Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  43  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14152573--14152611
20
1.9
21
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5
62
41
20
0
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1.53
14161460--14161504
22
2.0
22
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0
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31
17
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1.80
14161881--14161920
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2.3
18
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16
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37
15
0
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1.45
14169124--14169184
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2.5
24
89
5
88
32
27
16
22
1.96
14172680--14172897
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40
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2
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23
22
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25
2.00
14174686--14174725
17
2.3
18
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16
57
37
15
0
47
1.45
14180304--14180334
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2.1
15
100
0
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2.1
22
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34
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1.75
14181223--14181340
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0
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0
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2.0
16
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0
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59
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26
96
0
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0
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0
0
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100
0
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0
0
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3
3
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1.27
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30
2.8
30
78
7
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48
1
9
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1.43
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32
2.2
32
85
5
90
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5
2
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1.29
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3
16.0
3
100
0
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33
0
0
66
0.92
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5.0
16
71
14
51
48
6
18
27
1.72
14217263--14217415
37
4.1
37
94
0
270
24
30
18
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14217534--14217989
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9.6
47
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2
723
29
30
7
32
1.86
14217534--14217989
96
4.8
96
93
1
776
29
30
7
32
1.86
14217534--14217989
143
3.2
141
91
3
723
29
30
7
32
1.86
14221734--14222438
37
18.6
40
84
10
837
26
27
21
24
1.99
14221797--14222438
150
4.3
156
87
9
867
26
27
21
25
1.99
14221747--14222439
263
2.6
265
85
9
870
26
27
21
24
1.99
14223598--14223736
38
3.8
37
90
3
219
27
30
17
25
1.97
14223861--14224310
47
9.6
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14
473
29
29
8
32
1.86
14224099--14224310
49
4.3
49
89
5
306
30
28
7
33
1.85
14225214--14225259
22
2.0
23
87
4
67
28
32
8
30
1.87
14225440--14226066
40
15.7
40
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1
1042
25
27
22
25
2.00
14227261--14227413
37
4.1
37
93
0
261
25
30
18
25
1.98
14227532--14227987
47
9.6
47
93
2
750
28
29
8
32
1.86
14227532--14227987
96
4.8
96
94
1
803
28
29
8
32
1.86
14239423--14239483
31
2.0
31
90
0
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36
26
26
11
1.90
14241769--14242006
47
5.1
47
91
1
334
33
10
29
26
1.90
14241817--14241894
25
3.2
25
64
29
69
30
10
29
29
1.90
14241842--14241916
22
3.3
22
64
29
57
30
13
30
25
1.94
14241980--14242070
46
2.0
46
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0
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34
8
30
26
1.87
14242416--14242562
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2.0
72
100
0
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31
13
21
33
1.92
14246826--14246897
36
2.0
36
97
0
135
27
15
18
38
1.90
14249474--14249513
14
2.9
14
88
0
62
30
12
20
37
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14249494--14249586
14
6.6
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2
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36
18
12
32
1.89
14249475--14249585
28
3.9
28
78
2
96
35
17
14
33
1.90
14250897--14250966
35
2.0
35
94
0
122
35
27
12
24
1.92
14255990--14256152
85
1.9
86
86
3
231
31
20
17
30
1.96
14259601--14259652
27
2.0
27
88
3
79
59
7
0
32
1.26
14261888--14261961
28
2.6
28
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68
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18
1.31
14261977--14262021
23
2.0
23
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0
63
64
0
2
33
1.06
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2.3
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361
30
15
14
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1.87
14263411--14263456
16
2.8
16
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2
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1.62
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2.2
24
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53
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34
1.48
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2.1
34
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2
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1.80
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5
69
20
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58
2
2
36
1.24
14272187--14272268
16
5.2
16
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22
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58
2
2
36
1.24
14272228--14272266
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14
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64
2
0
33
1.08
14272416--14272474
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26
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0
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1.12
14272404--14272474
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14272395--14272439
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15
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2
0
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1.04
14272407--14272474
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13
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1.20
14273958--14273998
21
2.0
21
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0
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36
14
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1.74
14275938--14275981
18
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18
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1.76
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16
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51
6
3
39
1.42
14276924--14276960
18
2.1
18
94
0
65
32
13
10
43
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14277756--14277822
32
2.1
31
83
8
82
40
4
0
55
1.20
14278048--14278113
31
2.1
31
86
5
89
37
16
4
40
1.69
14282769--14283033
145
1.8
145
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1
433
45
20
4
29
1.71
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13
70
45
0
2
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0
3
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1.16
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50
65
0
0
34
0.93
14292282--14292385
26
4.0
26
92
0
172
32
6
24
36
1.81
14299329--14299436
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
14303348--14303512
77
2.1
77
95
2
296
55
7
10
26
1.61
14305437--14305534
46
2.2
46
81
1
108
29
16
20
33
1.94
14305461--14305757
45
6.6
45
70
8
165
26
20
20
32
1.97
14305518--14305713
44
4.4
44
72
12
148
28
19
21
30
1.97
14305471--14305762
135
2.2
135
91
1
478
27
19
20
32
1.97
14305856--14305986
45
2.9
45
79
4
140
27
25
18
29
1.98
14306385--14306490
46
2.3
46
82
4
133
24
25
15
34
1.94
14318422--14318578
78
2.0
77
95
1
278
58
8
8
24
1.56
14318805--14318854
25
2.0
25
92
0
82
52
16
4
28
1.61
14324156--14324200
18
2.6
18
85
3
65
75
0
0
24
0.80
14328447--14328489
22
2.0
22
85
0
59
53
6
16
23
1.67
14335097--14335142
14
3.4
14
74
14
51
52
4
4
39
1.41
14342211--14342266
26
2.2
26
96
0
103
30
8
26
33
1.87
14347297--14347516
110
2.0
110
97
0
413
21
27
16
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14352468--14352501
14
2.4
14
100
0
68
17
0
38
44
1.49
14366249--14366387
55
2.5
54
79
4
154
27
31
26
14
1.95
14366878--14366927
24
2.1
24
96
0
91
20
46
12
22
1.83
14370284--14370316
11
2.8
12
86
9
50
54
24
0
21
1.45
14375572--14375609
18
2.1
18
95
0
67
50
28
5
15
1.66
14376396--14376498
50
2.1
50
100
0
206
29
13
13
43
1.82
14377727--14377777
25
2.0
25
96
0
93
56
1
23
17
1.51
14378704--14378744
21
2.0
21
85
0
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12
36
29
21
1.90
14379938--14379970
9
3.7
9
100
0
66
9
24
0
66
1.20
14387210--14387248
15
2.4
17
83
12
55
66
0
28
5
1.12
14392854--14392916
28
2.2
30
82
5
76
39
11
3
46
1.55
14399992--14400037
19
2.5
18
82
6
56
47
10
2
39
1.51
14405444--14405477
17
2.0
17
88
0
50
26
11
17
44
1.83
14405555--14405591
18
2.1
18
94
0
65
29
21
13
35
1.92
14406817--14406841
8
3.1
8
100
0
50
0
12
0
88
0.53
14407069--14407112
20
2.2
20
83
4
52
20
4
0
75
0.98
14407108--14407175
22
3.1
22
74
19
79
38
1
0
60
1.06
14407152--14407184
16
2.0
17
88
5
50
45
0
0
54
0.99
14407152--14407350
99
2.0
97
80
9
217
49
2
3
44
1.30
14407553--14407621
21
3.0
23
72
12
61
57
0
2
39
1.13
14407526--14407637
58
2.0
57
86
8
160
56
2
2
38
1.28
14408545--14408580
18
2.1
18
90
10
58
55
5
16
22
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14410471--14410510
19
2.1
19
95
0
71
10
20
22
47
1.79
14410724--14410769
22
2.2
22
88
7
69
36
0
2
60
1.09
14414344--14414533
93
2.1
90
78
6
204
27
18
17
35
1.94
14416633--14416675
17
2.3
19
88
11
63
37
2
2
58
1.24
14417372--14417416
23
2.0
23
95
0
81
26
6
6
60
1.47
14418300--14418346
25
2.0
25
83
8
62
27
12
4
55
1.56
14418607--14418872
46
6.0
46
85
7
343
21
24
15
38
1.92
14418786--14418861
38
2.0
38
100
0
152
23
26
18
31
1.97
14420992--14421071
27
3.0
27
71
20
69
55
3
1
40
1.26
14424083--14424124
18
2.4
17
88
11
59
59
2
2
35
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343