Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  53  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17277394--17277464
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3.2
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20
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0
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1.25
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1.21
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32
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0
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1.21
17277428--17277488
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4.1
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0
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1.15
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1.24
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0
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0
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2.0
137
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2.0
57
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0
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64
0
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33
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2.0
23
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0
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2.4
26
81
5
74
36
19
22
22
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17325555--17325691
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1.9
73
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20
1.96
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1.9
38
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0
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19
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1.84
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9
2.8
9
100
0
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1.76
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19
2.1
19
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0
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61
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1.9
23
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9
9
40
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2.0
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19
14
33
1.91
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48
4.5
48
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1
240
26
16
29
27
1.97
17357472--17357689
96
2.3
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269
26
16
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1.97
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2.0
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14
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0
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0
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24
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49
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523
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1.87
17390257--17390482
95
2.4
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251
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26
22
1.95
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2.3
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41
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9
39
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2.2
17
90
0
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1.09
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18
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20
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27
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1
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2.1
34
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0
140
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50
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23
2.0
22
87
4
65
36
17
6
39
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17441058--17441185
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19
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10
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1.81
17441051--17441185
55
2.5
55
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215
35
14
10
39
1.81
17441058--17441185
36
3.5
36
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2
229
35
14
10
39
1.81
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1.9
20
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60
10
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2.2
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27
16
30
1.96
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10.3
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498
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23
17
31
1.97
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5.3
166
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698
26
24
17
31
1.97
17441578--17442014
78
5.3
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80
14
437
26
24
17
31
1.97
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2.2
131
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500
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2.0
25
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27
14
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53
1.60
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1.92
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25
17
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1.96
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2.5
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23
24
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1.95
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22
24
16
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1.94
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19
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21
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12
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248
36
15
11
37
1.83
17462824--17462853
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0
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21
21
28
1.99
17469863--17470009
79
1.9
79
85
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210
28
21
21
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17476923--17476975
24
2.3
23
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12
65
52
0
15
32
1.42
17477457--17477612
41
3.8
41
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235
28
20
22
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29
10
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12
1
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31
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7
35
1.83
17497941--17498054
11
10.5
11
82
1
122
0
3
33
62
1.18
17497884--17498056
22
7.8
22
75
10
138
3
4
31
60
1.34
17497946--17498054
33
3.3
33
90
1
166
0
3
34
60
1.21
17498017--17498064
22
2.2
22
92
0
78
4
8
25
62
1.41
17498834--17498875
22
1.9
22
85
9
59
2
7
33
57
1.39
17498834--17498867
11
3.1
11
86
0
50
0
8
35
55
1.31
17499107--17499131
11
2.3
11
100
0
50
16
0
0
84
0.63
17510641--17510785
49
2.9
50
82
3
184
27
24
20
26
1.99
17511593--17511653
30
2.0
30
87
0
86
32
22
4
39
1.76
17515941--17515981
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
17526988--17527025
20
1.9
20
88
0
58
42
0
15
42
1.47
17527764--17527811
21
2.3
20
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16
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54
0
8
37
1.31
17528221--17528276
25
2.3
24
87
3
76
58
1
0
39
1.08
17528216--17528273
24
2.4
23
83
8
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56
3
0
39
1.16
17528939--17529180
125
1.9
127
82
3
301
38
16
14
31
1.88
17529347--17529398
22
2.4
21
84
6
68
65
0
5
28
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17529353--17529413
31
2.0
31
84
12
81
62
0
8
29
1.24
17529417--17529488
24
3.1
23
75
15
76
59
0
12
27
1.33
17529465--17529524
15
3.8
16
72
14
54
66
1
8
23
1.28
17529582--17529622
18
2.2
19
86
8
57
65
2
2
29
1.18
17529689--17529748
15
4.2
15
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28
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63
0
8
28
1.23
17531170--17531222
25
2.1
26
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10
74
50
0
0
49
1.00
17535594--17535630
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2.0
19
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58
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10
0
18
1.16
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1.9
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0
2
57
1.12
17538448--17538507
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32
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86
26
5
1
66
1.21
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3
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3
67
10
70
28
7
2
60
1.38
17538580--17538631
14
3.6
14
82
5
59
36
3
1
57
1.28
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17
2.3
17
90
0
60
25
7
0
66
1.18
17538826--17538860
17
2.1
17
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0
52
25
0
8
65
1.21
17538839--17538896
26
2.3
26
77
19
68
31
5
5
58
1.42
17539012--17539071
13
4.4
14
72
16
54
18
10
3
68
1.32
17541585--17541644
25
2.4
25
97
0
111
36
0
20
43
1.52
17542292--17542464
46
3.8
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7
204
20
21
30
27
1.98
17545375--17545424
15
3.4
15
86
2
66
10
18
12
60
1.59
17547808--17547980
46
3.8
44
79
7
195
20
21
28
28
1.98
17560019--17560374
88
4.0
88
85
0
451
28
22
21
28
1.99
17560207--17560350
44
3.3
44
65
3
110
28
23
23
24
2.00
17560227--17560358
44
3.0
44
66
4
122
25
25
23
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17560318--17560449
68
1.9
68
89
3
203
27
21
22
28
1.99
17560230--17560530
156
1.9
156
91
0
485
26
23
23
26
2.00
17560386--17560987
88
6.8
88
88
0
846
28
24
20
26
1.99
17560412--17560990
44
13.2
43
63
12
158
28
25
19
26
1.99
17560999--17561613
44
13.6
44
69
14
286
30
17
22
29
1.97
17560976--17561236
140
1.9
140
86
1
371
29
20
21
27
1.98
17561247--17561515
137
2.0
137
89
4
413
32
18
18
30
1.95
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2.0
22
95
0
79
22
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1.92
17563206--17563404
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3
69
7
102
27
7
3
62
1.36
17563290--17563401
43
2.7
41
78
6
116
28
8
1
61
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343