Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  246  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Indices
Period
Size
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Score
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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21
1.57
81588814--81588848
16
2.2
16
90
10
54
57
0
0
42
0.99
81588993--81589060
16
4.2
16
96
0
127
26
0
35
38
1.57
81589296--81589330
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
81589416--81589450
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
81589279--81589781
120
4.2
120
99
0
988
48
4
2
43
1.36
81589536--81589570
18
2.0
17
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5
52
54
0
0
45
0.99
81589656--81589690
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
81592843--81592898
21
2.6
21
91
2
85
41
25
12
21
1.88
81593970--81594105
33
4.3
33
79
12
176
60
13
17
8
1.58
81594036--81594090
18
3.2
18
71
23
64
60
14
14
10
1.60
81594884--81594922
21
2.0
21
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10
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5
0
48
1.24
81595066--81595105
21
2.0
20
85
5
53
37
0
2
60
1.11
81598437--81598514
39
2.0
39
100
0
156
38
7
17
35
1.79
81609515--81609549
13
2.5
14
90
9
54
48
0
0
51
1.00
81611054--81611204
75
2.0
75
100
0
302
25
15
17
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81615042--81615094
20
2.7
20
97
2
99
60
3
11
24
1.47
81617129--81617347
40
5.5
39
83
3
233
26
27
20
24
1.99
81617123--81617347
80
2.8
78
84
6
281
28
27
20
24
1.99
81622496--81622657
43
3.8
43
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1
191
26
9
22
41
1.85
81623975--81624020
24
1.9
24
90
0
74
17
32
19
30
1.95
81624151--81624201
26
2.0
26
84
0
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19
21
21
37
1.95
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26
2.3
26
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5
86
35
13
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1.74
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16
1.9
16
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0
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35
0
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1.40
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47
4.5
47
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208
22
15
30
30
1.95
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3.7
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14
158
22
19
27
31
1.98
81638779--81638949
93
1.8
93
87
2
254
22
19
28
30
1.98
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20
2.7
19
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14
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41
0
21
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1.54
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3.2
45
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16
147
30
19
27
21
1.98
81643080--81643392
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3.3
93
78
7
298
27
19
28
24
1.98
81643125--81643341
49
4.6
47
75
9
153
27
19
28
24
1.99
81646701--81646798
24
4.0
24
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1
160
35
4
38
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1.73
81646707--81646801
12
7.9
12
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59
34
5
37
22
1.77
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33
2.4
34
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8
90
27
17
24
30
1.97
81648418--81648508
32
2.8
31
73
15
76
25
19
26
28
1.99
81655019--81655074
29
1.9
29
88
0
85
19
25
8
46
1.79
81655046--81655155
46
2.4
46
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0
184
20
24
13
41
1.88
81655216--81655369
33
4.7
33
72
12
120
24
25
18
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81673938--81674113
40
4.4
40
92
2
284
23
22
27
26
1.99
81683130--81683163
17
2.0
17
94
0
59
35
20
17
26
1.95
81683217--81683472
47
5.5
46
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12
152
30
18
27
23
1.98
81683354--81683579
98
2.4
94
85
6
296
26
19
29
24
1.98
81683254--81683577
49
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48
75
9
215
29
18
28
24
1.98
81689230--81689337
26
4.2
26
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0
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32
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24
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1.81
81690763--81690815
26
2.0
26
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26
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2
171
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1.81
81696264--81696370
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2.1
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1
180
32
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1.81
81697856--81697908
26
2.0
25
82
13
63
35
24
13
26
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343