Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  221  of  343  ( 41150 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73035745--73035852
51
2.1
51
87
0
153
19
25
31
24
1.98
73037629--73037848
47
4.7
48
76
6
177
26
19
30
23
1.98
73040536--73040708
46
3.8
45
76
14
165
22
20
27
30
1.98
73040533--73040703
93
1.8
93
89
2
272
22
20
28
29
1.98
73047640--73047815
46
3.8
46
78
12
207
22
21
27
28
1.99
73047637--73047807
93
1.8
93
94
0
306
22
21
28
28
1.99
73054835--73054950
47
2.5
46
87
8
164
30
21
27
20
1.98
73054927--73055026
47
2.2
46
80
8
105
27
15
29
29
1.96
73056195--73056233
21
1.9
21
89
5
62
10
33
30
25
1.89
73065602--73065647
22
2.1
22
84
8
58
43
4
4
47
1.42
73067528--73067616
29
3.3
29
68
20
84
41
13
2
42
1.56
73070706--73070828
25
5.0
25
77
7
101
23
23
20
32
1.98
73073557--73073606
24
2.1
24
96
0
91
36
4
20
40
1.71
73073557--73073595
14
3.1
14
72
27
50
35
5
20
38
1.75
73075122--73075193
29
2.4
30
77
11
76
40
20
1
37
1.62
73075728--73075769
19
2.2
20
86
4
59
4
11
7
76
1.15
73075796--73075820
11
2.3
11
100
0
50
92
8
0
0
0.40
73088651--73089429
75
10.1
75
85
6
918
32
16
17
33
1.93
73089777--73089849
29
2.4
31
80
11
89
39
20
1
38
1.61
73090749--73090776
12
2.3
12
100
0
56
25
39
7
28
1.82
73091197--73091232
18
1.9
19
88
5
56
38
0
2
58
1.13
73092232--73092285
18
3.3
18
66
28
57
22
50
7
20
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73092222--73092320
30
3.3
30
95
0
171
25
50
6
18
1.69
73092789--73092834
25
1.9
24
91
8
76
34
2
0
63
1.07
73092872--73092991
25
4.8
25
73
11
93
30
7
5
57
1.48
73093057--73093112
25
2.3
24
79
14
62
37
16
3
42
1.65
73093806--73094085
141
2.0
141
95
0
506
33
18
15
32
1.92
73097465--73097527
31
2.0
31
100
0
126
46
15
3
34
1.62
73100170--73100317
72
2.0
74
96
3
273
35
10
20
33
1.87
73101119--73101172
27
2.0
27
96
0
99
25
0
16
57
1.40
73105554--73105583
6
5.0
6
91
0
51
50
13
16
20
1.78
73107313--73107412
27
3.7
27
74
5
85
21
21
20
38
1.94
73108161--73108205
24
2.0
23
83
16
58
42
0
22
35
1.54
73128957--73129027
34
2.1
34
100
0
142
25
5
22
46
1.73
73131382--73131418
16
2.3
16
100
0
74
48
0
10
40
1.38
73136408--73136446
5
7.8
5
94
0
69
64
0
35
0
0.94
73138920--73138944
9
2.8
9
100
0
50
8
36
0
56
1.29
73139337--73139405
29
2.3
30
85
5
86
50
14
13
21
1.76
73144009--73144072
33
1.9
32
81
12
76
46
3
1
48
1.27
73144095--73144136
13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99
73144099--73144135
16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
73144157--73144223
34
2.0
32
85
5
89
50
2
1
44
1.26
73144883--73144918
5
6.8
5
90
9
54
0
44
0
55
0.99
73144883--73144918
11
3.4
10
92
7
54
0
44
0
55
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73144883--73144924
16
2.6
16
85
11
59
0
47
0
52
1.00
73152617--73152654
3
12.7
3
100
0
76
0
0
31
68
0.90
73155922--73155968
23
2.0
23
100
0
94
38
21
8
31
1.83
73156007--73156045
15
2.6
15
95
0
69
33
25
0
41
1.56
73166235--73166365
27
4.9
27
88
3
183
28
19
9
43
1.81
73166343--73166596
27
9.4
27
77
5
228
38
21
9
30
1.84
73166235--73166390
81
1.9
81
83
5
199
30
18
8
41
1.81
73166343--73166661
54
5.9
54
76
5
234
39
20
9
30
1.84
73166222--73166406
81
2.3
81
75
3
194
32
20
9
37
1.84
73166357--73166589
81
2.9
80
87
3
315
40
21
9
29
1.83
73166316--73166661
27
12.8
26
73
10
128
39
19
9
32
1.83
73166698--73166770
27
2.7
27
79
12
78
34
20
21
23
1.97
73167576--73167723
26
5.8
26
94
2
257
25
25
23
25
2.00
73167576--73167723
51
2.9
51
95
2
262
25
25
23
25
2.00
73167868--73167959
42
2.2
42
86
0
121
30
15
21
32
1.94
73167983--73168061
31
2.5
31
95
0
140
30
18
24
26
1.98
73175037--73175144
26
4.2
26
95
0
198
35
25
7
32
1.84
73177995--73178045
26
2.0
26
100
0
102
23
27
5
43
1.77
73178382--73178550
46
3.7
45
77
6
153
15
21
14
47
1.81
73178561--73178685
45
2.8
45
81
2
135
26
21
14
37
1.92
73183343--73183490
46
3.2
46
90
0
217
33
6
10
49
1.62
73186665--73186698
16
2.2
16
89
5
52
67
0
5
26
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73187510--73187588
24
3.4
24
63
10
65
48
8
16
26
1.75
73187496--73187658
45
3.6
45
90
2
231
50
9
17
23
1.74
73188418--73188464
18
2.4
21
75
13
55
48
0
6
44
1.28
73189936--73189960
12
2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
73189995--73190107
47
2.4
47
92
1
181
15
20
23
40
1.91
73190238--73190401
18
8.7
18
69
11
87
35
9
13
41
1.77
73190315--73190397
36
2.3
36
85
0
103
39
8
12
39
1.73
73193077--73193215
69
2.0
69
98
0
269
30
20
13
35
1.91
73196601--73196643
17
2.5
17
92
0
68
16
16
16
51
1.77
73197543--73197587
22
2.0
22
95
0
81
51
17
20
11
1.75
73200337--73200386
23
2.2
23
96
3
93
46
4
28
22
1.70
73200441--73200483
3
14.0
3
86
13
61
67
2
0
30
1.03
73204997--73205036
21
2.0
21
90
5
64
17
20
40
22
1.92
73205023--73205056
17
2.0
17
100
0
68
11
29
35
23
1.90
73205399--73205455
9
5.8
10
76
15
57
36
8
19
35
1.83
73205398--73205472
20
3.8
20
91
6
111
37
9
18
34
1.83
73205417--73205472
11
5.5
11
71
16
57
37
10
19
32
1.86
73205522--73205619
26
3.8
26
95
1
171
27
21
22
28
1.99
73207569--73207654
40
2.2
40
84
0
109
33
11
16
38
1.85
73210483--73210520
16
2.4
16
86
4
51
36
21
0
42
1.53
73211636--73211930
147
2.0
147
98
0
572
36
14
8
40
1.77
73214543--73214640
19
5.2
19
90
7
155
35
15
10
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73214543--73214640
36
2.6
37
88
9
144
35
15
10
38
1.81
73215031--73215202
46
3.7
46
75
13
172
31
30
18
19
1.96
73215037--73215209
93
1.9
93
91
0
283
30
30
19
19
1.96
73216501--73216539
18
2.0
20
85
9
55
20
20
0
58
1.39
73217155--73217221
33
2.0
33
100
0
134
41
14
14
28
1.86
73230597--73230621
11
2.3
11
100
0
50
84
0
0
16
0.63
73237574--73237604
16
1.9
16
93
0
53
54
16
12
16
1.71
73251685--73251722
17
2.3
17
86
4
51
68
2
0
28
1.03
73251867--73251904
18
2.2
18
86
9
53
68
2
7
21
1.28
73261259--73261315
22
2.6
21
78
15
62
21
0
29
49
1.50
73261272--73261316
22
2.0
22
91
4
72
22
0
31
46
1.52
73261414--73261503
19
4.8
19
80
10
96
34
1
22
42
1.61
73262022--73262403
126
3.0
126
90
0
602
36
17
17
28
1.93
73266529--73266553
7
3.6
7
100
0
50
60
12
0
28
1.32
73267543--73267677
48
2.8
47
85
4
164
53
6
8
31
1.56
73275973--73276019
3
15.7
3
86
0
67
61
2
2
34
1.20
73278859--73278930
36
2.0
36
86
0
99
30
13
19
36
1.91
73279448--73279605
78
2.0
79
90
1
246
39
8
6
46
1.59
73301164--73301243
13
5.5
15
71
22
57
32
3
0
63
1.12
73301196--73301234
21
1.9
20
89
5
60
33
5
0
61
1.18
73301160--73301240
29
2.8
28
80
9
99
33
3
0
62
1.12
73303225--73303414
96
2.0
96
98
0
371
23
13
25
37
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73313299--73313748
44
10.2
43
93
0
702
31
14
28
25
1.95
73315430--73315505
29
2.7
29
80
9
86
36
6
0
56
1.25
73315484--73315527
13
3.5
13
90
6
65
38
0
0
61
0.96
73318088--73318134
22
2.2
21
84
3
58
36
21
6
36
1.79
73318105--73318183
19
4.2
19
88
9
117
35
16
8
39
1.80
73318105--73318177
36
2.0
38
91
5
123
35
15
9
39
1.80
73318106--73318193
36
2.4
35
83
14
108
35
15
9
39
1.80
73318924--73319451
84
6.3
84
88
4
757
24
21
22
30
1.99
73318924--73319452
250
2.1
247
87
5
758
24
21
22
30
1.99
73319218--73319443
43
5.3
43
66
20
152
26
20
22
30
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343