Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  16  of  343  ( 41150 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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208
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2.0
106
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2
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.4
17
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20
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65
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1.16
5740865--5740903
17
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20
0
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21
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0
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1.30
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2.5
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20
1.80
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47
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0
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2
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1.9
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0
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4.2
6
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0
50
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0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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126
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0
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17
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1.08
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0
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4.7
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25
20
26
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2.0
310
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177
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133
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1
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22
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1.99
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1.9
443
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21
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5803326--5803463
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3.5
40
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0
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21
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1.91
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19
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0
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20
20
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2
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15
7.2
13
69
25
50
27
8
1
62
1.36
5821330--5821392
29
2.2
28
78
13
65
28
9
1
60
1.37
5821359--5821398
17
2.5
17
88
8
57
27
7
2
62
1.35
5821290--5821437
23
6.7
22
68
20
69
28
6
2
62
1.35
5826552--5826603
16
3.3
15
78
7
50
82
7
5
3
0.93
5828456--5828552
44
2.2
46
81
10
121
32
18
21
26
1.97
5828346--5829621
178
7.2
177
89
1
1723
31
18
21
28
1.97
5829611--5830116
44
11.5
44
64
18
205
30
21
24
23
1.99
5829960--5830176
44
4.9
44
65
11
113
31
21
25
21
1.98
5829620--5830181
88
6.4
88
89
1
813
30
21
25
22
1.98
5830677--5830764
35
2.5
34
80
10
106
19
15
10
54
1.69
5832304--5832365
29
2.1
30
87
3
90
51
4
6
37
1.49
5832354--5832414
24
2.5
23
82
12
70
54
3
13
29
1.55
5832511--5832545
16
2.1
17
89
5
54
51
22
0
25
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5832543--5832644
21
4.8
21
77
16
102
58
1
3
35
1.28
5832541--5832656
22
5.3
21
77
15
94
60
1
3
34
1.24
5832539--5832657
44
2.7
44
83
11
138
60
1
3
34
1.23
5832862--5832901
17
2.2
20
86
13
59
52
12
0
35
1.39
5832858--5832889
17
1.9
16
93
6
55
53
12
0
34
1.39
5832891--5833054
3
54.7
3
68
18
92
60
2
5
31
1.32
5833581--5833613
9
3.8
9
88
8
50
12
3
0
84
0.72
5834924--5835386
75
6.3
72
82
7
450
33
19
17
30
1.94
5834965--5835372
145
2.8
143
80
6
453
32
20
17
30
1.95
5834845--5835469
231
2.7
229
78
8
682
34
19
17
28
1.95
5841728--5841845
42
2.8
42
80
6
121
26
16
25
32
1.96
5843350--5843450
30
3.3
29
74
14
87
26
6
0
66
1.17
5843325--5843479
73
2.1
72
78
15
160
25
7
1
65
1.25
5849928--5849962
18
1.9
18
94
0
61
28
5
5
60
1.43
5858780--5858882
48
2.2
48
96
1
190
24
20
2
52
1.60
5867724--5867833
26
4.2
26
96
0
175
36
25
5
32
1.79
5871948--5872511
73
7.7
73
79
7
526
35
21
14
28
1.93
5871951--5872466
110
4.7
109
81
7
510
35
21
14
28
1.93
5871948--5872505
37
15.2
37
80
7
525
35
21
14
28
1.93
5871948--5872505
109
5.1
111
81
8
527
35
21
14
28
1.93
5880220--5880269
20
2.5
20
100
0
100
38
14
0
48
1.44
5883042--5883116
31
2.4
31
78
14
82
40
0
4
56
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5884804--5884907
33
3.2
32
77
15
115
39
12
21
26
1.89
5884909--5885048
31
4.5
31
85
3
201
30
15
27
27
1.96
5884909--5885048
62
2.3
62
91
0
226
30
15
27
27
1.96
5885156--5885220
27
2.4
27
92
0
103
38
13
26
21
1.91
5885275--5885348
34
2.2
34
90
0
112
25
12
28
33
1.92
5891805--5891846
20
2.1
20
86
0
57
61
2
4
30
1.29
5891804--5891843
14
3.2
13
83
16
57
62
2
5
30
1.29
5891775--5891871
53
1.9
52
80
19
118
59
2
9
28
1.39
5891808--5891912
3
35.0
3
70
14
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57
0
9
32
1.38
5892178--5892374
3
65.3
3
66
15
50
59
2
6
31
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343