Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  174  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57654745--57654883
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2.8
49
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2
188
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26
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25
1.98
57660179--57660248
29
2.5
28
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2
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25
17
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27
1.97
57660164--57660248
28
3.0
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3
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28
28
1.96
57661425--57661480
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29
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14
17
15
52
1.75
57665600--57665624
12
2.1
12
100
0
50
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8
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1.63
57668817--57668994
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4.1
42
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25
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1.97
57669020--57669136
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2.4
48
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137
25
29
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1.98
57684108--57684332
79
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21
27
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1.99
57684108--57684332
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5.7
40
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280
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10
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5
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57687614--57688122
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2.1
235
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32
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29
29
1.87
57688241--57688319
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2.1
37
90
0
122
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1.98
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4.7
46
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242
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2.4
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23
23
15
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1.94
57689894--57690111
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2.4
93
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20
22
14
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2.0
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95
0
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57690092--57690123
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2.0
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100
0
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25
25
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57695141--57695188
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70
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57701793--57701878
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2.0
42
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129
23
16
24
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
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0
0
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1
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13
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9
0
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1.29
57706925--57706969
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31
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1.33
57714497--57714532
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2.0
18
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90
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56
0
0
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2
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1.10
57717247--57717304
19
2.8
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1
22
1.01
57717247--57717306
20
2.9
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25
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10
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57721067--57721111
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51
55
11
11
22
1.66
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218
2.0
218
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838
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18
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20
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27
1.9
27
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23
23
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2.0
15
93
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26
23
23
26
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93
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20
1.97
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2.2
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103
35
0
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62
1.09
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2.0
19
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2
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26
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8
64
64
0
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25
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2.0
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2.0
26
96
0
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1.9
21
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0
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22
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1.42
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7
100
0
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29
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16
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2.1
17
88
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1.40
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19
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18
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28
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22
1.99
57790852--57791024
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1.72
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26
2.0
26
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0
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36
19
5
38
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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21
22
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18
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26
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0
50
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0
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50
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13
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0
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53
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0
0
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1.00
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15
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0
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0
0
47
1.00
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29
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1
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22
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24
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1.34
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21
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57856889--57857505
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28
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1.83
57857515--57857710
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2
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19
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1.95
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81
2.3
81
88
0
264
36
18
19
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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26
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21
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1.94
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1.98
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27
2.8
27
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1.82
57858493--57858670
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20
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0
0
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0
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1
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0
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0
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0
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10
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0
0
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1.00
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16
2.0
16
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6
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48
0
12
38
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57878225--57878707
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44
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0
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28
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42
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26
1.97
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52
5
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23
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137
2.0
137
98
0
534
31
24
19
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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