Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  300  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98223843--98223884
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21
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3.1
45
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27
13
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2.2
202
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2.4
200
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19
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98256162--98256219
22
2.6
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26
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20
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224
2.5
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2.0
19
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4.9
19
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12
37
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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110
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10
32
42
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98282364--98282399
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1
44
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18
8.9
18
66
18
76
54
2
0
42
1.19
98292692--98292738
23
2.0
24
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65
21
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6
1.38
98294991--98295098
26
4.2
26
91
0
180
32
8
24
35
1.85
98301780--98301887
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
98305203--98305294
45
2.3
39
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93
58
1
4
35
1.25
98305208--98305305
44
2.2
43
84
10
119
58
1
4
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1.24
98305186--98305304
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16
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59
0
4
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1.22
98305341--98305370
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16
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3
0
33
1.11
98307573--98307873
128
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5
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18
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1.91
98313762--98313792
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0
53
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1.97
98315715--98315811
46
2.1
46
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0
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28
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1.82
98315784--98316115
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47
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27
28
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1.89
98315943--98316020
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25
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29
69
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29
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30
1.88
98315921--98315995
22
3.3
22
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29
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30
1.90
98322243--98323187
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10.8
87
84
3
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34
21
22
21
1.96
98322339--98322574
44
5.4
44
67
7
140
38
20
20
20
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98322382--98322789
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44
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36
22
22
19
1.95
98323112--98323214
45
2.3
44
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6
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31
20
19
29
1.97
98323199--98323323
45
2.8
45
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7
173
31
16
23
28
1.96
98325807--98326109
127
2.4
127
85
4
398
25
17
18
38
1.92
98328913--98329007
9
10.4
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5
1
31
1.24
98328938--98329007
19
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19
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4
0
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1.13
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27
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3
0
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1.20
98328933--98329007
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36
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4
0
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1.12
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2
0
33
1.08
98335902--98335976
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18
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11
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64
2
0
33
1.08
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11
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11
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32
0
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1.08
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19
3.2
18
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32
1
3
62
1.21
98336549--98336630
10
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20
51
34
1
6
58
1.31
98336564--98336643
19
4.2
18
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35
1
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19
2.3
19
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34
0
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19
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1.29
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26
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0
175
33
5
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1.78
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128
1.8
127
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360
33
16
18
31
1.94
98342186--98342227
11
3.7
11
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71
0
2
26
0.98
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2.5
21
80
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70
0
3
25
1.04
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2.0
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101
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70
2.1
70
94
2
258
19
15
15
50
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98347388--98347418
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2.1
15
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0
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0
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32
1.09
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132
4.0
131
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5
448
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24
20
31
1.98
98357900--98357941
11
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11
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21
4
0
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1.01
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2.0
22
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8
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6
0
50
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18
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2
0
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3
2
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98362196--98362432
9
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0
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1.20
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29
2.8
29
78
15
80
31
1
7
60
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343