Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  193  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64018205--64018234
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19
26
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
49
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25
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2.8
45
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3
162
29
24
19
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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1.35
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19
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20
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12
76
10
51
60
0
4
35
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64181656--64182120
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10.6
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2
4
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1.30
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1.43
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31
1.30
64200720--64200818
39
2.6
37
75
15
94
55
2
9
33
1.43
64200944--64200977
13
2.7
13
86
4
52
58
0
5
35
1.22
64200944--64200980
12
3.0
12
84
7
56
59
0
5
35
1.20
64200936--64201003
25
2.8
24
74
10
59
61
0
4
33
1.16
64200940--64201004
12
5.3
12
76
10
51
60
0
4
35
1.18
64202576--64202613
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
64205969--64206055
43
2.0
43
100
0
174
45
17
9
27
1.78
64205980--64206065
43
2.1
39
85
10
111
48
18
5
26
1.70
64206916--64206987
37
1.9
37
88
5
110
30
16
12
40
1.86
64207472--64207496
12
2.1
12
100
0
50
56
0
0
44
0.99
64207972--64207996
10
2.5
10
100
0
50
92
0
8
0
0.40
64209032--64209083
25
2.1
25
100
0
104
28
11
36
23
1.90
64209861--64209898
16
2.4
16
86
4
51
68
5
0
26
1.11
64210162--64210227
21
3.2
20
76
17
64
59
3
4
33
1.33
64210171--64210283
10
10.6
10
68
24
63
56
0
6
36
1.30
64210212--64210281
25
2.8
25
81
12
83
55
0
5
38
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64210884--64210926
17
2.5
17
92
0
68
16
46
27
9
1.77
64213252--64213349
27
3.5
28
88
2
126
26
13
27
32
1.93
64213280--64213363
27
3.0
27
87
5
96
29
11
25
33
1.91
64215387--64216205
44
18.6
44
84
1
969
30
26
13
29
1.94
64226738--64226775
16
2.4
16
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4
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68
5
0
26
1.11
64227038--64227106
21
3.3
20
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18
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2
5
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1.36
64227047--64227157
10
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10
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25
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0
6
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1.31
64227114--64227166
20
2.8
19
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1
1
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64230472--64230601
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2
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16
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2.0
49
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7
123
33
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10
42
1.80
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30
2.1
31
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11
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50
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31
2.4
29
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13
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46
13
8
31
1.73
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15
2.6
15
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8
53
0
0
20
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43
2.0
43
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0
136
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3.1
38
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15
15
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36
1.89
64255207--64255277
35
2.0
35
97
0
133
29
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38
1.86
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18
2.1
19
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5
51
31
7
7
52
1.59
64262734--64262781
24
2.0
24
95
0
87
35
25
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25
1.94
64265934--64266104
43
4.0
43
74
11
145
26
14
25
32
1.95
64266764--64266811
23
2.1
24
84
7
64
31
2
27
39
1.68
64269779--64270003
40
5.7
40
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1
312
28
27
21
22
1.99
64272710--64272743
16
2.1
17
88
5
52
14
0
8
76
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64274506--64274540
17
2.0
18
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5
54
20
17
40
22
1.92
64275285--64275320
17
2.1
17
89
5
54
11
22
44
22
1.84
64280351--64280388
20
1.9
20
88
0
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18
1.89
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18
1.9
18
88
11
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25
0
0
74
0.82
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2.1
131
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4
311
25
18
18
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1.94
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130
2.7
130
85
4
447
26
18
18
35
1.94
64290953--64291240
130
2.2
133
91
1
474
25
18
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0
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1.32
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2.0
21
86
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59
52
16
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21
1.72
64311234--64311411
27
6.6
27
83
3
178
29
27
15
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343