Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  41  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13505535--13506382
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44
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20
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132
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0
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11.5
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3.2
41
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22
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13507540--13507774
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2.7
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28
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22
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13509641--13509710
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9
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3
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0.83
13509643--13509710
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1
4
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0.84
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2.6
17
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11
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0
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1.25
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2.6
18
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2.2
24
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16
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0
0
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0
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2.0
20
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56
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2
33
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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3
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13532706--13532753
21
2.2
22
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62
72
2
2
22
1.05
13533521--13533560
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8
0
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85
0.75
13533528--13533565
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0
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13
0
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44
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2.3
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0
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153
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13546586--13546650
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2.3
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29
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23
0
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2.9
19
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10
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21
23
0
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13553585--13553642
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102
20
24
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2.0
43
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2.1
15
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37
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0
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1.9
17
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12
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0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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39
0
0
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2.1
22
100
0
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20
18
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1.97
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1.9
138
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20
19
30
1.97
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5
270
30
20
19
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1.97
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37
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20
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1.99
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2.2
141
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1.98
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0
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28
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1.73
13623151--13623188
14
2.9
13
81
11
51
57
10
13
18
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13631262--13631491
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22
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2.1
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21
14
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26
0
68
1.08
13659939--13660010
3
25.3
3
74
16
64
4
26
0
69
1.06
13659920--13660012
17
5.9
16
74
13
77
4
26
0
68
1.08
13659917--13660006
34
2.6
34
81
6
85
4
26
0
68
1.08
13664077--13664227
40
3.8
39
86
4
196
23
24
29
23
1.99
13672137--13672327
40
4.8
40
90
1
278
24
24
28
23
2.00
13674315--13674373
25
2.4
25
86
11
77
37
23
22
16
1.94
13681233--13681302
21
3.5
20
80
17
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67
2
4
25
1.23
13681236--13681311
21
3.7
20
77
16
59
69
2
3
23
1.18
13681405--13681457
27
2.0
27
89
7
83
60
0
1
37
1.08
13681405--13681469
26
2.5
26
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60
1
1
36
1.16
13685842--13685878
16
2.3
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0
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2
27
1.68
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0
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1.93
13690385--13690440
16
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28
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19
2.1
19
95
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28
5
7
58
1.47
13704733--13704787
23
2.4
23
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0
92
34
7
38
20
1.80
13706861--13706908
26
1.9
24
91
8
78
64
4
0
31
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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4
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6
0
18
1.00
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26
2.6
25
80
12
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69
4
0
25
1.08
13706879--13706937
21
2.8
21
78
12
59
69
6
0
23
1.12
13706984--13707016
15
2.1
16
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11
50
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0
0
30
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2.0
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0
0
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1.54
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1.54
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20
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1.51
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25
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0
100
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1.84
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2.1
127
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19
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0
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0
0
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2.1
39
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30
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180
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28
21
28
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18
2.0
17
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52
37
17
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40
1.73
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16
2.0
16
100
0
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31
0
12
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2.1
12
100
0
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16
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16
1.58
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27
2.0
27
96
0
99
22
24
20
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13753679--13753819
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5.2
27
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0
192
31
9
19
39
1.83
13753653--13753833
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2.2
81
81
0
209
33
8
19
38
1.82
13753679--13753819
54
2.6
54
91
0
219
31
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19
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1.83
13753822--13753898
27
2.9
27
90
0
118
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7
20
27
1.79
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10
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10
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0
20
20
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46
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0
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21
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51
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33
1.58
13792975--13793205
48
4.9
48
75
10
208
29
23
19
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343