
31
81
6
72
37
4
9
48
1.57
2214137--2214173
15
2.6
15
87
8
51
51
2
0
45
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2220159--2220222
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2.1
30
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42
0
10
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1.39
2228531--2228598
32
2.1
32
97
0
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17
20
17
44
1.87
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2.0
56
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20
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15
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15
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19
50
44
0
1
53
1.11
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16
2.3
16
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13
58
40
0
0
59
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72
2.2
73
80
10
166
48
0
2
48
1.19
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22
2.0
22
90
0
70
45
0
0
54
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2.0
20
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5
53
0
5
10
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4.9
9
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2
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6
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1.82
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0
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0
32
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2.1
29
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0
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8
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1.63
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2.2
18
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0
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0
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17
1.44
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7
100
0
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88
0
11
0
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2
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2282460--2282554
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1.9
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0
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2
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2.0
32
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18
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1.62
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0
0
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25
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11
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1
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1.57
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26
4.0
26
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0
172
35
23
7
33
1.83
2326036--2326137
26
4.0
25
87
2
141
38
23
4
33
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2326034--2326137
52
2.0
52
90
3
165
37
23
5
33
1.79
2327386--2327440
27
2.0
27
100
0
110
14
14
29
41
1.85
2332831--2332910
30
2.7
29
84
9
90
43
7
2
46
1.45
2334791--2334854
33
1.9
33
100
0
128
31
28
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34
1.82
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22
1.9
22
95
0
75
21
19
4
54
1.62
2338429--2338929
214
2.4
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91
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817
43
7
9
38
1.67
2346243--2346299
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2.6
22
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8
71
42
0
0
57
0.98
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1.9
19
88
0
56
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5
2
24
1.25
2349062--2349116
25
2.2
26
83
9
69
49
5
1
43
1.36
2350208--2350248
19
2.1
20
86
4
57
63
4
0
31
1.15
2350311--2350347
14
2.4
16
86
8
51
48
0
0
51
1.00
2352494--2352550
3
19.0
3
92
0
87
61
0
5
33
1.18
2360535--2360596
30
2.1
30
90
0
97
30
3
6
59
1.38
2360720--2360754
12
2.9
12
91
0
52
68
0
0
31
0.90
2363264--2363342
40
1.9
42
82
12
101
37
20
15
26
1.92
2373495--2373554
25
2.3
26
82
2
68
26
25
26
21
2.00
2373507--2373563
26
2.2
24
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11
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24
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26
22
2.00
2375569--2375694
51
2.5
50
77
12
123
34
15
10
39
1.81
2376264--2376309
20
2.4
19
89
7
74
56
28
2
13
1.48
2380737--2380963
40
5.7
40
89
0
319
33
26
19
19
1.96
2387955--2388015
30
2.1
29
84
9
79
52
6
19
21
1.68
2389465--2389504
20
2.0
20
85
9
55
72
5
0
22
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2389562--2389596
11
3.2
11
88
11
54
0
54
0
45
0.99
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3
22.3
3
73
8
57
30
0
7
61
1.23
2390070--2390141
23
3.1
23
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11
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31
1
11
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1.43
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13
3.8
13
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20
50
28
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0
64
1.22
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3
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0
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0
0
70
0.88
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20
3.2
20
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15
67
33
3
1
61
1.22
2390942--2391036
18
5.1
19
67
23
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36
11
1
50
1.46
2395348--2395452
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0
11
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16
2.9
16
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51
53
17
2
27
1.55
2395818--2395864
19
2.4
20
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10
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63
2
2
31
1.18
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6
5.5
6
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0
57
78
0
0
21
0.75
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2.2
18
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0
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0
2
23
0.94
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3
17.0
3
76
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60
7
0
31
1.25
2396297--2396325
15
1.9
15
100
0
58
55
10
0
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1.34
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4.6
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57
9
0
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1.31
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11
3.2
12
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11
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47
0
52
0
1.00
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9
6.7
9
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3
57
15
0
3
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0.82
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35
1.9
34
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3
98
22
0
4
73
1.01
2397977--2398439
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5.3
87
72
12
326
26
22
20
30
1.98
2397972--2398484
44
11.7
43
74
9
321
26
21
20
31
1.98
2397922--2398270
177
2.0
178
86
2
488
27
22
19
30
1.98
2398101--2398488
214
1.8
213
89
1
607
26
22
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2410744--2410847
38
2.8
36
76
13
95
51
0
11
35
1.45
2411214--2411278
17
3.6
17
75
17
60
61
3
3
32
1.27
2411214--2411327
20
5.7
19
71
17
63
58
1
3
35
1.25
2411200--2411324
20
6.2
19
68
23
62
58
1
4
36
1.26
2411526--2411558
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5.5
6
92
0
57
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0
0
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0.75
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18
2.2
18
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0
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74
0
2
23
0.94
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3
17.0
3
76
12
50
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6
0
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1.20
2411677--2411730
17
3.1
17
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7
0
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1.24
2411687--2411721
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9
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5
0
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1.21
2412195--2412230
11
3.2
12
88
11
58
47
0
52
0
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343