Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  63  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20365871--20367652
88
20.3
87
84
1
1999
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20
22
22
1.97
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22
23
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3.1
44
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12
111
32
22
24
20
1.98
20367522--20367777
133
1.9
132
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3
408
33
23
22
20
1.97
20367654--20368263
88
6.9
88
85
1
733
32
22
23
21
1.98
20368622--20368653
5
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5
100
0
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0
0
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7
0
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1.26
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28
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21
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7
1
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1.31
20369237--20369282
15
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6
0
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1.15
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31
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26
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26
2.0
26
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2.0
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0
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18
29
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20387597--20388465
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2.5
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2
1120
27
24
18
29
1.98
20397001--20397047
19
2.5
20
86
6
62
44
8
19
27
1.79
20401119--20401518
197
2.0
199
83
6
495
56
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11
100
0
54
44
0
0
55
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20418057--20418126
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2.0
35
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0
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11
14
37
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20424885--20424925
9
4.6
9
85
11
57
21
0
2
75
0.92
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14
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23
0
2
74
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22
2.3
24
84
9
67
25
0
1
72
0.95
20424885--20424936
8
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8
80
14
54
25
0
1
73
0.94
20432288--20432325
18
2.1
18
90
0
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42
0
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2
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2
100
0
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50
0
50
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1.00
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1.13
20449972--20450056
44
1.9
44
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4
109
31
22
23
22
1.98
20450944--20450989
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0
0
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28
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19
30
1.98
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42
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55
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0
27
1.42
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10
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51
31
0
0
68
0.90
20488265--20488303
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19
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33
0
0
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20
2.6
21
80
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39
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1
56
1.21
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2.0
94
98
0
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8
22
25
1.81
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7
3.6
7
100
0
50
0
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12
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15
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24
16
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20513856--20514402
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6.5
84
97
0
1031
23
24
16
35
1.95
20513766--20514402
168
3.7
168
94
2
1051
22
24
16
36
1.94
20513766--20514402
252
2.5
252
93
2
1060
22
24
16
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20518253--20518291
18
2.2
17
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13
53
33
0
20
46
1.51
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23
4.3
23
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2
162
20
21
26
31
1.98
20518519--20518607
45
2.0
45
95
0
160
19
22
26
31
1.97
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110
2.0
110
99
0
437
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11
16
36
1.85
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7
3.6
7
100
0
50
48
40
0
12
1.40
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18
2.0
18
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5
63
11
28
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11
1.74
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23
2.0
22
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11
11
38
1.77
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17
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5
27
1.48
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15
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61
0
0
38
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19
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0
0
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0.99
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1
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1.20
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4
0
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1.19
20546691--20546872
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19
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19
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2
1
62
1.20
20546766--20546876
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0
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1.17
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12
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57
5
0
36
1.21
20570304--20570336
12
2.8
12
86
4
50
57
3
0
39
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20569981--20571075
136
7.8
137
83
11
1231
59
5
4
30
1.38
20569981--20571075
282
3.9
283
86
8
1338
59
5
4
30
1.38
20570903--20570937
3
11.7
3
93
0
61
62
0
2
34
1.10
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21
2.0
21
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8
52
56
11
2
29
1.46
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0
1
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1.01
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2.2
78
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2
239
36
18
16
27
1.93
20575590--20575857
142
1.9
141
88
0
410
30
22
19
27
1.98
20592987--20593099
30
3.9
30
86
7
153
22
35
0
42
1.54
20593029--20593078
16
3.2
16
66
11
50
16
34
0
50
1.45
20593477--20593551
37
2.0
39
81
5
91
44
8
0
48
1.32
20594918--20594966
15
3.1
15
78
18
55
69
0
12
18
1.19
20599885--20599919
7
5.0
7
100
0
70
28
0
28
42
1.56
20609932--20609999
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20
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23
2
2
70
1.15
20611278--20611358
40
2.0
40
97
0
153
40
17
6
35
1.74
20612506--20612747
42
5.7
42
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3
236
18
22
15
44
1.86
20612565--20612713
21
7.0
21
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4
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17
22
15
44
1.86
20612567--20612747
85
2.1
84
80
4
202
18
22
14
44
1.86
20612567--20612742
21
8.3
21
78
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93
17
22
15
44
1.86
20615982--20616030
26
2.0
24
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8
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30
0
6
63
1.19
20618745--20619721
487
2.0
487
98
0
1909
35
18
8
37
1.81
20619867--20619975
46
2.4
45
75
1
110
20
24
13
41
1.89
20619987--20620137
46
3.3
46
93
1
241
19
24
13
42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20619914--20620058
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1.9
76
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0
245
19
24
13
42
1.88
20620108--20620231
45
2.8
45
91
0
194
21
25
17
35
1.95
20619990--20620251
46
5.8
45
80
10
212
19
24
17
39
1.92
20621890--20621958
34
2.0
34
100
0
138
8
23
14
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1.68
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25
2.1
25
96
0
95
28
26
3
40
1.74
20634930--20634958
3
10.0
3
92
7
51
31
0
0
68
0.89
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13
2.7
13
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4
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76
5
14
2
1.09
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51
2.2
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150
17
18
19
43
1.88
20636312--20636393
18
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0
101
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18
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36
3.1
36
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125
31
15
16
36
1.90
20636330--20636421
18
5.1
18
81
5
114
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15
15
35
1.89
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54
2.0
54
83
3
135
31
15
16
35
1.91
20636427--20636483
18
3.2
18
82
9
71
35
5
19
40
1.74
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20
2.5
20
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50
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12
26
1.74
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11.9
46
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39
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23
22
1.90
20653219--20653773
138
4.1
138
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40
14
23
22
1.90
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22
2.0
22
83
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23
2
4
69
1.17
20659419--20659528
29
3.9
29
78
8
118
28
30
15
26
1.96
20661035--20661065
16
1.9
16
93
0
53
54
12
19
12
1.70
20661290--20661393
29
3.6
28
79
2
100
27
12
30
28
1.93
20661303--20661413
57
1.9
58
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1
152
27
14
30
27
1.95
20665712--20665810
29
3.4
29
84
1
119
24
18
30
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20675077--20675112
3
12.0
3
93
0
63
30
0
36
33
1.58
20680506--20680556
27
1.9
26
88
11
77
45
1
0
52
1.12
20680485--20680605
44
2.7
44
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149
45
3
0
51
1.17
20686407--20686442
5
7.2
5
100
0
72
41
0
0
58
0.98
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2.3
15
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0
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0
0
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1.00
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24
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1.19
20686536--20686569
17
1.9
18
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0
20
0
0.73
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23
0
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194
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20
28
28
1.98
20691434--20691605
93
1.8
93
92
0
290
21
20
29
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343