Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  175  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57918818--57918925
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57918818--57918925
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52
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2.1
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0
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60
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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108
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0
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0
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20
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251
22
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1.99
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28
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0
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30
19
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.97
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31
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25
1.97
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2.5
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1.95
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25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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28
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23
26
1.92
58161827--58161859
15
2.2
15
89
10
50
42
9
0
48
1.35
58165180--58165238
28
2.1
28
87
6
84
25
5
3
66
1.28
58167529--58167554
12
2.2
12
100
0
52
46
7
30
15
1.74
58170391--58171076
342
2.0
342
88
1
1007
24
20
15
38
1.92
58178462--58178522
23
2.6
22
72
10
59
36
18
21
24
1.95
58185105--58185141
17
2.2
17
95
0
65
10
43
27
18
1.83
58185983--58186250
47
5.7
48
77
11
209
22
28
19
29
1.98
58185987--58186250
140
1.9
140
81
4
327
22
28
19
29
1.98
58186927--58186956
12
2.5
12
94
0
51
23
30
30
16
1.96
58190305--58190425
43
2.9
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7
172
31
16
23
28
1.96
58196714--58196770
25
2.2
26
93
3
98
24
5
33
36
1.78
58197211--58197630
48
8.8
48
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3
326
25
18
30
25
1.98
58197211--58197630
96
4.4
96
81
2
405
25
18
30
25
1.98
58197201--58197630
144
3.0
143
79
4
395
25
18
30
25
1.98
58200481--58200603
42
2.9
43
75
13
128
28
16
23
31
1.96
58201351--58201397
22
2.1
22
81
14
53
31
2
21
44
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58205394--58205513
60
2.0
60
93
0
204
35
13
20
30
1.91
58212364--58212523
47
3.4
47
88
4
216
36
14
24
24
1.93
58212506--58212687
55
3.4
53
80
6
188
37
17
23
21
1.94
58218624--58218696
36
2.0
36
86
0
101
28
8
27
35
1.86
58222132--58222280
42
3.5
43
78
11
153
29
18
23
28
1.98
58230174--58230210
17
2.2
18
85
9
51
48
8
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27
1.74
58230658--58230955
151
2.0
151
91
2
483
32
8
22
36
1.85
58242157--58242314
39
4.1
39
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0
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25
21
1.99
58244115--58244214
28
3.6
28
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0
128
30
31
12
27
1.92
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3.6
41
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2
206
31
26
15
26
1.96
58245754--58245820
20
3.4
20
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4
118
14
35
32
16
1.90
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25
2.0
25
100
0
98
26
28
28
16
1.97
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25
2.2
25
89
0
81
24
31
27
16
1.96
58249923--58250020
44
2.3
42
82
8
126
24
18
23
33
1.97
58249924--58250039
44
2.7
44
81
7
114
24
18
25
32
1.97
58250536--58250560
13
1.9
13
100
0
50
16
4
16
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1.44
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4.5
45
77
10
187
29
17
30
23
1.97
58251257--58251435
94
1.9
94
85
8
251
29
18
29
22
1.98
58257590--58257638
23
2.1
23
88
0
71
18
22
0
59
1.38
58262841--58262892
23
2.3
22
75
21
54
9
23
1
65
1.32
58262850--58262904
12
4.6
12
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15
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12
23
0
63
1.29
58262886--58262923
17
2.2
18
85
4
51
10
23
2
63
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58272193--58272232
20
2.0
20
95
0
71
25
22
15
37
1.93
58281645--58281802
43
3.7
43
82
4
185
31
25
17
25
1.97
58283970--58284365
85
4.7
85
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419
33
13
10
42
1.78
58289080--58289145
6
11.0
6
70
0
51
57
15
4
22
1.56
58295283--58295482
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2.1
96
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0
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14
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1.91
58298149--58298323
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49
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6
217
30
24
17
26
1.97
58298141--58298328
100
1.9
100
94
0
331
30
24
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1.98
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2.0
27
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36
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17
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34
22
20
22
1.97
58301291--58301506
70
3.1
69
85
7
285
31
22
20
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343