Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  205  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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G
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200
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2.9
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3
27
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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19
19
1.91
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21
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1.96
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21
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408
22
20
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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28
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0
2
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0.81
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5
6.6
5
86
6
50
17
2
0
79
0.86
68050561--68050587
13
2.1
13
100
0
54
22
33
29
14
1.94
68057330--68057511
40
4.6
40
90
2
278
22
22
26
28
1.99
68066676--68066761
40
2.2
39
82
2
100
24
17
29
29
1.97
68067722--68067773
26
2.0
26
96
0
95
40
9
11
38
1.74
68075601--68075640
16
2.5
16
100
0
80
5
32
45
17
1.70
68076190--68076262
34
2.1
34
90
5
112
26
23
26
24
2.00
68076209--68076287
34
2.3
34
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8
90
22
26
27
22
1.99
68077985--68078161
39
4.5
39
95
0
309
27
3
22
45
1.70
68078014--68078080
17
3.7
17
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25
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28
1
23
46
1.61
68084518--68084569
28
2.0
26
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44
2
0
54
1.11
68084952--68085013
30
2.0
33
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1
0
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1.10
68084952--68085017
33
2.0
33
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48
1
0
50
1.10
68085139--68085184
23
1.9
25
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41
0
8
50
1.33
68085811--68085859
24
2.0
24
100
0
98
24
22
8
44
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68109811--68109949
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2.0
69
98
0
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28
32
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26
1.93
68116810--68116851
18
2.3
18
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0
57
42
4
47
4
1.45
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24
2.0
24
87
8
69
36
0
8
55
1.31
68121994--68122026
11
2.7
13
86
13
52
45
0
6
48
1.27
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51
2.1
51
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0
192
31
13
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1.91
68122628--68122665
15
2.5
15
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0
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34
0
7
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1.28
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29
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0
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1.91
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12
100
0
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15
7
1.74
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21
2.3
21
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0
78
18
29
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1.93
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3.8
21
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12
74
28
28
26
16
1.97
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4
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72
0
27
0
0.85
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7
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33
0
0
66
0.92
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21
3.9
21
79
3
76
20
21
21
35
1.96
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22
2.4
22
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15
1
29
52
1.54
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10.1
47
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0
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31
9
30
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1.89
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37
2.1
37
90
0
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1.98
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21
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0
62
29
27
27
15
1.96
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67
2.0
67
98
0
257
35
0
30
34
1.58
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9
6.6
9
77
15
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39
0
0
60
0.97
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32
2.9
31
75
13
94
35
0
0
64
0.94
68146686--68146755
20
3.4
21
70
21
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28
1
4
65
1.20
68147646--68147718
36
2.0
36
97
0
137
24
28
8
38
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68165261--68165361
26
3.9
26
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0
175
32
5
24
36
1.80
68171074--68171174
26
3.9
26
97
0
175
32
5
24
36
1.80
68174650--68174792
15
9.5
15
79
17
154
55
19
6
17
1.64
68174646--68174793
16
9.7
16
75
19
131
56
19
7
16
1.64
68175210--68175282
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2.1
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10
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16
0
34
49
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2
0.86
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24
2.3
25
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3
71
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5
8
1
0.84
68179556--68179612
25
2.3
24
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1
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2.8
12
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4
50
85
0
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2
0.71
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145
12.3
145
96
0
3244
31
17
17
33
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343