Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  189  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62691256--62691313
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2.1
27
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0
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10
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4.2
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223
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2.1
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0
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1.9
19
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1
437
27
29
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1.86
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2.9
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2.7
16
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0
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1.04
62778754--62778800
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5.4
9
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12
55
17
8
0
74
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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7
0
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1.11
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12
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2
0
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0.81
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2.6
43
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1.93
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1.9
18
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1.00
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0
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0
0
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2.0
72
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1
270
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16
11
30
1.83
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18
2.2
17
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2
12
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2.1
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100
0
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37
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60
1.10
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20
28
21
1.98
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21
2.0
21
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55
15
35
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25
1.94
62799722--62799761
21
2.0
21
95
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20
30
40
10
1.85
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2.8
12
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2.1
15
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53
50
6
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2.0
28
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20
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14
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40
0
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1.11
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10.0
7
75
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40
1
1
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1.17
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35
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2
2
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3.7
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206
22
21
28
28
1.99
62823900--62824070
93
1.8
93
94
0
306
21
21
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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0
4
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0
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0
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0
0
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2.1
30
90
0
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25
1.58
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3.6
11
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0
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62
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20
1.50
62829916--62829958
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2.0
22
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0
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18
1.50
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0
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15
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1.74
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26
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17
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1.95
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18
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12
72
25
26
19
28
1.98
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2.3
39
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1.97
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20
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1.95
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1.99
62859401--62859623
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21
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1.97
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24
3.1
23
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26
57
36
6
1
56
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62884989--62885025
8
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0
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86
0
13
0
0.57
62885966--62886108
43
3.3
43
73
14
141
32
23
20
23
1.98
62885955--62886163
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2.5
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85
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291
32
23
22
22
1.98
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12
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3
0
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1.14
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1
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19
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1
0
61
1.07
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31
3.0
35
71
21
99
34
4
0
60
1.18
62888646--62888680
16
2.3
15
90
5
52
40
2
0
57
1.14
62893590--62893793
53
3.8
53
75
3
165
37
18
23
21
1.94
62899709--62899910
9
21.6
9
69
17
74
30
3
1
64
1.19
62905385--62905450
24
2.7
25
83
4
82
22
15
27
34
1.94
62913373--62913433
24
2.5
24
86
5
79
19
16
29
34
1.94
62915344--62915489
24
6.1
24
75
5
116
46
22
13
17
1.83
62920019--62920316
19
15.0
20
66
22
123
31
4
1
62
1.22
62920010--62920316
36
8.4
36
67
21
144
31
4
0
62
1.22
62920019--62920220
52
3.7
54
75
9
173
31
3
0
63
1.19
62920014--62920141
58
2.2
57
81
9
154
29
2
1
66
1.13
62920022--62920215
108
1.8
103
80
5
226
30
4
1
64
1.19
62920014--62920179
56
3.1
53
77
9
149
30
3
1
65
1.17
62920053--62920215
67
2.5
64
79
7
157
31
4
0
63
1.18
62920168--62920220
17
3.3
17
80
17
60
33
5
0
60
1.20
62920028--62920321
9
30.7
10
67
23
102
31
4
1
62
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62920012--62920321
12
24.6
12
67
26
107
30
4
0
63
1.22
62920020--62920148
20
6.6
21
68
22
77
30
1
1
66
1.10
62920266--62920331
35
1.9
35
81
9
82
33
0
3
63
1.10
62922077--62922119
18
2.3
19
88
4
61
48
9
6
34
1.62
62927387--62927466
38
2.1
38
88
4
117
21
22
27
28
1.99
62927438--62927622
43
4.3
43
88
1
257
12
22
33
31
1.91
62927943--62928050
45
2.5
42
82
8
110
24
23
25
26
2.00
62929265--62929306
21
2.0
21
81
9
50
35
9
26
28
1.88
62932113--62932404
96
3.1
94
84
8
398
49
8
10
31
1.68
62932606--62932654
17
2.9
17
87
0
71
38
6
2
53
1.38
62933983--62934522
268
2.0
269
89
0
830
35
17
16
30
1.92
62937307--62937425
44
2.8
41
81
8
123
23
19
28
28
1.98
62937307--62937458
43
3.6
41
78
12
128
25
18
26
28
1.98
62937354--62937458
42
2.5
42
80
10
115
27
18
25
28
1.98
62942062--62942135
13
5.6
13
72
3
67
40
4
20
35
1.71
62955490--62955596
43
2.5
43
85
0
142
26
16
26
30
1.97
62958362--62958507
43
3.4
42
80
3
166
31
26
15
26
1.96
62960051--62960124
26
2.7
26
75
22
78
21
16
24
37
1.93
62962323--62962475
42
3.6
42
83
1
189
28
24
16
31
1.96
62966947--62967012
28
2.6
24
78
19
80
30
30
13
25
1.94
62966961--62967040
28
2.9
28
87
7
101
33
27
12
26
1.92
62969032--62969113
27
3.0
27
83
3
94
26
25
15
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62970917--62970982
28
2.4
26
73
16
71
40
19
19
19
1.91
62975966--62976005
16
2.5
16
95
0
71
30
12
10
47
1.74
62978395--62978424
16
1.9
15
93
6
51
36
10
20
33
1.86
62978487--62978568
25
3.3
25
88
6
105
26
23
23
26
2.00
62978777--62978867
38
2.7
31
75
22
103
36
16
23
24
1.94
62979116--62979166
23
2.2
24
96
3
95
15
9
0
74
1.06
62979123--62979183
27
2.3
25
81
13
68
16
8
3
72
1.23
62986519--62986548
16
1.9
15
93
6
51
36
10
20
33
1.86
62986609--62986679
25
2.8
25
87
4
81
28
22
21
28
1.99
62986619--62986687
25
2.8
25
86
4
86
28
21
18
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343