Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  74  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24234802--24234858
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30
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1.11
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1
0
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1.09
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22
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2.5
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0
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0
5
36
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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2.0
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2.0
23
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20
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2
0
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21
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1.00
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52
16
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22
3.8
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27
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38
2.3
38
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0
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13
56
2
27
1.49
24302298--24302385
19
4.6
20
70
9
76
13
56
2
27
1.49
24302821--24303002
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2.0
92
91
2
294
23
21
9
45
1.81
24303009--24303065
29
2.0
28
93
3
96
17
19
22
40
1.91
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2.4
23
88
5
80
41
3
0
55
1.17
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20
2.0
20
85
5
53
52
5
0
42
1.23
24315538--24315709
93
1.8
93
93
2
301
28
30
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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29
20
20
1.98
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2.6
21
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2
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33
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1.89
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1.71
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5.5
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1
225
8
18
15
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1.65
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18
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1.59
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14
90
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15
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37
1.79
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47
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2
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1.35
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2.8
22
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3
34
1.30
24331060--24331102
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2.0
23
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4
2
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2
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22
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5
6
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18
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2
36
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2
2
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17
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75
2.9
75
90
2
322
30
21
17
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24340376--24340466
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1.97
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30
2.0
30
90
0
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31
24
8
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1.85
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4
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6
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1.47
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2.6
23
82
15
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4
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11
6.1
11
72
22
50
53
4
3
38
1.37
24349383--24349471
20
4.2
20
73
18
65
52
3
4
39
1.38
24349465--24349503
18
2.0
20
85
9
55
61
2
2
33
1.23
24350361--24350398
12
3.1
12
85
14
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10
13
0
76
1.02
24354971--24355154
40
4.6
40
82
6
196
23
20
27
28
1.99
24354971--24355151
80
2.3
81
83
9
221
23
20
27
27
1.99
24355052--24355201
40
3.8
38
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10
131
25
22
28
24
1.99
24362800--24362983
40
4.6
40
82
6
196
23
20
27
28
1.99
24362800--24362980
80
2.3
81
83
9
221
23
20
27
27
1.99
24370358--24370396
18
2.3
17
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17
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10
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1.61
24372179--24372218
13
3.0
13
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35
5
0
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1.19
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33
0
0
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0.92
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28
4.7
28
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3
156
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22
29
1.90
24381807--24381937
56
2.3
57
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203
35
12
22
29
1.90
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17
1.9
17
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5
50
73
0
0
26
0.83
24384032--24384067
11
3.2
11
88
7
54
75
0
0
25
0.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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73
0
0
26
0.83
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2.5
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13
132
24
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17
27
1.97
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47
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48
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7
221
22
29
19
28
1.98
24411805--24411972
46
3.6
45
78
7
176
21
29
21
27
1.99
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140
1.9
141
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2
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22
28
19
29
1.98
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2.5
58
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5
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27
24
17
30
1.97
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1.9
17
100
0
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21
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18
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0
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34
0
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0
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2.2
24
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3
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6
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1.9
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5
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2.5
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17
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22
2.2
22
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0
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4
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1.53
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29
0
0
70
0.87
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2.1
30
90
0
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29
1
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59
1.38
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2.1
74
97
0
286
56
9
12
21
1.64
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3.1
15
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8
0
44
1.33
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6
5.7
6
100
0
68
50
50
0
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24448536--24448585
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4
0
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40
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0
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6
27
40
1.79
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2.6
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140
30
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28
24
1.97
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1.8
93
93
2
299
28
27
21
22
1.99
24475010--24475182
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3.7
46
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11
201
28
26
21
23
1.99
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2.0
29
89
0
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1.8
92
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0
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28
20
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1.98
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28
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1.98
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135
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26
22
27
1.99
24498738--24498962
40
5.7
40
81
7
226
25
27
20
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343