Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  269  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
31
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28
29
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.3
17
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9
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24
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2.0
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2.9
207
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11
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276
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23
19
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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18
24
1.98
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5.5
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259
31
25
17
25
1.97
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101
2.6
101
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280
31
25
17
24
1.97
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3.4
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0
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1.97
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2.5
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13
1
80
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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13
100
0
54
22
7
0
70
1.12
89389176--89389379
23
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23
71
14
142
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5
20
39
1.75
89389390--89389457
23
3.0
22
72
20
59
30
8
23
36
1.85
89389879--89389925
19
2.5
19
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10
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21
2
4
72
1.12
89389846--89389937
31
3.0
30
76
19
100
27
4
2
66
1.22
89390063--89390091
11
2.7
11
94
5
51
48
0
10
41
1.37
89390538--89392284
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2.6
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2
2679
27
14
14
43
1.84
89392898--89392922
11
2.3
11
100
0
50
60
8
24
8
1.52
89396046--89396093
24
2.0
25
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4
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22
4
10
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1.44
89396247--89396289
22
1.9
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67
2
0
30
1.03
89397437--89397494
29
2.0
29
100
0
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3
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21
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28
1.98
89401238--89401409
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93
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0
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21
29
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1.99
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5
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0
0
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9
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80
0
0
19
0.71
89411486--89411533
19
2.5
19
80
13
53
8
14
14
62
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
89
98
0
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15
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21
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22
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0
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38
2.0
38
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21
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1.99
89427481--89427669
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4.4
43
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1
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13
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1.93
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2.0
30
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22
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1.84
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1.9
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0
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1.89
89436356--89436752
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1.98
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1.98
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21
27
1.99
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3
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1.40
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1.9
104
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0
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0
26
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0.84
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0
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2.3
25
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15
28
1.83
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6
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17
1.10
89452863--89452925
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3.6
16
78
16
63
74
6
1
17
1.10
89452858--89452925
24
2.9
22
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14
82
75
7
1
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1.10
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3.2
21
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18
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12
19
1.88
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28
2.0
28
100
0
114
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3
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45
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3.0
45
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20
29
26
1.99
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45
3.0
45
87
2
185
24
20
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89494250--89494423
86
2.0
89
81
8
205
25
19
27
27
1.99
89501690--89501724
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3.2
11
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0
52
51
0
20
28
1.47
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3.8
50
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228
26
18
24
30
1.98
89504501--89504684
101
1.8
101
90
2
298
26
18
25
30
1.98
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5.7
40
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269
24
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1.99
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80
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1.99
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42
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0
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26
1.9
27
84
4
68
29
19
23
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343