Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  222  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73320399--73320463
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1
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1
15
0
82
0.73
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2.2
31
82
10
77
1
16
0
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0.75
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2.2
12
100
0
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23
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22
2.2
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5
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1.9
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18
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20
25
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19
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28
20
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26
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0
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2.0
25
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2.1
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2.7
14
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4
51
51
28
0
20
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
20
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137
2.0
137
86
2
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23
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2.9
167
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2
667
32
14
18
34
1.91
73347922--73348368
84
5.3
83
74
3
358
32
14
18
34
1.91
73351375--73351419
20
2.4
18
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10
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51
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13
26
1.70
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31
1.9
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86
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80
44
6
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2.5
20
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12
68
34
0
10
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73358023--73358077
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2.9
19
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69
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0
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54
1.32
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2.0
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18
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20
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16
2.8
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77
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61
6
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1.22
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2.0
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2.0
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100
0
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1.9
18
100
0
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22
11
20
45
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18
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0
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2.1
28
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0
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10
22
36
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
9
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1.45
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120
2.0
120
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11
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2.1
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17
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1.80
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13
2.3
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100
0
60
40
16
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1.75
73456152--73456231
24
3.2
24
67
19
63
48
3
16
31
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73456986--73457083
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0
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22
24
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1.99
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2.1
30
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0
7
22
1.11
73502276--73502315
14
2.7
15
80
7
55
32
2
0
65
1.06
73504351--73504433
22
3.5
24
75
17
68
53
3
3
39
1.36
73504598--73504645
3
15.7
3
78
4
51
58
0
6
35
1.23
73504744--73504768
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
73504540--73504781
123
2.0
122
84
8
321
57
5
5
31
1.45
73505250--73505282
11
3.0
11
91
8
50
45
0
54
0
0.99
73505432--73505469
11
3.3
12
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7
62
78
0
21
0
0.74
73506722--73506760
10
3.8
10
86
3
51
58
0
0
41
0.98
73509275--73509300
12
2.2
12
100
0
52
57
19
7
15
1.62
73509511--73509540
14
2.1
14
100
0
60
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40
6
6
1.56
73515535--73515658
61
2.0
60
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10
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13
8
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1.75
73537467--73537542
38
2.0
38
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0
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28
21
5
44
1.73
73539148--73539197
24
2.1
24
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7
57
36
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10
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1.76
73539854--73539935
38
2.2
38
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0
146
26
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9
51
1.70
73548815--73548892
37
2.1
38
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4
113
30
10
12
46
1.75
73549989--73550042
28
2.0
27
85
3
72
14
24
31
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73550621--73550723
51
1.9
53
90
7
165
48
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6
37
1.56
73551526--73551584
31
1.9
31
85
0
82
38
11
11
37
1.79
73556693--73556947
55
4.8
54
77
9
233
35
18
25
21
1.95
73556703--73556900
108
1.8
109
86
4
292
34
17
25
22
1.96
73557139--73557169
16
1.9
16
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0
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41
0
22
35
1.54
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31
2.5
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9
110
48
11
1
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1.47
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5
6.0
5
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0
0
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1
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1.45
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36
1.76
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2.8
35
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8
103
42
18
9
30
1.81
73570683--73570727
20
2.3
21
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13
2
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1.19
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6
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6
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14
50
21
1
0
76
0.87
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33
2.0
33
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0
123
21
21
19
37
1.94
73580962--73580995
10
3.4
10
95
0
59
41
8
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44
1.60
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0
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51
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1.39
73585670--73585750
41
2.0
41
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0
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1.86
73586303--73586395
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2.0
46
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0
177
34
12
7
45
1.71
73588203--73588257
22
2.5
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21
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54
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12
16
1.71
73594792--73594828
12
3.0
13
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29
40
18
10
1.85
73596354--73596387
16
2.1
16
100
0
68
76
5
0
17
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73599365--73599431
31
2.2
31
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0
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10
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73604008--73604058
26
2.1
25
85
10
70
64
7
5
21
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73604551--73604597
22
2.2
21
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3
58
36
21
8
34
1.84
73604570--73604620
19
2.9
16
78
18
57
35
15
11
37
1.84
73604568--73604609
19
2.1
21
91
8
70
35
16
9
38
1.81
73612938--73612998
21
3.0
21
72
13
56
52
0
6
40
1.27
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17
2.2
18
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26
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1.72
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9
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18
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73614753--73614827
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2.0
30
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27
18
1.85
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14
2.3
14
94
0
55
62
6
3
28
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343