Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  22  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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100
0
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2.0
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2.0
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58
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2.0
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137
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19
24
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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15
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28
3.7
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2.0
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2.0
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0
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23
25
1.80
7516490--7516574
30
2.8
30
96
0
152
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7
23
24
1.78
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0
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19
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5
0
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1.95
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2.6
23
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50
14
3
32
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
17
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18
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0
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0
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27
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1
3
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1.9
19
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11
56
68
0
8
22
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7618595--7618684
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0
4
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104
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1
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31
31
19
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10
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29
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80
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24
7
38
1.82
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24
20
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0
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16
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0
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78
0
18
3
0.87
7640506--7640696
20
9.6
20
71
16
103
18
15
9
55
1.68
7640779--7640819
21
2.0
21
90
4
66
19
12
14
53
1.72
7641207--7641249
20
2.2
20
91
4
70
51
9
9
30
1.65
7641286--7641347
20
3.1
20
79
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59
8
11
20
1.57
7641295--7641483
20
9.8
20
63
14
56
51
9
17
20
1.73
7645076--7645204
33
3.9
33
77
2
125
44
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1.85
7645044--7645208
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2
204
46
14
20
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1.83
7645193--7645261
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0
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15
1.80
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1
201
20
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1.99
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22
2.1
21
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4
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44
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7652745--7652790
23
2.0
23
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4
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34
1.57
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5
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0
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0
0
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2
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2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7660997--7661110
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39
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2
120
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19
29
1.96
7661206--7661261
29
2.0
29
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6
89
12
0
33
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1.39
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14
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14
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0
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2
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1.68
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27
3.5
28
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5
128
32
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0
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0
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1.85
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21
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9
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2.0
27
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0
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2
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0
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0
0
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2.0
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1.91
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37
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22
1.95
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21
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28
0
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1.56
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0
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1.57
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22
2.9
22
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74
19
0
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0
0
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2.3
24
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0
0
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29
0
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1.58
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85
2.1
86
83
3
223
28
15
27
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7695474--7695676
43
4.7
43
84
2
221
28
15
28
27
1.96
7695732--7695774
22
2.0
22
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0
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20
9
1.83
7698821--7698853
9
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4
50
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0
3
18
0.87
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0
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2
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0
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1.99
7710722--7710764
21
2.0
21
95
0
77
11
27
32
27
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343